BAT2

PRRC2A-
identifierare
	, BAT2, D6S51, D6S51E, G2, prolinrik coiled-coil 2A
Externa ID:n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ; ; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Stort prolinrikt protein BAT2 är ett protein som hos människor kodas av BAT2 -genen .

Fungera

Ett kluster av gener, BAT1-BAT5, har lokaliserats i närheten av generna för TNF alfa och TNF beta . Dessa gener är alla inom det mänskliga huvudhistokompatibilitetskomplexet klass III- region. Denna gen har mikrosatellitupprepningar som är associerade med åldern vid uppkomsten av insulinberoende diabetes mellitus (IDDM) och som möjligen tros vara involverad i den inflammatoriska processen av pankreatisk betacellsdestruktion under utvecklingen av IDDM. Denna gen är också en kandidatgen för utveckling av reumatoid artrit. Det finns två alternativt splitsade transkript som kodar för olika isoformer beskrivna för denna gen.

Interaktioner

BAT2 har visat sig interagera med:

C1QBP ,
EIF3S6 ,
HNRNPA1 ,
IFT88 ,
IMMT , och
UBAP2L .

Vidare läsning

Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (1989). "Humant större histokompatibilitetskomplex innehåller minst 19 gener mellan komplementklustret och HLA-B" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (22): 8955–8. Bibcode : 1989PNAS...86.8955S . doi : 10.1073/pnas.86.22.8955 . PMC 298409 . PMID 2813433 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalisering och subtraktion: två metoder för att underlätta genupptäckt" . Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Singal DP, Li J, Zhu Y (2000). "HLA klass III-region och mottaglighet för reumatoid artrit". Clin. Exp. Reumatol . 18 (4): 485–91. PMID 10949724 .
Hashimoto M, Nakamura N, Obayashi H, et al. (2000). "Genetiskt bidrag från BAT2-genens mikrosatellitpolymorfism till åldern vid uppkomsten av insulinberoende diabetes mellitus". Brum. Genet . 105 (3): 197–9. doi : 10.1007/s004390051089 . PMID 10987645 .
Matsuzaka Y, Makino S, Nakajima K, et al. (2002). "Nya polymorfa mikrosatellitmarkörer i den mänskliga MHC klass III-regionen". Vävnadsantigener . 57 (5): 397–404. doi : 10.1034/j.1399-0039.2001.057005397.x . PMID 11556964 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). "DNA-sekvensen och analysen av human kromosom 6" . Naturen . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
Xie T, Rowen L, Aguado B, et al. (2004). "Analys av den gentäta huvudhistokompatibilitetskomplexet klass III-regionen och dess jämförelse med mus" . Genome Res . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC 403804 . PMID 14656967 .
Lehner B, Semple JI, Brown SE, et al. (2004). "Analys av ett tvåhybridsystem med hög genomströmning av jäst och dess användning för att förutsäga funktionen hos intracellulära proteiner som kodas inom den mänskliga MHC klass III-regionen". Genomik . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Schneiders A, Thiel S, Winkler J, et al. (2005). "Antikroppar genererade av en ny DNA-vaccination identifierar den MHC klass III-kodade BAT2-polypeptiden". Vaccin . 23 (19): 2540–50. doi : 10.1016/j.vaccine.2004.08.003 . PMID 15752841 .
Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globalt fosfoproteom av HT-29 humana kolonadenokarcinomceller". J. Proteome Res . 4 (4): 1339–46. doi : 10.1021/pr050048h . PMID 16083285 .
Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006). "Ett protein-proteininteraktionsnätverk för mänskliga ärftliga ataxier och störningar av Purkinje-celldegeneration" . Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Ett sannolikhetsbaserat tillvägagångssätt för högkapacitetsproteinfosforyleringsanalys och platslokalisering". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .

externa länkar

Human PRRC2A- genomplacering och PRRC2A- geninformationssida i UCSC Genome Browser .