Bas-Kongo tibrovirus
| Bas-Congo tibrovirus | |
|---|---|
| Virusklassificering | |
| (orankad): | Virus |
| Rike : | Riboviria |
| Rike: | Orthornavirae |
| Provins: | Negarnaviricota |
| Klass: | Monjiviricetes |
| Beställa: | Mononegavirales |
| Familj: | Rhabdoviridae |
| Släkte: | Tibrovirus |
| Arter: |
Bas-Kongo tibrovirus
|
| Synonymer | |
|
|
Bas-Congo tibrovirus (BASV) är ett dåligt karakteriserat rhabdovirus som upptäckts i blodet hos en patient som överlevde en allvarlig sjukdom som liknar hemorragisk feber. Viruset har fått sitt namn efter den tidigare Demokratiska republiken Kongo-provinsen Bas-Kongo (nuvarande Kongo Central ). BASV upptäcktes med hjälp av nästa generations sekvensering och försök att isolera viruset lyckades inte. BASV RNA har bara påvisats hos en individ och dess roll som human patogen har inte fastställts.
Upptäckt
Våren 2009 utvecklade två tonåringar som bodde i Mangala, en liten by belägen i den västligaste provinsen i Demokratiska republiken Kongo, en allvarlig sjukdom med symtom som inkluderade: feber, huvudvärk, buksmärtor, mun- och näsblödningar, hematemes, och blodig diarré. Båda tonåringarna dog inom några dagar efter att de utvecklat symtom
Mer än en vecka senare blev en 32-årig sjuksköterska som tog hand om de två tonåringarna sjuk. Hans symptom liknade de två tonåringarna: nasala, okulära och orala blödningar; hematemes och blodig diarré. Han fick stöd och återhämtade sig. Ett blodprov togs och utsattes för nästa generations sekvensering. Analys avslöjade närvaron av ett nytt rhabdovirus, BASV, som liknade andra medlemmar av det dåligt karakteriserade tibrovirussläktet.
Sjukdomsförening
BASV var närvarande i blodet hos den infekterade individen vid mer än 1 miljon RNA-kopior/ml plasma, vilket tyder på en aktiv infektion.
Även om nästa generations sekvensering är ett kraftfullt verktyg för att upptäcka nya virus, fastställer det inte entydigt BASV som orsaken till patientens sjukdom. Andra experter har faktiskt föreslagit att BASV inte är orsaken till patientens sjukdom och noterat att ett utbrott av Shigella inträffade i området samtidigt.
Genom
Det fullständiga BASV-genomet är inte tillgängligt. Ett genom på 11 892 bp har rapporterats, vilket sannolikt är 95 % - 98 % komplett. BASV-genomet består av de fem typiska rhabdovirusgenerna (N, P, M, G och L), såväl som tre öppna läsramar med okänd funktion (U1, U2 och U3).
Incidens och prevalens
Lite är känt om förekomsten eller prevalensen av BASV. BASV-antikroppar upptäcktes hos den infekterade patienten, samt en nära kontakt som inte visade några sjukdomssymtom. En seroundersökning av 50 slumpmässigt utvalda blodgivare i Kasai-Oriental-provinsen i Demokratiska republiken Kongo upptäckte inga positiva prover. Denna provins ligger dock cirka 2 000 kilometer från staden där BASV först upptäcktes. [ citat behövs ]
Överföring
Den naturliga reservoaren och överföringsvägen för BASV är okända. En maskininlärningsalgoritm utformad för att förutsäga djurreservoarer och leddjursvektorer antyder att den naturliga värden kan vara nötkreatur och insektsvektorn en bitande mygga. Denna förutsägelse överensstämmer med vad som för närvarande är känt om överföringscykeln för andra tibrovirus. [ citat behövs ]
Relation till andra rhabdovirus
Fylogenetisk analys av polymerasproteinet (L) avslöjade att BASV är närmast besläktat med medlemmar av tibrovirussläktet . Det finns åtta kända tibrovirus, inklusive BASV. Fyra tibrovirus har isolerats från bitande myggor ( Culicoides ), tre från människor och ett från en frisk stut. Med undantag för Bas-Kongo har inget av de andra tibrovirusen associerats med någon sjukdom. Experimentell infektion av nötkreatur med olika tibrovirus ger inga symtom på sjukdom.