C1QBP

C1QBP
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, GHABP1, SF2p32, gC1Q-R, gC1qR, p32, komplement komponent 1, q subkomponent bindande protein, komplement C1q bindande protein, COXPD33, SF2AP32 Externa
IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Komplementkomponent 1 Q subkomponentbindande protein, mitokondrie är ett protein som hos människor kodas av C1QBP - genen .

Den humana komplementsubkomponenten C1q associeras med C1r och C1s för att ge den första komponenten i serumkomplementsystemet. Proteinet som kodas av denna gen är känt för att binda till de globulära huvudena av C1q-molekyler och hämma C1-aktivering. Detta protein har också identifierats som p32-subenheten av pre-mRNA splitsningsfaktor SF2, såväl som ett hyaluronsyrabindande protein.

Proteinsubenhet

C1QBP är 282 aminosyror lång och har tre homologa subenheter med sina N-terminala 73 aminosyrarester avspjälkade för att producera moget C1QBP. C1QBP uppträder som en monomer runt 33 kDa på SDS-PAGE- gel under både reducerande och icke-reducerande tillstånd men migrerar som en trimer vid storleksuteslutningskromatografi (gelfiltrering).

Proteinstruktur

Kristallstrukturen för C1QBP vid 2,25 Å upplösning visar en homotrimer ring som visar symmetri . De individuella subenheterna hålls samman av icke-kovalenta interaktioner och bildar en munkformad kvartär struktur med en central hålighet på 20 Å i diameter. Varje subenhet av C1QBP har sju β-strängar (β1-β7) och tre α-helixar (α1-α3). C1QBP är negativt laddad på sin lösliga yta medan membranytan övervägande är positivt laddad.

Interaktioner

C1QBP har visats interagera med Proteinkinas D1 , BAT2 , PRKCD , PKC alfa och Proteinkinas Mζ . Andra interagerande partners till C1QBP inkluderar proteindomäner från patogener som bakterier, virus och plasmodium falciparum. Plasmaproteiner inklusive fibrinogen, FXII och HK har visats interagera med C1QBP på ett zinkberoende sätt. Nyligen har en tumörsökande peptid, LyP-1(CGNKRTRGC) visat sig selektivt binda till C1QBP i tumöruttryckande celler.

