HDAC6

HDAC6
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CPBHM, HD6, PPP1R90, JM21, histondeacetylas 6
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Histondeacetylas 6 är ett enzym som hos människor kodas av HDAC6 -genen . HDAC6 har dykt upp som en mycket lovande kandidat för att selektivt inhibera som en terapeutisk strategi för att bekämpa flera typer av cancer och neurodegenerativa störningar.

Fungera

Histoner spelar en avgörande roll i transkriptionsreglering, cellcykelprogression och utvecklingshändelser. Histonacetylering/deacetylering förändrar kromatinstrukturen och påverkar transkriptionen. Proteinet som kodas av denna gen tillhör klass II av histon-deacetylas/acuc/apha-familjen. Den innehåller en intern duplicering av två katalytiska domäner som verkar fungera oberoende av varandra. Detta protein har histon-deacetylasaktivitet och undertrycker transkription.

Det drar tillbaka cellens cilium , vilket är nödvändigt före mitos .

HDAC uppmuntrar cellmotilitet och katalyserar α-tubulin deacetylering . Som ett resultat uppmuntrar enzymet cancercellsmetastaser.

HDAC6 påverkar transkription och translation genom att reglera värmechockprotein 90 (Hsp90).

HDAC6 krävs vid bildningen av stressgranulproteiner (SG) och är avgörande för SG-bildning; farmakologisk hämning eller genetiskt avlägsnande av HDAC6 avskaffade SG-bildning.

HDAC6 binder med hög affinitet till ubiquitinerade proteiner.

HDAC6 är involverat i leptinkänslighet .

HDAC6 deacetylerar tyrosinresten T178 på TAK1 .

Klinisk relevans

Mutationer i denna gen har associerats med Alzheimers sjukdom .

Överuttryck av detta protein korrelerar med tumörbildning och cellöverlevnad. HDAC6 uppmuntrar också metastasering av cancerceller.

Eftersom HDAC6 är dysreglerad och/eller inblandad i flera cancerformer och neurodegenerativa störningar, har farmakologisk hämning av detta specifika enzym stor terapeutisk potential och kan också begränsa biverkningar associerade med pan-inhibitorer av flera HDAC-enzymer. Selektiv hämning av HDAC6 som en strategi för att behandla cancer är emellertid också föremål för debatt, eftersom vissa HDAC6-hämmare uppvisade antitumöraktivitet in vitro och in vivo endast när de administrerades i höga koncentrationer, vilket också gav effekter utanför målet. Resultaten tyder på att ytterligare studier behövs för att klargöra data om anti-cancereffekter av selektiva HDAC6-hämmare.

Interaktioner

HDAC6 har visats interagera med HDAC11 och zinkfinger och BTB-domäninnehållande protein 16 .

HDAC6 interagerar med SG ( Stress granule ) protein G3BP1 .

