Peptidoglykanglykosyltransferas

peptidoglykanglykosyltransferasidentifierare
_
EG nr. 2.4.1.129
CAS-nr. 79079-04-2
Databaser
IntEnz IntEnz-vy
BRENDA BRENDA inträde
ExPASy NiceZyme-vy
KEGG KEGG inträde
MetaCyc Metabolisk väg
PRIAM profil
PDB- strukturer RCSB PDB PDBe PDB summa
Genontologi AmiGO / QuickGO
Sök
PMC artiklar
PubMed artiklar
NCBI proteiner

Peptidoglykanglykosyltransferas ( EC 2.4.1.129 ) är ett enzym som används vid biosyntesen av peptidoglykan . Den överför en disackaridpeptid från ett donatorsubstrat för att syntetisera en glykankedja .

Detta enzym tillhör familjen glykosyltransferaser , närmare bestämt hexosyltransferaserna. Det systematiska namnet på denna enzymklass är undekaprenyldifosfo-(N-acetyl-D-glukosaminyl-(1->4)-(N-acetyl-D-mu ramoylpentapeptid):undekaprenyldifosfo-(N-acetyl-D-glukosaminyl-( 1 ->4)-N-acetyl-D-muramoylpentapeptid) disackaridtransferas . Andra namn som används ofta inkluderar PG-II , baktoprenyldifosfo-N-acetylmuramoyl-(N-acetyl-D-glukosaminyl)- , pentapeptid:peptidoglykan , N-acetylmuramoyl- N-acetyl-D-glukosaminyltransferas , penicillinbindande protein (3 eller 1B) och peptidoglykantransglykosylas .

Fungera

Peptidoglykanglykosyltransferas kopplar Lipid II-subenheter för att syntetisera peptidoglykankedjorna. Transpeptidaser tvärbinder kolhydratkedjorna för att tillhandahålla ramverket för cellväggen.

Det katalyserar den kemiska reaktionen

[GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac ( oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-difosfoundkaprenol + GlcNAc-(1->4 )-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-difosfoundkaprenol ⇌ [GlcNAc-(
1-
>4)-Mur 2 Ac(oyl-L -Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n + 1- difosfoundkaprenol + undekaprenyldifosfat

De 2 substraten för detta enzym är

  • [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n-difosfoundkaprenol,
  • GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)-difosfoundkaprenol,

medan dess 2 produkter är

  • [GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n+1-difosfoundkaprenol, och
  • undekaprenyldifosfat .

Strukturstudier

I slutet av 2007 har 3 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 2BG1 , 2UWX , och 2UWY .