Crinivirus

3'-terminal pseudoknot i SPCSV
3'-terminal pseudoknot i SPCSV
	Förutspådd sekundär struktur för 3'-terminal pseudoknot i SPCSV-
identifierare
Rfam	RF01091
Övriga uppgifter
RNA -typ	Cis-reg
Domän(er)	Crinivirus
PDB- strukturer	PDBe

Crinivirus
Virus klassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Kitrinoviricota
Klass:	Alsuviricetes
Beställa:	Martellivirales
Familj:	Closteroviridae
Släkte:	Crinivirus
Art
	Se text

Crinivirus , tidigare den infektiösa salladsvirusgruppen , är ett släkte av virus i familjen Closteroviridae . De är linjära, enkelsträngade positiva sens RNA-virus (och är därför grupp IV ). Det finns 14 arter i detta släkte. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar: gulfärgning och nekros, som särskilt påverkar floemet.

Exempel på arter vars hela genom har sekvenserats som för närvarande klassificeras i släktet inkluderar Sweet potato chlorotic stunt virus (SPCSV) och Salat infectious yellows virus (LIYV).

Genetik

Virusen i detta släkte har segmenterade, tvådelade genom som adderar upp till 7 500–19 500 nukleotider i längd. Deras genom kodar också för proteiner som inte ingår i virionpartiklarna samt strukturella proteiner. Universal Virus Database beskriver att deras genomsekvenser nära deras 3'-ändar kan bilda hårnålsslingor och tror också att deras 5'-ändar kan ha metylerade lock. Var och en av de virala RNA-molekylerna innehåller fyra hårnålsstrukturer och en pseudoknot i 3'UTR . Pseudoknoten är ovanlig genom att den innehåller en liten stamslingastruktur inuti slingan L1. I det besläktade släktet Closterovirus har dessa sekundära strukturer visat sig vara viktiga vid viral RNA-replikation.

Strukturera

Virus i släktet Crinivirus är icke-hölje, med tvådelade filamentösa geometrier. Diametern är runt 10-13 nm, med en längd på 700-900 nm. Genomerna är linjära och tvådelade, cirka 17,6 kb långa.

Släkte	Strukturera	Symmetri	Capsid	Genomiskt arrangemang	Genomisk segmentering
Crinivirus	Filamentös		Ej kuverterade	Linjär	Endelad, tvådelad eller tredelad

Livscykel

Viral replikation är cytoplasmatisk. Inträde i värdcellen uppnås genom penetration in i värdcellen. Replikation följer den positiva strängade RNA-virusreplikationsmodellen. Positivt strängat RNA-virustranskription är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom tubulstyrd viral rörelse. Växter fungerar som naturlig värd. Viruset överförs via en vektor (bemisia tabaci). Överföringsvägen är mekanisk.

Släkte	Värdinformation	Vävnadstropism	Inträdesuppgifter	Releaseinformation	Replikeringsplats	Monteringsplats	Överföring
Crinivirus	Växter	Ingen	Viral rörelse; mekanisk ympning	Viral rörelse	Cytoplasma	Cytoplasma	Mekanisk inokulering: insekter (vitfluga)

Taxonomi

Följande arter hänförs till släktet:

Abutilon gult virus
Bean yellow disorder virus
Beet pseudoyellows virus
Blackberry gula ven-associerat virus
Gurkor gul stunting disorder virus
Diodia ven chlorosis virus
Salladsklorosvirus
Sallads smittsamma gula virus
Potatis gul ven virus
Jordgubbspallidos-associerat virus
Sötpotatis klorotiska stuntvirus
Tetterwort ven chlorosis virus
Tomatklorosvirus
Tomat infektiöst klorosvirus

externa länkar