Isocitrat epimeras
| Isocitrat epimeras- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| EG nr. | 5.1.2.6 | ||||||||
| CAS-nr. | 81210-68-6 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi klassificeras ett isocitrat-epimeras enligt följande: EC 5.1.2.6 . Detta nummer indikerar att det är ett isomeras , specifikt ett racemase eller epimeras som verkar på hydroxisyror och deras derivat, nämligen isocitrat . Isocitrat epimeras katalyserar specifikt den reversibla reaktionen:
- ( 1R ,2S ) -1-hydroxipropan-1,2,3-trikarboxylat ↔ (1S , 2S ) -1-hydroxipropan-1,2,3-trikarboxylat
vilket också kan beskrivas som
- D -treo-isocitrat ↔ D -erytro-isocitrat
Historia
Isocitrat epimeras isolerades ursprungligen från det svampcellsfria extraktet av Penicillium purpurogenum , där det upptäcktes på grund av överskottsackumulering av L -alloisocitric acid ( D -erythro-isocitrate) - en diastereomer av isocitrat som tidigare inte setts i naturen. För att ackumulera L -alloisocitronsyra som en fermenteringsprodukt behövde P. purpurogenum odlas på citrattillsatt näringsagar . Under denna jäsning fann man att jäsningsutbytet av L -alloisocitronsyra kunde "överstiga 70% utan att producera några andra stereoisomerer av isocitirinsyra eller andra metaboliter".
Detta enzym har inte studerats mycket sedan det först identifierades 1982, som ett resultat av detta finns det för närvarande ingen kristallstruktur eller aktiv platsbeskrivning för isocitrat epimeras. Andra isocitrat-enzymer, såsom isocitratlyas och isocitratdehydrogenas, har studerats närmare på grund av deras nyckelroller i glykolys och TCA -cykeln.
- ^ "BRENDA - Information om EC 5.1.2.6 - isocitrate epimerase" . www.brenda-enzymes.org . Hämtad 2021-10-22 .
- ^ "KEGG REACTION: R02318" . www.genome.jp . Hämtad 2021-10-22 .
- ^ a b c Hoshiko S, Kunimoto Y, Arima K, Beppu T (januari 1982). "Mekanism för L-Alloisocitric Acid Fermentation: Isocitrat-epimerasaktivitet i det cellfria extraktet av Penicillium purpurogenum" . Jordbruks- och biologisk kemi . 46 (1): 143–151. doi : 10.1080/00021369.1982.10865025 . ISSN 0002-1369 .
- ^ Beppu T, Abe S, Sakaguchi K (december 2004). "Ansamling av allo-isocitronsyra av en Penicillium-stam" . Journal of General and Applied Microbiology . 50 (6): 345–352. PMID 15965889 .
