Pseudomonas oryzihabitans
| Pseudomonas oryzihabitans | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Pseudomonadota |
| Klass: | Gammaproteobakterier |
| Beställa: | Pseudomonadales |
| Familj: | Pseudomonadaceae |
| Släkte: | Pseudomonas |
| Arter: |
P. oryzihabitans
|
| Binomialt namn | |
|
Pseudomonas oryzihabitans Kodoma, et al. , 1985
|
|
| Typ stam | |
|
ATCC 43272 |
|
| Synonymer | |
|
|
Pseudomonas oryzihabitans är en icke-fermenterande gulpigmenterad, gramnegativ , stavformad bakterie som kan orsaka sepsis , peritonit , endoftalmit och bakteriemi . Det är en opportunistisk patogen hos människor och varmblodiga djur som ofta finns i flera miljökällor, från jord till risfält. De kan särskiljas från andra icke-fermentorer genom deras negativa oxidasreaktion och aeroba karaktär. Denna organism kan infektera individer som har allvarliga sjukdomar, inklusive de som genomgår operation eller med katetrar i kroppen. Baserat på 16S RNA- analysen har dessa bakterier placerats i Pseudomonas putida- gruppen.
Historia
En del av släktet Pseudomonas , som ursprungligen beskrevs 1894, identifierades först i urin- och gastrointestinala prover 1928 av två forskare, EG Dresel och O Stickl. Till en början hette denna organism Chromobacterium typhiflavuum eftersom den liknade bakterierna som orsakade magfeber . Namnbytet till Pseudomonas oryzihabitans skedde 1985 efter att vetenskapsmannen Kentaro Kodama och hans team isolerade bakterierna från ett risfält och fann att det hade en fenotypisk likhet med pseudomonas-organismerna. Denna organism har också isolerats i sjukhusmiljön från en mängd olika platser såsom sår, ögon, hud, öron och flera andra platser, även om de också kan hittas i fuktiga miljöer. I dagsläget är det lite känt om de patogena egenskaperna hos P. oryzihabitans , så eventuella virulenta stammar kan inte beskrivas eller identifieras absolut.
Patogenes
Pseudomonas oryzihabitans , även om det är en ovanlig patogen, kan orsaka infektioner hos individer som vanligtvis har nedsatt immunförsvar . Även om de flesta stammar av denna bakterie inte orsakar infektioner, har de patienter som förvärvar P. oryzihabitans med största sannolikhet en underliggande sjukdom, och den sprider sig medan patienterna är inlagda på sjukhus. Detta inkluderar patienter som nyligen har opererats och även de som drabbats av sjukdomar som AIDS , leukemi och andra sjukdomar som har en skadlig effekt på immunsystemet.
Från flera studier som involverar fall av P. oryzihabitans visar forskning att det finns ett nära samband mellan infektion, underliggande sjukdom och förekomsten av katetrar hos patienter. Detta innebär att infektioner förekommer mest hos personer som har en försvagande sjukdom och har konstgjorda material i sina kroppar. Tillsammans med katetrar, P. oryzihabitans vanligast på platser som är involverade med andningsutrustning och enheter för kontinuerlig ambulatorisk dialys, och dessa bakterier kan spridas genom förorenade vätskor och osteriliserade eller smutsiga medicinska verktyg. Om så är fallet är det viktigt att hygienen upprätthålls internt och externt för att hjälpa till att stoppa spridningen av bakterierna och förhindra infektionssjukdomar. Infektioner kan vara antingen nosokomiellt förvärvade, vilket innebär att bakterierna har sitt ursprung under en patients varaktighet på sjukhuset fyrtioåtta timmar efter inläggningen, eller så är de samhällsförvärvade, vilket innebär att patienten hade tecken på infektion före inläggningen eller under de första fyrtio. - åtta timmar på sjukhuset.
De flesta infektioner resulterar i bakteriemi hos patienter som är extremt sjuka eller peritonit hos individer som genomgår ambulatorisk peritonealdialys konsekvent. Flera rapporter om infektioner som dessa bakterier orsakar är korrelerade med patienter som har AIDS. P. oryzihabitans identifieras alltmer som en orsak till opportunistiska infektioner och drar fördel av svaga immunsystem hos människor. Det är dock sällsynt att infektionen eskalerar till sepsis, men det har förekommit fall där patienter har fått sjukdomen. Även om dessa bakterier kan orsaka infektioner, är dess roll som patogen tveksam eftersom detta inte händer särskilt ofta. [ citat behövs ]
Diagnos/symptom
Symtom på en infektion av P. oryzihabitans är faktiskt ganska vaga och liknar de tecken som kan indikera andra sjukdomar eller sjukdomar, så det är relativt svårt att identifiera när man bara tittar på symtom. Men i flera fall uppstår dessa infektioner efter att en individs immunförsvar har försvagats, så det är troligt att det inträffar hos tillfrisknande eller sjuka patienter. De flesta patienter, efter att ha fått behandling för en annan sjukdom eller under återhämtning från operation, upplever frossa och ökad kroppstemperatur. Även om dessa symtom kan betyda en mängd olika saker, är det tydligt att patientens återhämtning stoppas och att det finns en infektion av något slag. I ett exempel där en kvinna utvecklade en infektion av P. oryzihabitans från ett fall av bihåleinflammation , upplevde hon samma frossa och förhöjda temperaturer, men också näsa flytningar innehållande pus, smärta i höger ansikte och feber.
