SF3B3

SF3B3-
identifierare
	, RSE1, SAP130, SF3b130, STAF130, splitsningsfaktor 3b underenhet 3
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Splicing factor 3B subenhet 3 är ett protein som hos människor kodas av SF3B3 -genen .

Denna gen kodar för subenhet 3 av splitsningsfaktor 3b-proteinkomplexet. Splitsningsfaktor 3b, tillsammans med splitsningsfaktor 3a och en 12S RNA-enhet, bildar U2 små nukleära ribonukleoproteinkomplex (U2 snRNP). Splitsningsfaktor 3b/3a-komplexet binder pre-mRNA uppströms om intronets förgreningsställe på ett sekvensoberoende sätt och kan förankra U2 snRNP till pre-mRNA. Splitsningsfaktor 3b är också en komponent i den mindre U12-typ spliceosomen. Subenhet 3 har också identifierats som en komponent i STAGA (SPT3-TAF(II)31-GCN5L acetylas) transkriptionskoaktivator-HAT (histonacetyltransferas)-komplexet och TFTC (TATA-bindande-proteinfritt TAF(II)- som innehåller komplex). Dessa komplex kan fungera i kromatinmodifiering, transkription, splitsning och DNA-reparation.

Interaktioner

SF3B3 har visats interagera med SF3B1 , transkriptionsinitieringsprotein SPT3-homolog och TAF9 .

Vidare läsning

•   Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, et al. (1995). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. I. De kodande sekvenserna för 40 nya gener (KIAA0001-KIAA0040) härledda genom analys av slumpmässigt provtagna cDNA-kloner från human omogna myeloidcellinje KG-1" . DNA Res . 1 (1): 27–35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID 7584026 .
•   Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, et al. (1995). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. I. De kodande sekvenserna för 40 nya gener (KIAA0001-KIAA0040) härledda genom analys av slumpmässigt provtagna cDNA-kloner från human omogna myeloidcellinje KG-1 (supplement)" . DNA Res . 1 (1): 47–56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID 7584028 .
•   Bonaldo MF; Lennon G; Soares MB (1997). "Normalisering och subtraktion: två tillvägagångssätt för att underlätta genupptäckt" . Genome Res . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•    Mintz PJ, Patterson SD, Neuwald AF, et al. (1999). "Rening och biokemisk karakterisering av interkromatingranulatkluster" . EMBO J . 18 (15): 4308–20. doi : 10.1093/emboj/18.15.4308 . PMC 1171507 . PMID 10428969 .
•    Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, et al. (2001). "UV-skadat DNA-bindande protein i TFTC-komplexet kopplar DNA-skada igenkänning till nukleosomacetylering" . EMBO J . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .
•    Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S, et al. (2001). "TFIID-komponenterna Human TAFII140 och Drosophila BIP2 (TAFII155) är nya metazoaniska homologer av jäst TAFII47 som innehåller ett histonveck och ett PHD-finger" . Mol. Cell. Biol . 21 (15): 5109–21. doi : 10.1128/MCB.21.15.5109-5121.2001 . PMC 87236 . PMID 11438666 .
•    Will CL, Schneider C, MacMillan AM, et al. (2001). "Ett nytt U2- och U11/U12-snRNP-protein som associerar med pre-mRNA-grenstället" . EMBO J . 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
•    Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A, et al. (2001). "Human STAGA Complex är en kromatinacetylerande transkriptionskoaktivator som interagerar med pre-mRNA-skarvning och DNA-skadabindande faktorer in vivo" . Mol. Cell. Biol . 21 (20): 6782–95. doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856 . PMID 11564863 .
•    Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, et al. (2002). "Rening och karakterisering av inhemska spliceosomer lämpliga för tredimensionell strukturanalys" . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 . PMID 11991638 .
•   Scott MP, Zappacosta F, Kim EY, et al. (2002). "Identifiering av nya SH3-domänligander för Src-familjens kinas Hck. Wiskott-Aldrichs syndromprotein (WASP), WASP-interagerande protein (WIP) och ELMO1" . J. Biol. Chem . 277 (31): 28238–46. doi : 10.1074/jbc.M202783200 . PMID 12029088 .
•    Will CL, Urlaub H, Achsel T, et al. (2002). "Karakterisering av nya SF3b- och 17S U2 snRNP-proteiner, inklusive en human Prp5p-homolog och ett SF3b DEAD-box-protein" . EMBO J . 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•    Cavusoglu N; Märke M; Tora L; Van Dorsselaer A (2003). "Nya subenheter av det TATA-bindande proteinfria TAFII-innehållande transkriptionskomplexet identifierat av matrisassisterad laserdesorption/joniseringstid för flygmasspektrometri efter endimensionell gelelektrofores". Proteomik . 3 (2): 217–23. doi : 10.1002/pmic.200390030 . PMID 12601814 . S2CID 6035986 .
•    Li J, Hawkins IC, Harvey CD, et al. (2003). "Reglering av alternativ splitsning av SRrp86 och dess interagerande proteiner" . Mol. Cell. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Fullständig sekvensering och karakterisering av 21 243 fullängds humana cDNAs" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Will CL, Schneider C, Hossbach M, et al. (2004). "Human 18S U11/U12 snRNP innehåller en uppsättning nya proteiner som inte finns i den U2-beroende spliceosomen" . RNA . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
•    Jin J, Smith FD, Stark C, et al. (2004). "Proteomisk, funktionell och domänbaserad analys av in vivo 14-3-3-bindande proteiner involverade i cytoskelettreglering och cellulär organisation" . Curr. Biol . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIH fullängds cDNA-projektet: Däggdjursgensamlingen (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .