Antranilatsyntas

Antranilatsyntas
Serratia marcescens antranilatsyntasdimerkomplex med TrpE (röd) och TrpG (blå). <a i=3>Identifierare
Identifiers
EG nr.	4.1.3.27
CAS-nr.	9031-59-8
Databaser
IntEnz	IntEnz-vy
BRENDA	BRENDA inträde
ExPASy	NiceZyme-vy
KEGG	KEGG inträde
MetaCyc	Metabolisk väg
PRIAM	profil
PDB- strukturer	RCSB PDB PDBe PDB summa
Genontologi	AmiGO / QuickGO
Sök PMC artiklar PubMed artiklar NCBI proteiner

Enzymet antranilatsyntas ( EC 4.1.3.27 ) katalyserar den kemiska reaktionen

korismat + L -glutamin $\rightleftharpoons$ antranilat + pyruvat + L -glutamat

Fungera

Antranilatsyntas skapar antranilat, en viktig mellanprodukt i biosyntesen av indol , och i förlängningen aminosyran tryptofan . Tryptofan kan sedan metaboliseras vidare till serotonin , melatonin eller olika auxiner .

Reaktion

Antranilatsyntas katalyserar förändringen från korismat till antranilat. Som sitt andra substrat kan den använda antingen glutamin eller ammoniak . Under reaktionen avlägsnas både en hydroxylgrupp och en enolpyruvylgrupp från den aromatiska ringen . Enolpyruvylgruppen får en proton för att bilda pyruvat . Det har visat sig att protonen kommer från det omgivande vattnet och inte från en intramolekylär förskjutning av en väteatom på substraten. Aminogruppen av glutamin (eller ammoniak i sig) attackerar korismat i position 2, vilket leder till ? elimineringen av enolpyruvylgruppen från position 3. I processen återbildas en aromatisk ring.

Kemisk ekvation för reaktion som inträffar i antranilatsyntas

Struktur och montering

Komplexet är uppbyggt av α- och β-subenheter. Gelfiltreringsexperiment avslöjar att komplexet förekommer som en a2P2- _{tetramer under} naturliga förhållanden och som en aP-dimer under höga saltkoncentrationer . αβ-dimererna interagerar genom α-subenheterna för att bilda komplexet.

Underenheterna av antranilatsyntas kodas av trpE- och trpD-generna i E. coli , som båda förekommer i trp-operonet .

Hos Enterobacteriaceae finns detta enzym i form av ett aggregat med antranilatfosforibosyltransferas . Om dessa två enzymer inte är klustrade kan komplexet inte använda glutamin som substrat och kan bara använda ammoniak.

Nomenklatur

Detta enzym tillhör familjen lyaser , för att vara specifikt oxo-syra-lyaserna, som klyver kol-kolbindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är korismatpyruvat-lyas (aminoaccepterande; antranilatbildande) . Andra namn i allmänt bruk inkluderar anthranilatsyntetas , chorismate lyase och chorismate pyruvate-lyase (amino-accepterande) . Detta enzym deltar i biosyntesen av fenylalanin, tyrosin och tryptofan och tvåkomponentsystem - allmänt.

Strukturstudier

I slutet av 2007 har fem strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1I1Q , 1I7Q , 1I7S , 1QDL och 2I6Y .

Ansökan

•   Baker TI, Crawford IP (1966). "Antranilatsyntetas. Partiell rening och några kinetiska studier på enzymet från Escherichia coli " . J. Biol. Chem . 241 (23): 5577–5584. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96383-0 . PMID 5333199 .
• Creighton TE, Yanofsky C (1970). "Korismat till tryptofan ( Escherichia coli ) - antranilatsyntetas, PR-transferas, PRA-isomeras, InGP-syntetas, tryptofansyntetas". Metoder Enzymol . 17A : 365–380. doi : 10.1016/0076-6879(71)17215-1 .
•    Kung CC, Huang WN, Huang YC, Yeh KC (2006). "Proteomisk undersökning av kopparbindande proteiner i Arabidopsis-rötter genom immobiliserad metallaffinitetskromatografi och masspektrometri". Proteomik . 6 (9): 2746–2758. doi : 10.1002/pmic.200500108 . PMID 16526091 . S2CID 25896917 .
•    Ito J, Yanofsky C (1969). "Antranilatsyntetas, ett enzym specificerat av tryptofanoperonet av Escherichia coli : Jämförande studier på komplexet och underenheterna" . J. Bacteriol . 97 (2): 734–742. doi : 10.1128/JB.97.2.734-742.1969 . PMC 249753 . PMID 4886290 .
•   Zalkin H, Kling D (1968). "Anthranilatsyntetas. Rening och egenskaper hos komponent I från Salmonella typhimurium ". Biokemi . 7 (10): 3566–3573. doi : 10.1021/bi00850a034 . PMID 4878701 .