Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
SYNPO2 -identifierare
, synaptopodin 2, SYISL
Externa ID:n
Wikidata
Myopodinprotein , även kallat Synaptopodin-2 är ett protein som hos människor kodas av SYNPO2 - genen . Myopodin uttrycks i hjärtmuskeln , glatt muskulatur och skelettmuskulatur och lokaliseras till Z-skivor strukturer.
Strukturera
Myopodin är ett protein på 117,4 kDa som består av 1093 aminosyror, även om fyra alternativt splitsade isoformer har beskrivits. Myopodin innehåller ett PPXY-motiv, flera PXXP-motiv och två potentiella nukleära lokaliseringssekvenser (en N-terminal och en C-terminal ) . PPXY-motiv har visats förmedla interaktioner , och PXXP-motiv representerar potentiella interaktionsställen för SH3 -domäninnehållande proteiner. Myopodin innehåller ett nytt aktinbindningsställe (mellan aminosyrorna 410 och 563) i mitten av proteinet.
Fungera
Under myotubdifferentiering interagerar myopodin med stressfibrer innan det samlokaliseras med alfaaktinin-2 vid Z-skivor i mogna tvärstrimmiga muskelceller. Myopodin har visat sig pendla mellan kärnan och cytoplasman i myoblaster och myotuber som svar på stress; dess export från kärnan är känslig för lemtomycin B. Den nukleära lokaliseringen av myopodin är känslig för Importin 13 , som direkt binder myopodin och underlättar dess translokation. Importinbindning och nukleär import av myopodin tycks förmedlas av serin / treonin -fosforyleringsberoende bindning av myopodin till 14-3-3 beta Myopodin tycks reglera uppdelad, intracellulär signaltransduktion mellan Z-skivan och kärnan i hjärtmuskelceller , genom bildar ett Z-skiva signaleringskomplex med alfaaktinin-2 , kalcineurin , CaMKII , muskelspecifikt A-kinasförankringsprotein och myomegalin . Specifikt underlättar fosforylering av proteinkinas A eller CaMKII och defosforylering med kalcineurin bindningen respektive frisättningen av 14-3-3-beta och motsvarande nukleära eller cytoplasmatiska lokalisering av myopodin.
Interaktioner
Myopodin interagerar med:
Vidare läsning
Houlgatte R, Mariage-Samson R, Duprat S, Tessier A, Bentolila S, Lamy B, Auffray C (okt 1995). "The Genexpress Index: en resurs för genupptäckt och den generiska kartan över det mänskliga genomet" . Genomforskning . 5 (3): 272–304. doi : 10.1101/gr.5.3.272 PMID 8593614 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (november 2000). "DNA-kloning med användning av platsspecifik rekombination in vitro" . Genomforskning . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (mars 2001). "Mot en katalog av mänskliga gener och proteiner: sekvensering och analys av 500 nya kompletta proteinkodande humana cDNAs" . Genomforskning . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (sep 2000). "Systematisk subcellulär lokalisering av nya proteiner identifierade genom storskalig cDNA-sekvensering" . EMBO-rapporter . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 PMID 11256614 .
Van Impe K, De Corte V, Eichinger L, Bruyneel E, Mareel M, Vandekerckhove J, Gettemans J (maj 2003). "Det nukleo-cytoplasmatiska aktinbindande proteinet CapG saknar en nukleär exportsekvens som finns i strukturellt besläktade proteiner" . Journal of Biological Chemistry . 278 (20): 17945–52. doi : 10.1074/jbc.M209946200 PMID 12637565 .
Sanchez-Carbayo M, Schwarz K, Charytonowicz E, Cordon-Cardo C, Mundel P (aug 2003). "Tumördämpande roll för myopodin vid cancer i urinblåsan: förlust av nukleärt uttryck av myopodin är cellcykelberoende och förutsäger kliniskt resultat. " Onkogen . 22 (34): 5298–305. doi : 10.1038/sj.onc.1206616 PMID 12917631 .
Jing L, Liu L, Yu YP, Dhir R, Acquafondada M, Landsittel D, Cieply K, Wells A, Luo JH (maj 2004). "Uttryck av myopodin inducerar undertryckande av tumörtillväxt och metastaser" . American Journal of Pathology . 164 (5): 1799–806. doi : 10.1016/S0002-9440(10)63738-8 . PMC 1615646 PMID 15111326 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (okt 2004). "Från ORFeome till biologi: en funktionell genomikpipeline" . Genomforskning . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 PMID 15489336 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Jan 2006). "LIFEdb-databasen 2006" . Nukleinsyraforskning . 34 (Databasproblem): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 PMID 16381901 .
