Gal4 transkriptionsfaktor
| Regulatoriskt protein GAL4- | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||
| Organism | |||||||
| Symbol | GAL4 | ||||||
| Entrez | 855828 | ||||||
| UniProt | P04386 | ||||||
| |||||||
Gal4 -transkriptionsfaktorn är en positiv regulator av genuttryck av galaktosinducerade gener. Detta protein representerar en stor svampfamilj av transkriptionsfaktorer, Gal4-familjen, som inkluderar över 50 medlemmar i jästen Saccharomyces cerevisiae, t.ex. Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, Leu3.
Gal4 känner igen gener med UAS G , en uppströms aktiverande sekvens , och aktiverar dem. I jästceller är de huvudsakliga målen GAL1 ( galaktokinas ), GAL10 ( UDP-glukos 4-epimeras ) och GAL7 ( galaktos-1-fosfat uridylyltransferas ), tre enzymer som krävs för galaktosmetabolism. Denna bindning har också visat sig användbar vid konstruktion av GAL4/UAS-systemet , en teknik för att kontrollera uttryck i insekter. I jäst är Gal4 som standard undertryckt av Gal80 och aktiveras i närvaro av galaktos när Gal3 binder bort Gal80.
Domäner
Två exekutiva domäner, DNA-bindande och aktiveringsdomäner, tillhandahåller nyckelfunktion för Gal4-proteinet som överensstämmer med de flesta transkriptionsfaktorerna.
DNA-bindning
Gal4 N-terminus är ett zinkfinger och tillhör svampfamiljen Zn(2)-C6 . Det bildar ett Zn - cystein tiolatkluster och känner specifikt igen UAS G i GAL1-promotorn.
Gal4-transaktivering
Lokaliserad till C-terminalen, tillhör de nio aminosyrornas transaktiveringsdomänfamiljen , 9aaTAD, tillsammans med Oaf1, Pip2, Pdr1, Pdr3, men även p53 , E2A , MLL .
förordning
Galaktos inducerar Gal4-medierad transkription även om glukos orsakar allvarlig repression.
Som en del av Gal4-regleringen känner hämmande protein Gal80 igen och binder till Gal4-regionen (853-874 aa).
Det hämmande proteinet Gal80 sekvestreras av regulatoriskt protein Gal3 på galaktosberoende sätt. Detta gör att Gal4 kan fungera när det finns galaktos.
Mutanter
Gal4-funktionsförlustmutanten gal4-64 (1-852 aa, deletion av Gal4 C-terminalen 29 aa) förlorade både interaktion med Gal80 och aktiveringsfunktion.
I Gal4-reverted mutant Gal4C-62-mutanten uppstod en sekvens (QTAY N AFMN) med 9aaTAD-mönstret och återställde aktiveringsfunktionen för Gal4-proteinet.
Inaktiva konstruktioner
Aktiveringsdomänen Gal4 hämmas av C-terminal domän i vissa Gal4-konstruktioner.
Fungera
Mål
Transkription
Gal4-aktiveringsfunktionen förmedlas av MED15 (Gal11).
Gal4-proteinet interagerar också med andra transkriptionsmediatorer som är Tra1, TAF9 och SAGA/MED15-komplex.
Proteosom
En subenhet av 26S-proteasomen Sug2-regulatoriskt protein har en molekylär och funktionell interaktion med Gal4-funktionen. Proteolytisk omsättning av Gal4-transkriptionsfaktorn krävs inte för funktion in vivo. Den naturliga Gal4 monoubiquitineringen skyddar från 19S-medierad destabilisering under inducerande förhållanden.
Ansökan
Den breda användningen av Gal4 är vid tvåhybridscreening av jäst för att screena eller analysera protein-proteininteraktioner i eukaryota celler från jäst till människa.
I GAL4/UAS-systemet används Gal4-proteinet och Gal4 uppströms aktiverande region (UAS) för att studera genuttrycket och funktionen i organismer som fruktflugan.
Gal4 och det inhiberande proteinet Gal80 har funnit tillämpning i en genetisk teknik för att skapa individuellt märkta homozygota celler som kallas MARCM (mosaikanalys med en repressibel cellmarkör).
Se även
Vidare läsning
- Gal4p på WikiGenes
- Traven A, Jelicic B, Sopta M (maj 2006). "Jäst Gal4: ett transkriptionsparadigm återbesökt" . EMBO-rapporter . 7 (5): 496–9. doi : 10.1038/sj.embor.7400679 . PMC 1479557 . PMID 16670683 .