Bocaparvovirus
| Bocaparvovirus | |
|---|---|
| Virus klassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Monodnaviria |
| Rike: | Shotokuvirae |
| Provins: | Cossaviricota |
| Klass: | Quintoviricetes |
| Beställa: | Piccovirales |
| Familj: | Parvoviridae |
| Underfamilj: | Parvovirinae |
| Släkte: | Bocaparvovirus |
| Art | |
Bocaparvovirus är ett släkte av virus i underfamiljen Parvovirinae av virusfamiljen Parvoviridae . Människor, boskap och hundar fungerar som naturliga värdar. Det finns 28 arter i detta släkte. Sjukdomar associerade med detta släkte inkluderar, hos människor, akut luftvägssjukdom och hos nötkreatur, diarré och milda andningssymtom.
Historia
Bocavirus beskrevs först i djur i början av 1960-talet.
Genom
Liksom de andra medlemmarna i denna familj har bocaparvovirus två öppna läsramar —ORF1 och 2. Unikt bland parvovirus innehåller bocaparvovirus en tredje öppen läsram mellan icke-strukturella och strukturella kodande regioner. Denna gen kodar för ett mycket fosforylerat icke-strukturellt protein (NP1).
ORF1 kodar för ett icke-strukturellt protein (NS1) som är involverat i viral genomreplikation. ORF2 kodar för de två kapsidproteinerna - VP1 och VP2.
Liksom andra parvovirus innehåller den unika regionen VP1 ett fosfolipas A(2)-motiv med ett konserverat Histidin – Asparaginsyra -XXY-motiv i det katalytiska centret.
Taxonomi
Följande 28 arter tilldelas släktet:
- Köttätare bocaparvovirus 1
- Köttätare bocaparvovirus 2
- Köttätare bocaparvovirus 3
- Köttätare bocaparvovirus 4
- Köttätare bocaparvovirus 5
- Köttätare bocaparvovirus 6
- Chiropteran bocaparvovirus 1
- Chiropteran bocaparvovirus 2
- Chiropteran bocaparvovirus 3
- Chiropteran bocaparvovirus 4
- Chiropteran bocaparvovirus 5
- Lagomorph bocaparvovirus 1
- Pinniped bocaparvovirus 1
- Pinniped bocaparvovirus 2
- Primat bocaparvovirus 1
- Primat bocaparvovirus 2
- Primat bocaparvovirus 3
- Gnagare bocaparvovirus 1
- Gnagare bocaparvovirus 2
- Hovdjur bocaparvovirus 1
- Hovdjur bocaparvovirus 2
- Hovdjur bocaparvovirus 3
- Hovdjur bocaparvovirus 4
- Hovdjur bocaparvovirus 5
- Hovdjur bocaparvovirus 6
- Hovdjur bocaparvovirus 7
- Hovdjur bocaparvovirus 8
- Hovdjur bocaparvovirus 9
Virusdetaljer
I Parvoviridae definieras nu arter generellt som ett kluster av virus som kodar för replikationsinitiatorproteiner (kallade NS1) som har aminosyrasekvenser som är åtminstone 85 % identiska med de som kodas av alla andra medlemmar av arten.
Murmeldjur har också identifierats som värdar för nya bocaparvovirus.
Virologi
Bovina bocavirus använder endocytos i clathrin-belagda vesiklar för att komma in i celler; de är beroende av försurning och verkar vara associerade med aktin- och mikrotubuliberoende.
Alla bocaparvovirus kodar för ett nytt protein som kallas NP1 som inte finns i parvovirus från andra släkten. Hos hundar har NP1 visat sig vara väsentligt för ett tidigt steg i viral replikation och krävs också för genomläsning av ett internt polyadenyleringsställe som är väsentligt för uttryck av kapsidproteinerna.
Livscykel
Viral replikation är nukleär. Inträde i värdcellen uppnås genom bindning till värdreceptorer, vilket förmedlar clathrin-medierad endocytos. Replikering följer modellen med rullande hårnålar. DNA-mallrad transkription, med någon alternativ splitsningsmekanism är metoden för transkription. Viruset lämnar värdcellen genom export av kärnpor. Människor, nötkreatur och hundar fungerar som den naturliga värden. Smittvägarna är orala och respiratoriska.
| Släkte | Värdinformation | Vävnadstropism | Inträdesuppgifter | Releaseinformation | Replikeringsplats | Monteringsplats | Överföring |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bocaparvovirus | Människor; kor; hundar | Ingen | Clathrin-medierad endocytos | tidig frisättning från livsdugliga celler & celllys | Kärna | Kärna | Aerosol |
Klinisk
Dessa virus infekterar i allmänhet mag-tarmkanalen och luftvägarna. Vissa kan passera moderkakan och orsaka medfödd infektion hos fostret.
Hunddjursminutvirus , som först isolerades 1967 och förknippades med sjukdom 1970, orsakar andningssjukdomar med andningssvårigheter och enterit med svår diarré, spontan abort av foster och död hos nyfödda valpar.
Humana bocavirus isolerades första gången 2005 i Sverige . De kan kunna orsaka hepatit hos en immunsupprimerad värd.
Bocaparvovirus har isolerats från human kolon- och lungcancer. Den kliniska betydelsen av detta fynd - om någon - återstår att se.
Incidensen av bocavirus hos patienter med cancer är högre än hos friska kontroller.
Strukturera
Liksom andra parvovirus har bocaparvovirus en ikosaedrisk och rund struktur med T=1 symmetri. Kapsiden är icke-hölje och består av 60 kopior av upp till sex typer av kapsidproteiner (kallade VP1 till VP6) som delar en gemensam C-terminal region. Strukturen av en virusliknande partikel som endast består av VP2-protein bestämdes genom kryogen elektronmikroskopi och bildrekonstruktion. Diametern är cirka 21-22 nm. Genomerna är linjära, cirka 5,5 kb långa
| Släkte | Strukturera | Symmetri | Capsid | Genomiskt arrangemang | Genomisk segmentering |
|---|---|---|---|---|---|
| Bocaparvovirus | Icosahedral | T=1 | Ej kuverterade | Linjär | Ingen |
externa länkar
- Viralzon : Bocaparvovirus
- [1] ICTV 2018 Bocaparvovirus ]