Peptid-N4-(N-acetyl-beta-glukosaminyl)asparaginamidas
| peptid-N4-(N-acetyl-beta-glukosaminyl)asparaginamidas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Rendering baserad på <a i=2>identifierare
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| EG nr. | 3.5.1.52 | ||||||||
| CAS-nr. | 83534-39-8 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är en peptid-N4-(N-acetyl-beta-glukosaminyl)asparaginamidas ( EC 3.5.1.52 ) ett enzym som katalyserar en kemisk reaktion som klyver en N4- ( acetyl - beta-D- glukosaminyl ) asparaginrest i vilken glukosaminresten kan glykosyleras ytterligare för att ge en (substituerad) N-acetyl-beta-D-glukosaminylamin och en peptid innehållande en aspartatrest . Detta enzym tillhör familjen hydrolaser , speciellt de som verkar på andra kol-kvävebindningar än peptidbindningar i linjära amider.
NGLY1 - genen kodar för ortologen för detta enzym hos människor.
Nomenklatur
Det systematiska namnet på denna enzymklass är N-kopplad glykopeptid-(N-acetyl-beta-D-glukosaminyl)-L-asparaginamidohydrolas . Andra namn i vanligt bruk inkluderar:
- glykopeptid N-glykosidas,
- glykopeptidas,
- N-oligosackaridglykopeptidas,
- N-glykanas,
- Jack-bean glykopeptidas,
- PNGase A och
- PNGase F
Strukturstudier
Enzymet använder en katalytisk triad av cystein-histidinaspartat på sitt aktiva ställe för hydrolys genom kovalent katalys . En peptid med liknande funktion upptäcktes 2014 av en grupp vid Fudan University i Shanghai, Kina. Denna peptid klyver också alfa 1,3-kopplingar och har fått namnet PNGase F-II.
Vidare läsning
- Plummer TH, Tarentino AL (okt 1981). "Enkel klyvning av komplexa oligosackarider från glykopeptider med mandelemulsinpeptid: N-glykosidas" . Journal of Biological Chemistry . 256 (20): 10243–6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)68610-2 . PMID 7287707 .
- Takahashi N (juni 1977). "Demonstration av ett nytt amidas som verkar på glykopeptider". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 76 (4): 1194–201. doi : 10.1016/0006-291X(77)90982-2 . PMID 901470 .
- Takahashi N, Nishibe H (dec 1978). "Några egenskaper hos ett nytt glykopeptidas som verkar på aspartylglykosylaminbindningar". Journal of Biochemistry . 84 (6): 1467–73. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a132270 . PMID 738997 .
- Tarentino AL, Gómez CM, Plummer TH (aug 1985). "Deglykosylering av asparaginkopplade glykaner med peptid:N-glykosidas F". Biokemi . 24 (17): 4665–71. doi : 10.1021/bi00338a028 . PMID 4063349 .