Se även

• Histon deacetylas

Vidare läsning

•    Pazin MJ, Kadonaga JT (maj 1997). "Vad är upp och ner med histondeacetylering och transkription?" . Cell . 89 (3): 325–328. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80211-1 . PMID 9150131 . S2CID 11488594 .
•    Wolffe AP (maj 1997). "Transkriptionskontroll. Syndigt förtryck" . Naturen . 387 (6628): 16–17. doi : 10.1038/387016a0 . PMID 9139815 . S2CID 29803420 .
•    Huynh KD, Fischle W, Verdin E, Bardwell VJ (juli 2000). "BCoR, en ny corepressor involverad i BCL-6-förtrycket" . Gener & Utveckling . 14 (14): 1810–1823. doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . PMC 316791 . PMID 10898795 .
•    Mahlknecht U, Schnittger S, Landgraf F, Schoch C, Ottmann OG, Hiddemann W, Hoelzer D (2001). "Tilldelning av den humana histondeacetylas 6-genen (HDAC6) till X-kromosom p11.23 genom in situ hybridisering". Cytogenetik och cellgenetik . 93 (1–2): 135–136. doi : 10.1159/000056967 . PMID 11474198 . S2CID 41821644 .
•   Kao HY, Lee CH, Komarov A, Han CC, Evans RM (januari 2002). "Isolering och karakterisering av HDAC10 från däggdjur, ett nytt histondeacetylas" . Journal of Biological Chemistry . 277 (1): 187–193. doi : 10.1074/jbc.M108931200 . PMID 11677242 .
•    Seigneurin-Berny D, Verdel A, Curtet S, Lemercier C, Garin J, Rousseaux S, Khochbin S (december 2001). "Identifiering av komponenter i det murina histondeacetylas 6-komplexet: koppling mellan acetylering och ubiquitination signalvägar" . Molekylär och cellulär biologi . 21 (23): 8035–8044. doi : 10.1128/MCB.21.23.8035-8044.2001 . PMC 99970 . PMID 11689694 .
•    Tong JJ, Liu J, Bertos NR, Yang XJ (mars 2002). "Identifiering av HDAC10, en ny klass II human histon deacetylas innehållande en leucinrik domän" . Nukleinsyraforskning . 30 (5): 1114–1123. doi : 10.1093/nar/30.5.1114 . PMC 101247 . PMID 11861901 .
•   Gao L, Cueto MA, Asselbergs F, Atadja P (juli 2002). "Kloning och funktionell karakterisering av HDAC11, en ny medlem av den mänskliga histondeacetylasfamiljen" . Journal of Biological Chemistry . 277 (28): 25748–25755. doi : 10.1074/jbc.M111871200 . PMID 11948178 .
•    Hubbert C, Guardiola A, Shao R, Kawaguchi Y, Ito A, Nixon A, et al. (maj 2002). "HDAC6 är ett mikrotubuli-associerat deacetylas". Naturen . 417 (6887): 455–458. Bibcode : 2002Natur.417..455H . doi : 10.1038/417455a . PMID 12024216 . S2CID 4373254 .
•    Kirsh O, Seeler JS, Pichler A, Gast A, Müller S, Miska E, et al. (juni 2002). "SUMO E3-ligas RanBP2 främjar modifiering av HDAC4-deacetylaset" . EMBO Journal . 21 (11): 2682–2691. doi : 10.1093/emboj/21.11.2682 . PMC 125385 . PMID 12032081 .
•    Hook SS, Orian A, Cowley SM, Eisenman RN (oktober 2002). "Histoneacetylas 6 binder polyubiquitin genom dess zinkfinger (PAZ-domän) och samrenar med deubiquitining enzymer" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (21): 13425–13430. Bibcode : 2002PNAS...9913425H . doi : 10.1073/pnas.172511699 . PMC 129689 . PMID 12354939 .
•    Westendorf JJ, Zaidi SK, Cascino JE, Kahler R, van Wijnen AJ, Lian JB, et al. (november 2002). "Runx2 (Cbfa1, AML-3) interagerar med histondeacetylas 6 och undertrycker p21(CIP1/WAF1)-promotom" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (22): 7982–7992. doi : 10.1128/MCB.22.22.7982-7992.2002 . PMC 134736 . PMID 12391164 .
•   North BJ, Marshall BL, Borra MT, Denu JM, Verdin E (februari 2003). "Den mänskliga Sir2-ortologen, SIRT2, är ett NAD+-beroende tubulin-deacetylas" . Molekylär cell . 11 (2): 437–444. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00038-8 . PMID 12620231 .
•   Voelter-Mahlknecht S, Mahlknecht U (juli 2003). "Kloning och strukturell karakterisering av den mänskliga histondeacetylas 6-genen". International Journal of Molecular Medicine . 12 (1): 87–93. doi : 10.3892/ijmm.12.1.87 . PMID 12792815 .
•   Brush MH, Guardiola A, Connor JH, Yao TP, Shenolikar S (februari 2004). "Deaktylashämmare stör cellulära komplex som innehåller proteinfosfataser och deacetylaser" . Journal of Biological Chemistry . 279 (9): 7685–7691. doi : 10.1074/jbc.M310997200 . PMID 14670976 .
•   Pandey UB, Batlevi Y, Baehrecke EH, Taylor JP (nov–dec 2007). "HDAC6 i skärningspunkten mellan autofagi, ubiquitin-proteasomsystemet och neurodegeneration" . Autofagi . 3 (6): 643–645. doi : 10.4161/auto.5050 . PMID 17912024 .
•    Pandey UB, Nie Z, Batlevi Y, McCray BA, Ritson GP, ​​Nedelsky NB, et al. (juni 2007). "HDAC6 räddar neurodegeneration och ger en viktig länk mellan autofagi och UPS". Naturen . 447 (7146): 859–863. Bibcode : 2007Natur.447..860P . doi : 10.1038/nature05853 . PMID 17568747 . S2CID 4365061 .

externa länkar

• HDAC6+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
• HDAC6 human genplacering i UCSC Genome Browser .
• HDAC6 mänskliga gendetaljer i UCSC Genome Browser .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .