Betacoronavirus

Betacoronavirus
	Murint coronavirus (MHV) virionelektronmikrograf , schematisk struktur och genom
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Pisuviricota
Klass:	Pisoniviricetes
Beställa:	Nidovirales
Familj:	Coronaviridae
Underfamilj:	Orthocoronavirinae
Släkte:	Betacoronavirus
Undersläkten och arter
	Se text

Betacoronavirus (β-CoVs eller Beta-CoVs) är ett av fyra släkten ( Alfa- , Beta- , Gamma- och Delta- ) av coronavirus . Medlemsvirus är hölje , positiv-strängade RNA-virus som infekterar däggdjur (av vilka människor är en del). Den naturliga reservoaren för betacoronavirus är fladdermöss och gnagare. Gnagare är reservoaren för subgenus Embecovirus , medan fladdermöss är reservoaren för de andra subgenera.

Coronavirus-släktena är var och en sammansatt av olika virala linjer där betacoronavirus-släktet innehåller fyra sådana härstamningar: A, B, C, D. I äldre litteratur är detta släkte även känt som "grupp 2-koronavirus". Släktet tillhör underfamiljen Orthocoronavirinae i familjen Coronaviridae , av ordningen Nidovirales .

De betacoronavirus som har störst klinisk betydelse för människor är OC43 och HKU1 (som kan orsaka förkylning ) av härstamning A, SARS-CoV och SARS-CoV-2 (som har orsakat sjukdomen COVID-19 ) av linje B och MERS -CoV av linje C. MERS-CoV är det första betacoronavirus som tillhör härstamning C som är känt för att infektera människor.

Etymologi

Namnet "betacoronavirus" kommer från antikens grekiska βῆτα ( bē̂ta , "den andra bokstaven i det grekiska alfabetet ") och κορώνη (korṓnē, "krans, krans"), vilket betyder krona, vilket beskriver utseendet på projektioner under ytan elektronmikroskopi som liknar en solkorona . Denna morfologi skapas av virala spike (S) peplomerer , som är proteiner som befolkar ytan av viruset och bestämmer värdtropism . Orden Nidovirales är uppkallad efter latinets nidus , som betyder "bo". Det hänvisar till denna orders produktion av en 3'-koterminal kapslad uppsättning av subgenomiska mRNA under infektion.

Strukturera

MERS-CoV: struktur, bindning, ingång och genomisk sammansättning

Flera strukturer av spikproteinerna har lösts. Den receptorbindande domänen i spikproteinet alfa- och betacoronavirus är katalogiserad som InterPro : IPR018548 . Spikeproteinet, en typ 1 fusionsmaskin , sätts ihop till en trimer (); dess kärnstruktur liknar den hos paramyxovirus F (fusions)-proteiner. Receptoranvändningen är inte särskilt konserverad; till exempel, bland Sarbecovirus , delar endast en underlinje som innehåller SARS ACE2 -receptorn.

Virusen från undersläktet Embecovirus skiljer sig från alla andra i släktet genom att de har ytterligare ett kortare (8 nm) spikliknande protein som kallas hemagglutininesteras (HE) (). Det tros ha förvärvats från influensa C-virus .

Genom

Genomer av alfacoronavirus och betacoronavirus

Coronavirus har en stor genomstorlek som sträcker sig från 26 till 32 kilobaser. Den övergripande strukturen av β-CoV-genomet liknar den för andra CoVs, med ett ORF1ab- replikaspolyprotein ( rep , pp1ab ) före andra element. Detta polyprotein klyvs till 16 icke-strukturella proteiner (se UniProt-kommentaren av SARS rep , ).

Från och med maj 2013 har GenBank 46 publicerade kompletta genom av α- (grupp 1), β- (grupp 2), γ- (grupp 3) och δ- (grupp 4) CoVs.

Rekombination

Genetisk rekombination kan inträffa när två eller flera virusgenom finns i samma värdcell. Dromedarkamelen Beta-CoV HKU23 uppvisar genetisk mångfald i den afrikanska kamelpopulationen . Bidragande till denna mångfald är flera rekombinationshändelser som hade ägt rum tidigare mellan närbesläktade betacoronavirus av undersläktet Embecovirus . Även betacoronaviruset, Human SARS-CoV , tycks ha haft en komplex historia av rekombination mellan förfäders coronavirus som fanns hos flera olika djurgrupper.

Patogenes

Replikationscykel av virus av släktet Betacoronavirus

Alfa- och betacoronavirus infekterar främst fladdermöss, men de infekterar även andra arter som människor , kameler och gnagare . Betacoronavirus som har orsakat epidemier hos människor inducerar vanligtvis feber och andningssymtom. De inkluderar:

SARS-CoV , orsakar SARS .
MERS-CoV , orsakar MERS .
SARS-CoV-2 , orsakar covid-19 .

Klassificering

Fylogenetiskt träd av släktet Betacoronavirus med detaljer för SARS-CoV och MERS-CoV

Inom släktet Betacoronavirus (Grupp 2 CoV) har fyra subgenera eller linjer (A, B, C och D) traditionellt sett erkänts. De fyra linjerna har också namngetts med grekiska bokstäver eller numeriskt. Ett femte undersläkte, Hibecovirus , lades till mer nyligen. Medlemmarnas undersläkten och arter inkluderar:

Se även

Djurvirus

externa länkar

Betacoronavirus

Murint coronavirus (MHV) virionelektronmikrograf , schematisk struktur och genom
Virusklassificering
(orankad):	Virus
Rike :	Riboviria
Rike:	Orthornavirae
Provins:	Pisuviricota
Klass:	Pisoniviricetes
Beställa:	Nidovirales
Familj:	Coronaviridae
Underfamilj:	Orthocoronavirinae
Släkte:	*Betacoronavirus*
Undersläkten och arter
Se text

Betacoronavirus

Etymologi

Strukturera

Genom

Rekombination

Patogenes

Klassificering

Embecovirus (härstamning A)

Sarbecovirus (härstamning B)

Merbecovirus (härstamning C)

Nobecovirus (härstamning D)

Hibecovirus

Se även

externa länkar