Haplogrupp L5 (mtDNA)
| Haplogrupp L5 | |
|---|---|
| Möjlig ursprungstid | 114 200-126 200 YBP |
| Möjlig ursprungsort | Östafrika , Övre Nildalen |
| Förfader | L2-6 |
| Ättlingar | L5a, L5c |
| Definiera mutationer | 3423, 7972, 12432, 12950 |
Haplogroup L5 är en human mitokondriell DNA (mtDNA) kladd. Det var tidigare känt som L1e .
Distribution
L5 är en liten haplogrupp centrerad i Östafrika . Den högsta frekvensen är i Mbuti -pygméerna från östra Centralafrika med 15 %. Det finns i relativt små frekvenser i Tanzania ( Sandawe och andra), Kenya, Tchad, Etiopien, Sudan, Nubien, Egypten och Saudiarabien.
Haplogrupp L5 har observerats bland exemplar på ökyrkogården i Kulubnarti , Sudan , som härstammar från den tidigkristna perioden (550–800 e.Kr.).
Subklader
Träd
Detta fylogenetiska träd av haplogroup L5 subclades är baserat på uppsatsen av Mannis van Oven och Manfred Kayser Uppdaterat omfattande fylogenetiskt träd av global mänsklig mitokondriell DNA-variation och efterföljande publicerad forskning.
-
Senaste gemensamma förfäder (MRCA)
- L1-6
- L2-6
-
L5
- L5a
- L5a1
- L5a1a
- L5a1b
- L5a1c
- L5a2
- L5a1
- L5c
- L5c1
- L5c2
- L5a
-
L5
- L2-6
- L1-6
- ^ Soares, P; Ermini, L; Thomson, N; Mormina, M; Rito, T; Röhl, A; Salas, A; Oppenheimer, S; MacAulay, V (2009). "Korrigering för renande urval: En förbättrad mänsklig mitokondriell molekylär klocka" . American Journal of Human Genetics . 84 (6): 740–59. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . PMC 2694979 . PMID 19500773 .
- ^ a b van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 okt 2008). "Uppdaterat omfattande fylogenetiskt träd av global mänsklig mitokondriell DNA-variation" . Mänsklig mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
- ^ Sarah A. Tishkoff et al. 2007, historia av klicktalande populationer i Afrika härledd från mtDNA och Y-kromosom genetisk variation. Molecular Biology and Evolution 2007 24(10):2180-2195
- ^ Stevanovitch, A; A. Gilles; E. Bouzaid; R. Kefi; F. Paris; RP Gayraud; JL Spadoni; F. El-Chenawi; E. Béraud-Colomb (29 januari 2004). "Mitokondriell DNA-sekvensmångfald i en stillasittande befolkning från Egypten". Annals of Human Genetics . 68 (1): 23–39. doi : 10.1046/j.1529-8817.2003.00057.x . PMID 14748828 . S2CID 44901197 .
- ^ Abu-Amero et al. 2008 februari. "Mitokondriell DNA-struktur på den arabiska halvön", BMC Evolutionary Biology. 8(45): 52.
-
^
Sirak, Kendra; Frenandes, Daniel; Novak, Mario; Van Gerven, Dennis; Pinhasi, Ron (2016). "Abstract Book of the IUAES Inter-Congress 2016 - En gemenskap splittrad? Avslöjar gemenskapens genom(er) av medeltida Kulubnarti med hjälp av nästa generations sekvensering" . Abstract Book of the Iuaes Inter-Congress 2016 . IUAES: 115.
{{ citera journal }}: CS1 underhåll: använder författarens parameter ( länk )
Anteckningar
externa länkar
- Allmän
- Ian Logans Haplogroups L5.
- Mannis van Ovens Phylotree
|
Fylogenetiska träd av humant mitokondriellt DNA (mtDNA) haplogrupper |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mitokondriellt Eva ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CZ | D | E | G | Q | O | A | S | R | jag | W | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
| C | Z | B | F | R0 | före JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | J | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||