För att fastställa att dessa patienter är infekterade med Pseudomonas oryzihabitans, samlas blodprover in för tester och skickas för att kulturer ska identifieras. Eftersom förekomsten av dessa bakterier från början kanske inte är känd av några symtom, kommer det att hjälpa till att behandla den om de identifieras i ett labb. I vissa situationer identifieras dess roll som patogen också genom bevis på pulmonella tecken och symtom, röntgenbilder och positiva blododlingar.
Behandling
I tidigare rapporterade fall av P. oryzihabitans fick patienterna antibiotika för att behandla infektionen. Dessa bakterier är ganska lätta att behandla, med en rad antibiotika som de är mottagliga för. De antibiotika som infektionssjukdomen svarade på är gentamicin, ciprofloxacin, karbapenemer, cephalosprins, aminoglykosider och kinoloner. Även om det finns flera typer av läkemedel som kan behandla P. oryzihabitans , visade karbapenem de bästa resultaten mot infektioner . I en studie där kulturer av dessa bakterier odlades visade tester att alla isolaten var mottagliga för karbapenemantibiotika, men sårbarheten för andra läkemedel skilde sig mellan grupperna. Tidigare studier visade också att P. oryzihabitans var mottagliga in vitro för antipseudomonala penicilliner . Behandlingarna för bakterierna skiljer sig åt och beror på värden och de olika stammarna av P. oryzihabitans . [ citat behövs ]
Motstånd
De typer av antibiotika som P. oryzihabitans är resistenta mot ampicillin, amoxicillin-klavulansyra och cefazolin. Eftersom dessa bakterier inte är lika skadliga eller virulenta för värden, bör antibiotika åtgärda infektionen, men i vissa fall, eftersom de kan hittas runt protesmaterial, krävs att katetern tas bort.
Förebyggande
För att förhindra en infektion från dessa bakterier krävs god hygien, särskilt när främmande material eller föremål som katetrar finns i kroppen. Men även detta kan inte helt förhindra P. oryzihabitans på grund av miljöföroreningar som kan leda till förvärv av denna organism.
Vid patienter med innestående katetrar bör särskild försiktighet iakttas så att en samhällsförvärvad infektion inte uppstår. Det rekommenderas att dessa personer bör undvika att använda badsvampar och våta föremål för hudvård, eftersom dessa kan vara platser för tillväxt och kontaminering av bakterierna.
Ekologi
Genom att studera miljöerna där P. oryzihabitans finns kan forskare få en tydligare bild av hur infektioner uppstår och hur dessa bakterier kan hittas på individer utanför sjukhus. Även om bakterierna kan förvärvas nosokomiellt måste miljön beaktas som värd för dem. Dessa bakterier, medan de observeras på sjukhus, kan ursprungligen hittas i fuktiga miljöer som platser med vatten, stillastående eller rinnande, och jord. Data indikerar att miljökällor kan vara en orsak till utvecklingen av en infektionssjukdom, liksom förekomsten av främmande föremål i kroppen.
Dessa bakterier studerades först på djupet och identifierades efter att de isolerats från en rismark .
I en studie fann forskare att P. oryzihabitans förorenade dricksvattenförsörjningen och ifrågasatte om dessa bakterier är vanliga i naturligt distribuerat vatten. Vattenförsörjningssystemen var i kontakt med ett föremål som är direkt anslutet till sänkhål , som är kända platser där bakterierna kan dröja kvar. Eftersom sjunkhål är stora underjordiska hålrum, har de tillräckligt med utrymme för att främja vatten, vilket gör denna miljö till en idealisk plats för P. oryzihabitans att växa. [ citat behövs ]
Dessa bakterier kan finnas kvar i biofilmer där de är relativt skyddade från klordesinfektion. Deras närvaro i dricksvatten beror på detta faktum.
När en infektion orsakad av P. oryzihabitans rapporterades hos en patient med AIDS och en inneboende kateter tog forskare prover från mannens hem för att se var dessa bakterier fanns och för att ta reda på en möjlig förklaring till hans infektion. Patienten hävdade att han följde de strikta hygieniska riktlinjerna för katetrar, så en miljöfaktor är ansvarig för infektionen. Det slutade med att de spårade bakteriernas ursprung till en badsvamp. För att forskarna skulle kunna validera dessa fynd testade de även badsvampar från andra hushåll och hittade även P. oryzihabitans i några separata prover. Detta tyder på att vattnet kan vara förorenat med dessa bakterier, vilket i sin tur kan leda till potentiella infektioner hos vissa individer.
Klinisk signifikans
Infektioner från P. oryzihabitans förknippas alltmer med kateterrelaterad bakteriemi, bukhinneinflammation, sårinfektioner och meningit (efter operation), mestadels hos patienter med sjukdomar som avsevärt försvagar individen.
Främmande material som finns i kroppen predisponerar patienter för infektioner, såväl som de med kraftigt försvagat immunförsvar.
De flesta fall är nosokomiellt förvärvade, men det finns infektioner som upptäcks vid inläggning på sjukhus. Det finns också fall där P. oryzihabitans var en orsak till sepsis hos vissa människor. Den enda andra oxidasnegativa Pseudomonas är P. luteola .
Fysiologi
Cellerna hos Pseudomonas oryzihabitans är stavar med rundade ändar. Dessa gramnegativa bakterier kan röra sig på grund av ett flagellum , och cellerna förekommer enskilt och mycket sällan i par. Stammar av dessa bakterier producerar ett gult vattenolösligt pigment i sina celler.
Deras ämnesomsättning är begränsad till ett aerobt andningsorgan. De är oxidativa men inte fermentativa, och när de isoleras och odlas sker deras tillväxt på MacConkey-agar och SS-agar.