Ipomovirus
|
|
| Ipomovirus | |
|---|---|
| Ipomovirus virion | |
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Pisuviricota |
| Klass: | Stelpaviricetes |
| Beställa: | Patatavirales |
| Familj: | Potyviridae |
| Släkte: | Ipomovirus |
Ipomovirus är ett släkte av positivsträngade RNA-virus i familjen Potyviridae . Medlemsvirus infekterar växter och överförs av vitflugor ( Bemisia tabaci) . Namnet på släktet kommer från Ipomoea – det generiska namnet på sötpotatis . Det finns sju arter i detta släkte.
Strukturera
Virus i släktet Ipomovirus är icke-hölje, med böjliga och filamentösa geometrier. Diametern är cirka 12–15 nm, och kan ha en mängd olika längder beroende på art (för enkelsegmenterade arter på cirka 650–900 nm, eller för dubbelsegmenterade arter 200–300 nm och 500–600 nm). Kapsiden har spiralsymmetri med en stigning på 3,4 nm. De inducerar karakteristiska inneslutningskroppar (nålhjul) i infekterade växtceller.
Genom
Genomet är antingen endelat eller tvådelat beroende på art. Medlemsvirus har linjärt, enkelsträngat RNA-genom med positiv polaritet omkring 10-11 kilobaser i längd. 3'-terminalen har en poly(A)-kanal och 5'-terminalen har ett genomkopplat protein (VPg).
Medlemsvirus kodar för en enda polypeptid med en förutsagd molekylvikt på 390 kilo Dalton (kDa) som klyvs till ~10 proteiner . I 5'–3' ordning är dessa proteiner
- Pl (ett serinproteas ) : 83 kDa
- HC (ett proteas): 51 kDa
- P3: 34 kDa
- 6K1: 5 kDa
- Cl ( helikas ): 71 kDa
- 6K2: 6 kDa
- VPg (det 5'-bindande proteinet): 20 kDa
- NIa-Pro (ett proteas): 27 kDa
- NIb ( RNA-beroende RNA-polymeras ): 57 kDa
- Kapsidprotein: 34 kDa
Det kan finnas viss variation i antalet proteiner beroende på art, till exempel saknar vissa ipomovirus HC och har en P1-tandem. Inosintrifosfatpyrofosfatas (känd som ITPase eller HAM1) är en atypisk proteindomän som identifieras i vissa ipomovirus.
Livscykel
Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Positivt strängat RNA-virustranskription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom tubulstyrd viral rörelse. Växter fungerar som naturlig värd. Viruset överförs via en vektor (vit fluga). Överföringsvägar är vektor och mekaniska.
Taxonomi
Släktet innehåller följande arter:
- Cassava brown streak virus
- Coccinia mottle virus
- Gurka ven gulnande virus
- Squash ven gulnande virus
- Sötpotatis milt fläckvirus
- Tomat milt fläckvirus
- Ugandiska cassava brown streak virus
Ugandiska cassava brown streak-virus var det första ipomoviruset som klonades och räddades med användning av ett plasmid-cDNA-vektorsystem.