TAF12

TAF12
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, TAF2J, TAFII20, TATA-box-bindande proteinassocierad faktor 12
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Transkriptionsinitieringsfaktor TFIID subenhet 12 är ett protein som hos människor kodas av TAF12 -genen .

Fungera

Kontroll av transkription med RNA-polymeras II involverar det basala transkriptionsmaskineriet, som är en samling proteiner. Dessa proteiner med RNA-polymeras II, samlas till komplex som moduleras av transaktivatorproteiner som binder till cis-regulatoriska element belägna intill transkriptionsstartstället. Vissa modulatorer interagerar direkt med basalkomplexet, medan andra kan fungera som överbryggande proteiner som länkar transaktivatorer till de basala transkriptionsfaktorerna. Vissa av dessa associerade faktorer är svagt kopplade, medan andra är hårt associerade med TBP i TFIID-komplexet. Bland de senare finns TAF-proteinerna. Olika TAF förutsägs förmedla funktionen av distinkta transkriptionella aktivatorer för en mängd genpromotorer och RNA-polymeraser. TAF12 interagerar direkt med TBP såväl som med TAF2I.

Interaktioner

TAF12 har visats interagera med TAF9 och transkriptionsinitieringsprotein SPT3 homolog .

Vidare läsning

•   Schweisguth DC, Hammerstedt RH (1992). "Utvärdering av plasmamembranstabilitet genom tvättmedelsinducerad ruptur av osmotiskt svullna spermier". J. Biochem. Biophys. Metoder . 24 (1–2): 81–94. doi : 10.1016/0165-022X(92)90049-G . PMID 1560184 .
•    Zhou Q, Sharp PA (1995). "Ny mekanism och faktor för reglering av HIV-1 Tat" . EMBO J . 14 (2): 321–8. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086 . PMID 7835343 .
•   Parada CA, Yoon JB, Roeder RG (1995). "En ny LBP-1-medierad restriktion av HIV-1-transkription på nivån av förlängning in vitro" . J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83. doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 .
•    Ou SH, Garcia-Martínez LF, Paulssen EJ, Gaynor RB (1994). "Roll av flankerande E-box-motiv i humant immunbristvirus typ 1 TATA-elementfunktion" . J. Virol . 68 (11): 7188–99. doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158 . PMID 7933101 .
•    Kashanchi F, Piras G, Radonovich MF, Duvall JF, Fattaey A, Chiang CM, Roeder RG, Brady JN (1994). "Direkt interaktion av human TFIID med HIV-1-transaktivatorn tat". Naturen . 367 (6460): 295–9. Bibcode : 1994Natur.367..295K . doi : 10.1038/367295a0 . PMID 8121496 . S2CID 4362048 .
•    Hoffmann A, Chiang CM, Oelgeschläger T, Xie X, Burley SK, Nakatani Y, Roeder RG (1996). "En histonoktamerliknande struktur inom TFIID". Naturen . 380 (6572): 356–9. Bibcode : 1996 Natur.380..356H . doi : 10.1038/380356a0 . PMID 8598932 . S2CID 4263436 .
•   Choi BI, Bando M, Hasegawa S, Horikoshi M (1996). "Isolering och karakterisering av ett cDNA som kodar för en ny human transkriptionsfaktor TFIID-subenhet som innehåller likheter med histoner H2B och H3". Gene . 169 (2): 263–7. doi : 10.1016/0378-1119(95)00838-1 . PMID 8647459 .
•   Hoffmann A, Roeder RG (1996). "Kloning och karakterisering av mänsklig TAF20/15. Flera interaktioner tyder på en central roll i TFIID-komplexbildning" . J. Biol. Chem . 271 (30): 18194–202. doi : 10.1074/jbc.271.30.18194 . PMID 8663456 .
•   Wang Z, Morris GF, Rice AP, Xiong W, Morris CB (1996). "Vildtyp och transaktiveringsdefekta mutanter av humant immunbristvirus typ 1 Tat-protein binder humant TATA-bindande protein in vitro". J. Acquir. Immunbrist. Syndr. Brum. Retrovirol . 12 (2): 128–38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 .
•    Pendergrast PS, Morrison D, Tansey WP, Hernandez N (1996). "Mutationer i den karboxiterminala domänen av TBP påverkar syntesen av humant immunbristvirus typ 1 fullängds- och korta transkript på liknande sätt" . J. Virol . 70 (8): 5025–34. doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456 . PMID 8764009 .
•    Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "Interaktion av humant immunbristvirus typ 1 Tat med en unik plats för TFIID hämmar negativ kofaktor Dr1 och stabiliserar TFIID-TFIIA-komplexet" . J. Virol . 70 (8): 5503–10. doi : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996 . PMC 190508 . PMID 8764062 .
•    Zhou Q, Sharp PA (1996). "Tat-SF1: kofaktor för stimulering av transkriptionell förlängning av HIV-1 Tat". Vetenskap . 274 (5287): 605–10. Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451 . S2CID 13266489 .
•   Tao Y, Guermah M, Martinez E, Oelgeschläger T, Hasegawa S, Takada R, Yamamoto T, Horikoshi M, Roeder RG (1997). "Specifika interaktioner och potentiella funktioner hos mänsklig TAFII100" . J. Biol. Chem . 272 (10): 6714–21. doi : 10.1074/jbc.272.10.6714 . PMID 9045704 .
•   García-Martínez LF, Ivanov D, Gaynor RB (1997). "Association av Tat med renade HIV-1- och HIV-2-transkriptionsförinitieringskomplex" . J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 .
•    Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkriptionsfaktor TFIID rekryterar faktor CPSF för bildning av 3'-änden av mRNA". Naturen . 389 (6649): 399–402. Bibcode : 1997Natur.389..399D . doi : 10.1038/38763 . PMID 9311784 . S2CID 4413324 .
•    Ogryzko VV, Kotani T, Zhang X, Schiltz RL, Howard T, Yang XJ, Howard BH, Qin J, Nakatani Y (1998). "Histonliknande TAF inom PCAF histonacetylaskomplexet" . Cell . 94 (1): 35–44. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81219-2 . PMID 9674425 . S2CID 18942972 .
•   Vassilev A, Yamauchi J, Kotani T, Prives C, Avantaggiati ML, Qin J, Nakatani Y (1998). "400 kDa-underenheten av PCAF-histonacetylaskomplexet tillhör ATM-superfamiljen" . Mol. Cell . 2 (6): 869–75. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80301-9 . PMID 9885574 .
•    Gangloff YG, Werten S, Romier C, Carré L, Poch O, Moras D, Davidson I (2000). "De mänskliga TFIID-komponenterna TAF(II)135 och TAF(II)20 och SAGA-jästkomponenterna ADA1 och TAF(II)68 heterodimeriseras för att bilda histonliknande par" . Mol. Cell. Biol . 20 (1): 340–51. doi : 10.1128/MCB.20.1.340-351.2000 . PMC 85089 . PMID 10594036 .
•    Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (2001). "UV-skadat DNA-bindande protein i TFTC-komplexet kopplar DNA-skada igenkänning till nukleosomacetylering" . EMBO J . 20 (12): 3187–96. doi : 10.1093/emboj/20.12.3187 . PMC 150203 . PMID 11406595 .

externa länkar

• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q16514 (Transcription initiation factor TFIID subunit 12) på PDBe-KB .