StAR-relaterad överföringsdomän
START | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identifierare | |||||||||
Symbol | START | ||||||||
Pfam | PF01852 | ||||||||
Pfam klan | CL0209 | ||||||||
InterPro | IPR002913 | ||||||||
SMART | START | ||||||||
SCOP2 | 1em2 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
OPM superfamilj | 138 | ||||||||
OPM-protein | 1ln1 | ||||||||
Membran | 564 | ||||||||
|
START- | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
domänidentifierare | |||||||||
Symbol | START | ||||||||
Pfam | PF01852 | ||||||||
InterPro | IPR002913 | ||||||||
SMART | START | ||||||||
SCOP2 | 1em2 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 9.B.64 | ||||||||
CDD | cd00177 | ||||||||
|
START ( StAR-relaterad lipid-transfer ) är en lipidbindande domän i StAR, HD-ZIP och signalproteiner. Den arketypiska domänen finns i StAR ( Steroidogenic acute regulatory protein ), ett mitokondrieprotein som syntetiseras i steroidproducerande celler. StAR initierar steroidproduktion genom att förmedla leveransen av kolesterol till det första enzymet i den steroidogena vägen. START-domänen är avgörande för denna aktivitet, kanske genom bindningen av kolesterol. Efter upptäckten av StAR identifierades 15 START-domäninnehållande proteiner (benämnda STARD1 till STARD15) i ryggradsdjur såväl som andra som är relaterade.
Tusentals proteiner som innehåller minst en START-domän har bestämts i ryggradslösa djur , bakterier och växter för att bilda en större superfamilj, olika känd som START, Bet v1 -liknande eller SRPBCC (START/RHOalphaC/ PITP /Bet v1/CoxG/CalC) domän proteiner, som alla binder hydrofoba ligander. När det gäller växter faller många av START-proteinerna i kategorin förmodade lipid/sterolbindande homeodomän (HD) transkriptionsfaktorer eller HD-START-proteiner.
Representanter för START-domänfamiljen binder olika substanser eller ligander såsom steroler (t.ex. StAR eller STARD1) och lipider som fosfatidylkolin ( fosfatidylkolinöverföringsprotein , även kallat PCTP eller STARD2) och har enzymatiska aktiviteter. Ligandbindning av START-domänen i multidomänproteiner kan också reglera aktiviteterna för de andra domänerna , såsom RhoGAP-domänen , homeodomänen och tioesterasdomänen .
Strukturera
Kristallstrukturen för START-domänen av humant MLN64 visar en alfa/beta-veck byggd runt en U-formad ofullständig beta-fat. Viktigast av allt är att det inre av proteinet omfattar en 26 × 12 × 11 Ångström hydrofob tunnel som uppenbarligen är tillräckligt stor för att binda en enda kolesterolmolekyl. - domänstrukturen avslöjade en oväntad likhet med den för björkpollenallergenet Bet v 1 och med bakteriella polyketidcyklaser /aromataser.
Humana proteiner som innehåller START-domänen
START-domäninnehållande proteiner hos människan är indelade i fem underfamiljer. Ett undantag är StarD9 vars aktivitet förblir okänd. Andra proteiner finns också i människan med domäner som är medlemmar av den START-baserade superfamiljen som PITP, men som inte är en del av själva START-domänen.
Mutationer i STAR D9 (KIF16A) har associerats med ett syndrom som inkluderar svår ID, karakteristiska egenskaper, epilepsi, förvärvad mikrocefali och blindhet. STAR D9-genen kodar för ett 4,7 kiloDalton aminosyraprotein som är en medlem av kinesinsuperfamiljen . C-terminalt trunkerade STAR D9-mutanter är kända från experimentellt arbete för att inducera spindelsammansättningsdefekter. I det rapporterade fallet hittades flera mitotiska defekter inklusive multipolär spindelbildning, fragmentering av pericentriolära material och centrosomamplifiering.
Kolesterol/oxysterolbindande StarD1/D3-underfamilj
Dessa proteiner sysslar främst med kolesteroltransport
- StAR (STARD1)
- MLN64 ( STARD3 )
StarD4 underfamilj
Dessa proteiner är involverade i kolesterol- och oxysteroltransport
Fosfolipid/sfingolipidbindande StarD2-underfamilj
- Fosfatidylkolin överföringsprotein (PCTP/STARD2)
- STARD7
- STARD10
- Kollagen typ IV alfa-3-bindande protein (COL4A3BP/Ceramid överföringsprotein (CERT)/STARD11)
SAM-RhoGAP-START underfamilj
Dessa proteiner innehåller både START-domänen och Rho-GTPas-signaleringsaktivitet
Acyl-CoA tioesteras underfamilj
Medlemmarna i denna underfamilj besitter START-domänen och tioesterasaktivitet