TAF9

Protein TAF9 PDB 1rkb.png
TAF9-
identifierare
, MGC:5067, STAF31/32, TAF2G, TAFII-31, TAFII-32, TAFII31, TAFII32, TAFIID32, TATA-box-bindande proteinassocierad faktor 9 Externa ID:
n
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

TAF9 RNA-polymeras II, TATA-boxbindande protein (TBP)-associerad faktor, 32kDa, även känd som TAF9 , är ett protein som hos människor kodas av TAF9 -genen .

Fungera

Initiering av transkription av RNA-polymeras II kräver aktiviteter av mer än 70 polypeptider. Proteinkomplexet som koordinerar dessa aktiviteter är transkriptionsfaktor IID ( TFIID ), som binder till kärnpromotorn för att positionera polymeraset på rätt sätt, fungerar som ställningen för sammansättning av resten av transkriptionskomplexet och fungerar som en kanal för regulatoriska signaler. TFIID består av det TATA-bindande proteinet ( TBP ) och en grupp av evolutionärt konserverade proteiner som kallas TBP-associerade faktorer eller TAF. TAF kan delta i basal transkription, fungera som koaktivatorer, fungera i promotorigenkänning eller modifiera allmänna transkriptionsfaktorer (GTF) för att underlätta komplex sammansättning och transkriptionsinitiering. Denna gen kodar för en av de mindre subenheterna av TFIID som binder till den basala transkriptionsfaktorn GTF2B såväl som till flera transkriptionsaktivatorer såsom p53 och VP16 . En liknande men distinkt gen ( TAF9B ) har hittats på X-kromosomen och en pseudogen har identifierats på kromosom 19 . Alternativ splitsning resulterar i flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Strukturera

De 17-aminosyralånga transaktiverande domänerna (TAD) av flera transkriptionsfaktorer rapporterades binda direkt till TAF9: p53, VP16, HSF1, NF-IL6, NFAT1, NF - KB och ALL1 / MLL1 . Inuti dessa 17 aminosyror identifierades en unik nio-aminosyror transaktiveringsdomän (9aaTAD) för varje rapporterad transkriptionsfaktor. 9aaTAD är en ny domän gemensam för en stor superfamilj av eukaryota transkriptionsfaktorer representerade av Gal4 , Oaf1, Leu3, Rtg3, Pho4 , Gln4, Gcn4 i jäst och av p53, NFAT, NF-KB och VP16 i däggdjur. TAF9 är tänkt att vara en universell transaktiveringskofaktor för 9aaTAD-transkriptionsfaktorer.

Interaktioner

TAF9 har visat sig interagera med:

Vidare läsning