Chorismate lyas
Enzymet korismatlyas ( EC 4.1.3.40 ) katalyserar den kemiska reaktionen
| Chorismate lyas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifiers | |||||||||
| EG nr. | 4.1.3.40 | ||||||||
| CAS-nr. | 157482-18-3 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
- korismat 4-hydroxibensoat + pyruvat
Detta enzym tillhör familjen lyaser , särskilt oxo-syra-lyaserna, som klyver kol-kolbindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är korismatpyruvat-lyas (4-hydroxibensoatbildande) . Andra namn i vanligt bruk inkluderar CL , CPL och UbiC .
Detta enzym katalyserar det första steget i biosyntesen av ubikinon , avlägsnandet av pyruvat från korismat, för att ge 4-hydroxibensoat i Escherichia coli och andra gramnegativa bakterier . Dess aktivitet kräver inte metallkofaktorer .
Aktivitet
| Chorismate lyase | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 chorismate lyase med produkt, 1.0 a resolution
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | Chor_lyase | ||||||||
| Pfam | PF04345 | ||||||||
| Pfam klan | CL0122 | ||||||||
| InterPro | IPR007440 | ||||||||
| SCOP2 | 1jd3 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Katalytisk aktivitet
- Chorismat = 4HB + pyruvat
- Detta enzym har ett optimalt pH vid 7,5
Enzymatisk aktivitet
Hämmas av:
- Vanilj
- 4-hydroxibensaldehyd
- 3-karboxylmetylaminmetyl-4-hydroxibensoesyra
- 4HB - ubiC hämmas av produkten av reaktionen, som forskare tror fungerar som en kontrollmekanism för vägen
Väg
Den väg som används kallas biosyntesvägen för ubikinon, den katalyserar det första steget i biosyntesen av ubikinon i E. coli. Ubiquinon är ett lipidlösligt elektrontransporterande coenzym. De är väsentliga elektronbärare i prokaryoter och är väsentliga i aeroba organismer för att uppnå ATP.
Nomenklatur
Det finns flera olika namn för korismatlyas. det kallas också för korismatpyruvatlyas (4-hydroxibensoat-bildande) och det förkortas också på flera olika sätt: CPL, CL och ubiC. Det kallas ibland för ubiC, eftersom det är gennamnet. Detta enzym tillhör klassen Lyaser; mer specifikt ox-syra-lyasen eller kol-kol-lyaserna.
Taxonomisk härstamning: bakterier → proteobakterier → gammaproteobakterier → enterobacteriales → enterobacteriaceae → escherichia → escherichia coli
Strukturera
Detta enzym är en monomer . Dess sekundära struktur innehåller helixar, vändningar och beta-strängar . Den har en massa på 18 777 dalton och dess sekvens är 165 aminosyror lång.
Bindande webbplatser
- position: 35(M)
- position: 77(R)
- position: 115(L)
Mutagenes
- position: 91- G → A; ökar produkthämningen med 40 %. Ingen effekt på substrataffinitet.
- position: 156 - E → K; förlust av aktivitet
Vidare läsning
- Nichols BP, Green JM (1992). "Klonning och sekvensering av Escherichia coli ubiC och rening av korismatlyas" . J. Bacteriol . 174 (16): 5309–16. doi : 10.1128/jb.174.16.5309-5316.1992 . PMC 206367 . PMID 1644758 .
- Siebert M, Severin K, Heide L (1994). "Bildning av 4-hydroxibensoat i Escherichia coli: karakterisering av ubiC-genen och dess kodade enzym korismatpyruvat-lyas" . Mikrobiologi . 140 (4): 897–904. doi : 10.1099/00221287-140-4-897 . PMID 8012607 .
- Meganathan R (2001). "Ubiquinon biosyntes i mikroorganismer" . FEMS Microbiol. Lett . 203 (2): 131–9. doi : 10.1111/j.1574-6968.2001.tb10831.x . PMID 11583838 .