Vidare läsning

•    Krainer AR, Mayeda A, Kozak D, Binns G (1991). "Funktionellt uttryck av klonad human splitsningsfaktor SF2: homologi med RNA-bindande proteiner, U1 70K och Drosophila splitsningsregulatorer". Cell . 66 (2): 383–94. doi : 10.1016/0092-8674(91)90627-B . PMID 1830244 . S2CID 24119556 .
•   Busby TF, Ingham KC (1990). "NH2-terminal kalciumbindande domän av humant komplement C1s- förmedlar interaktionen av C1r- med C1q". Biokemi . 29 (19): 4613–8. doi : 10.1021/bi00471a016 . PMID 2372546 .
•   Fridell RA, Harding LS, Bogerd HP, Cullen BR (1995). "Identifiering av ett nytt humant zinkfingerprotein som specifikt interagerar med aktiveringsdomänen för lentivirala Tat-proteiner" . Virologi . 209 (2): 347–57. doi : 10.1006/viro.1995.1266 . PMID 7778269 .
•    Luo Y, Yu H, Peterlin BM (1994). "Cellulärt protein modulerar effekterna av humant immunbristvirus typ 1 Rev" . J. Virol . 68 (6): 3850–6. doi : 10.1128/JVI.68.6.3850-3856.1994 . PMC 236890 . PMID 8189522 .
•   Honoré B, Madsen P, Rasmussen HH, et al. (1994). "Klonning och uttryck av ett cDNA som täcker hela den kodande regionen av P32-subenheten av human pre-mRNA splitsningsfaktor SF2". Gene . 134 (2): 283–7. doi : 10.1016/0378-1119(93)90108-F . PMID 8262387 .
•   Tange TO, Jensen TH, Kjems J (1996). "In vitro interaktion mellan humant immunbristvirus typ 1 Rev-protein och splitsningsfaktor ASF/SF2-associerat protein, p32" . J. Biol. Chem . 271 (17): 10066–72. doi : 10.1074/jbc.271.17.10066 . PMID 8626563 .
•   Guo N, Weremowicz S, Lynch N, et al. (1997). "Tilldelning av C1QBP som kodar för det C1q globulära domänbindande proteinet (gC1q-R) till humant kromosom 17 band p13.3 genom in situ hybridisering". Cytogenet. Cell Genet . 77 (3–4): 283–4. doi : 10.1159/000134598 . PMID 9284938 .
•   Majumdar M, Datta K (1998). "Tilldelning av cDNA som kodar för hyaluronsyrabindande protein 1 till human kromosom 17p12-p13". Genomik . 51 (3): 476–7. doi : 10.1006/geno.1998.5364 . PMID 9721222 .
•    Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C, et al. (1999). "Det splitsningsfaktorassocierade proteinet, p32, reglerar RNA-splitsning genom att hämma ASF/SF2 RNA-bindning och fosforylering" . EMBO J . 18 (4): 1014–24. doi : 10.1093/emboj/18.4.1014 . PMC 1171193 . PMID 10022843 .
•    Jiang J, Zhang Y, Krainer AR, Xu RM (1999). "Kristallstruktur av humant p32, ett munkformat surt mitokondriellt matrisprotein" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (7): 3572–7. Bibcode : 1999PNAS...96.3572J . doi : 10.1073/pnas.96.7.3572 . PMC 22335 . PMID 10097078 .
•    Braun L, Ghebrehiwet B, Cossart P (2000). "gC1q-R/p32, ett C1q-bindande protein, är en receptor för InlB-invasionsproteinet från Listeria monocytogenes" . EMBO J . 19 (7): 1458–66. doi : 10.1093/emboj/19.7.1458 . PMC 310215 . PMID 10747014 .
•    Beatch MD, Hobman TC (2000). "Rubellaviruskapsid associerar med värdcellsprotein p32 och lokaliseras till mitokondrier" . J. Virol . 74 (12): 5569–76. doi : 10.1128/JVI.74.12.5569-5576.2000 . PMC 112044 . PMID 10823864 .
•   Storz P, Hausser A, Link G, et al. (2000). "Proteinkinas C [mikro] regleras av det multifunktionella chaperonproteinet p32" . J. Biol. Chem . 275 (32): 24601–7. doi : 10.1074/jbc.M002964200 . PMID 10831594 .
•   Tye AJ, Ghebrehiwet B, Guo N, et al. (2001). "Den humana gC1qR/p32-genen, C1qBP. Genomisk organisation och promotoranalys" . J. Biol. Chem . 276 (20): 17069–75. doi : 10.1074/jbc.M009064200 . PMID 11278463 .
•   Schaerer MT, Kannenberg K, Hunziker P, et al. (2001). "Interaktion mellan GABA(A)-receptor beta-subenheter och det multifunktionella proteinet gC1q-R" . J. Biol. Chem . 276 (28): 26597–604. doi : 10.1074/jbc.M102534200 . PMID 11350968 .
•   Kobayashi M, Hanai R (2001). "M fasspecifik association av humant topoisomeras IIIbeta med kromosomer". Biochem. Biophys. Res. Commun . 287 (1): 282–7. doi : 10.1006/bbrc.2001.5580 . PMID 11549288 .
•   Rozanov DV, Ghebrehiwet B, Postnova TI, et al. (2002). "Den hemopexinliknande C-terminala domänen av membran typ 1-matrismetalloproteinas reglerar proteolys av ett multifunktionellt protein, gC1qR" . J. Biol. Chem . 277 (11): 9318–25. doi : 10.1074/jbc.M110711200 . PMID 11773076 .
•   Majumdar M, Meenakshi J, Goswami SK, Datta K (2002). "Hyaluronanbindande protein 1 (HABP1)/C1QBP/p32 är ett endogent substrat för MAP-kinas och translokeras till kärnan vid mitogen stimulering". Biochem. Biophys. Res. Commun . 291 (4): 829–37. doi : 10.1006/bbrc.2002.6491 . PMID 11866440 .

externa länkar

• Humant C1QBP- genomplacering och C1QBP- geninformationssida i UCSC Genome Browser .