Salmonella enterica subsp. enterica
|
|
| Salmonella enterica subsp. enterica | |
|---|---|
| Salmonella Typhimurium kolonier på en Hektoen enterisk agarplatta | |
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Pseudomonadota |
| Klass: | Gammaproteobakterier |
| Beställa: | Enterobacterales |
| Familj: | Enterobacteriaceae |
| Släkte: | Salmonella |
| Arter: | |
| Underarter: |
S.e. subsp. enterica
|
| Trinomiellt namn | |
|
Salmonella enterica subsp. enterica |
|
Salmonella enterica subsp. enterica är en underart av Salmonella enterica , den stavformade, flagellerade , aeroba, gramnegativa bakterien . Många av de patogena serovarierna av S. enterica -arterna finns i denna underart, inklusive den som är ansvarig för tyfus .
Serovars
S. enterica subsp. enterica innehåller ett stort antal serovarier som kan infektera ett brett spektrum av ryggradsdjursvärdar . De enskilda medlemmarna sträcker sig från att vara mycket värdanpassade (bara kan infektera ett smalt spektrum av arter) till att visa ett brett värdområde. Ett antal tekniker används för närvarande för att skilja mellan serotyper . Dessa inkluderar att leta efter närvaron eller frånvaron av antigener , fagtypning , molekylär fingeravtryck och biotypning, där serovarier är differentierade efter vilka näringsämnen de kan fermentera. En möjlig faktor för att bestämma värdintervallet för särskilda serovarier är fagförmedlat förvärv av ett litet antal genetiska element som möjliggör infektion av en viss värd. Det postuleras vidare att serovarer som infekterar ett smalt spektrum av arter har avvikit från förfäder med ett brett värdområde och har sedan dess specialiserat sig och förlorat förmågan att infektera vissa värdar.
Ett urval av serovar, med kända värdar listade. Eftersom det finns mer än 2500 serovarer av Salmonella enterica subsp. enterica , den här listan är ofullständig.
| Serovar | Värd art |
|---|---|
| Salmonella Choleraesuis | Svin |
| Salmonella Dublin | Nötkreatur |
| Salmonella enteritidis | Människor, gnagare, galliformes |
| Salmonella Gallinarum | Galliformes |
| Salmonella Hadar | Människor, galliformer, kaniner |
| Salmonella Heidelberg | Människor, galliformes, svin |
| Salmonella Infantis | Människor, fjäderfä |
| Salmonella Paratyphi | Människor |
| Salmonella Typhi | Människor |
| Salmonella Typhimurium | Människor, nötkreatur, svin, får, hästar, gnagare, galliformes |
En studie av data från 37 länder som samlats in mellan 2001 och 2007 fann att den vanligaste serovar av Salmonella isolerad från mänskliga fall var Enteritidis, som hittades i i genomsnitt 43,5 % av fallen, följt av Typhimurium (17,1 % av fallen), Newport (3,5). %), Infantis (1,8 %), Virchow (1,5 %), Hadar (1,5 %) och Agona (0,8 %).
En stam av Salmonella som nyligen har dykt upp i USA är S. enterica ser. Javiana. "Ett utbrott inträffade 2002, det var 141 fall som inträffade bland deltagarna i US Transplant Games. Av de 141 fallen var de flesta fallen antingen transplanterade (34%) eller personer som fick immunsuppressiv terapi (32%)" . Det finns ett ökande antal Salmonellaserotyper som är multiresistenta (MDR), vilket identifierades av CDC :s nationella övervakningssystem för antimikrobiell resistens. " Salmonella Javiana [ sic ] orsakar 4% av icke-tyfodial Salmonella- infektioner i USA varje år."
I november 2016 dök en ny stam av extensivt läkemedelsresistent (XDR) Salmonella enterica serovar Typhi upp i Pakistan, främst från städerna Hyderabad och Karachi . Multiresistenta stammar har funnits sedan slutet av 1970-talet i Afrika och Asien. Dessa XDR-stammar är resistenta mot alla antibiotikabehandlingsalternativ: kloramfenikol , ampicillin , trimetoprim-sulfametoxazol , fluorokinoloner och tredje generationens cefalosporiner . Utbrottet har pågått sedan 2016.
Ämnesomsättning
Genetiska bevis tyder på att serovarerna kan delas in i två grupper – en som orsakar enterisk infektion och har en bred repertoar av metaboliska förmågor, och en som vanligtvis orsakar invasiv infektion, ofta i ett smalt spektrum av värdar, och visar nedbrytning av anaeroba metaboliska vägar . . Man tror att dessa metaboliska förmågor är viktiga för att få näringsämnen i den utmanande och näringsbegränsade inflammerade tarmmiljön.
Nomenklatur
Serovarierna kan betecknas fullständigt eller i förkortad form. Den korta formen listar släktet Salmonella , som följs av den inte kursiverade serovaren med versaler, t.ex. Salmonella Typhi, medan den fullständiga beteckningen för Salmonella Typhi är Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi. Varje serovar kan också ha många stammar, vilket möjliggör en snabb ökning av det totala antalet antigeniskt variabla bakterier.
Epidemiologi
Invasiva stammar av icke-tyfus Salmonella , såsom Salmonella Typhimurium ST313, har nyligen märkts som orsakande av nya sjukdomar i Afrika. Viktiga värdimmunbrister associerade med hiv , malaria och undernäring har bidragit till en stor spridning av denna sjukdom och behovet av att använda dyra antimikrobiella läkemedel i världens fattigaste hälsovård. Men även bakteriella faktorer, såsom uppreglerad aktivitet av virulensgenen pgtE , på grund av en enkel nukleotidpolymorfism (SNP) i dess promotorregion, har visat sig ha en stor inverkan på patogenesen av denna speciella Salmonella -sekvenstyp.