Rafael Irizarry (vetenskapsman)

Rafael Irizarry
Född	Rafael Angel Irizarry
Alma mater	Universitetet i Puerto Rico vid Río Piedras ( BS ) University of California, Berkeley ( MA , PhD )
Känd för	Bioledare
Utmärkelser	COPSS Presidents' Award (2009) Benjamin Franklin Award (2017) ISCB Fellow (2020)
Vetenskaplig karriär
Fält	Statistik Biostatistik Datavetenskap Genomik Epigenetik
Avhandling	Statistik och musik: Anpassa en lokal harmonisk modell till musikaliska ljudsignaler ( 1998)
Doktorand rådgivare	David R. Brillinger
Hemsida	rafalab .org

Rafael Irizarry är professor i biostatistik vid Harvard TH Chan School of Public Health och professor i biostatistik och beräkningsbiologi vid Dana–Farber Cancer Institute . Irizarry är känd som en av grundarna av Bioconductor -projektet.

Utbildning

Irizarry tog sin kandidatexamen i matematik från University of Puerto Rico i Río Piedras 1993, följt av en Master of Arts- examen från University of California, Berkeley 1994. Han fortsatte sina studier vid Berkeley och tog en doktorsexamen i statistik i 1998. Hans doktorsavhandling undersökte användningen av statistik för att modellera harmonier i ljudsignaler och handledes av David R. Brillinger .

Forskning och karriär

Irizarry började på Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health 1998, där hans forskning fokuserade på genomik och beräkningsbiologi . Han har arbetat med analys och bearbetning av data som härrör från mikroarrayexperiment och hjälpt till att utveckla metoden Robust Multiarray Analysis (RMA) för mikroarrayanalys i samarbete med statistikern Terry Speed ​​och kollegor; denna metod utökades senare som den frysta RMA-metoden (fRMA). Han har också arbetat med analys av nästa generations sekvenseringsdata .

Irizarry är en av grundarna av Bioconductor -projektet, ett program med öppen källkod och utvecklingsprogram för analys av genomisk data i programmeringsspråket R. Han har varit involverad i utvecklingen av flera av de mest använda Bioconductor-paketen, inklusive 'affy'-paketet för analys av Affymetrix -mikroarraydata.

Irizarry är utvecklare och instruktör för onlinekursen Data Analysis for Life Sciences på Harvard University edX -plattformen; denna kurs registrerar över 30 000 studenter per år.

Pris och ära

2009 COPSS Presidents' Award i statistik.

2009 Mortimer Spiegelman Award från American Public Health Association som ges till framstående folkhälsostatistiker under 40 år.

2017 Benjamin Franklin Award i bioinformatik för hans främjande av gratis och öppen tillgång material och metoder inom biovetenskap.

Han valdes till Fellow i International Society for Computational Biology 2020.