Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
PRPF8
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning:
Identifierare
, pre-mRNA processing factor 8, HPRP8, PRP8, PRPC8, RP13, SNRNP220
Externa IDs
Wikidata
Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 är ett protein som hos människor kodas av PRPF8 -genen .
Fungera
Pre-mRNA splitsning sker i 2 sekventiella transesterifieringssteg. Proteinet som kodas av denna gen är en komponent av både U2- och U12-beroende spliceosomer och har visat sig vara väsentligt för det katalytiska steget II i pre-mRNA-splitsningsprocessen. Den innehåller flera WD-repetitioner, som fungerar i protein-protein-interaktioner. Detta protein har en sekvenslikhet med jäst Prp8-protein. Denna gen är en kandidatgen för autosomal dominant retinitis pigmentosa.
Interaktioner
PRPF8 har visat sig interagera med WDR57 och EFTUD2 .
Vidare läsning
Grainger RJ, Beggs JD (maj 2005). "Prp8-protein: i hjärtat av spliceosomen" . RNA . 11 (5): 533–57. doi : 10.1261/rna.2220705 . PMC 1370742 PMID 15840809 .
Garcia-Blanco MA, Anderson GJ, Beggs J, Sharp PA (april 1990). "Ett däggdjursprotein på 220 kDa binder pre-mRNA i spliceosomen: en potentiell homolog av jäst-PRP8-proteinet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 87 (8): 3082–6. Bibcode : 1990PNAS...87.3082G . doi : 10.1073/pnas.87.8.3082 PMC 53838 PMID 2139226 .
Pinto AL, Steitz JA (november 1989). "Däggdjursanalogen av jäst-PRP8-splitsningsproteinet finns i den lilla kärnribonukleoproteinpartikeln U4/5/6 och spliceosomen. " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 86 (22): 8742–6. Bibcode : 1989PNAS...86.8742P . doi : 10.1073/pnas.86.22.8742 PMC 298364 PMID 2479028 .
Bach M, Winkelmann G, Lührmann R (aug 1989). "20S litet nukleärt ribonukleoprotein U5 visar en överraskande komplex proteinsammansättning" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 86 (16): 6038–42. Bibcode : 1989PNAS...86.6038B . doi : 10.1073/pnas.86.16.6038 PMC 297770 PMID 2527369 .
Anderson GJ, Bach M, Lührmann R, Beggs JD (dec 1989). "Bevarande mellan jäst och människa av ett protein associerat med U5 litet nukleärt ribonukleoprotein". Naturen . 342 (6251): 819–21. Bibcode : 1989Natur.342..819A . doi : 10.1038/342819a0 . PMID 2532307 . S2CID 977768 .
Umen JG, Guthrie C (aug 1995). "Prp16p, Slu7p och Prp8p interagerar med 3'-splitsningsstället i två distinkta steg under det andra katalytiska steget av pre-mRNA-splitsning" . RNA . 1 (6): 584–97. PMC 1369303 PMID 7489518 .
Goliath R, Shugart Y, Janssens P, Weissenbach J, Beighton P, Ramasar R, Greenberg J (okt 1995). "Fin lokalisering av platsen för autosomal dominant retinitis pigmentosa på kromosom 17p" . American Journal of Human Genetics . 57 (4): 962–5. PMC 1801525 PMID 7573060 .
Greenberg J, Goliath R, Beighton P, Ramesar R (juni 1994). "Ett nytt lokus för autosomal dominant retinitis pigmentosa på den korta armen av kromosom 17". Human molekylär genetik . 3 (6): 915–8. doi : 10.1093/hmg/3.6.915 . PMID 7951236 .
Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Kojis TL, Heinzmann C, Flodman P, Ngo JT, Sparkes RS, Spence MA, Bateman JB, Heckenlively JR (feb 1996). "Kartförfining av locus RP13 till human kromosom 17p13.3 i en andra familj med autosomal dominant retinitis pigmentosa" . American Journal of Human Genetics . 58 (2): 347–55. PMC 1914553 PMID 8571961 .
Reyes JL, Kois P, Konforti BB, Konarska MM (mars 1996). "Den kanoniska GU-dinukleotiden vid 5'-splitsningsstället känns igen av p220 av U5 snRNP i splitsosomen" . RNA . 2 (3): 213–25. PMC 1369364 PMID 8608445 .
Hinz M, Moore MJ, Bindereif A (aug 1996). "Domänanalys av humant U5-RNA. Cap-trimetylering, proteinbindning och spliceosomsammansättning" . Journal of Biological Chemistry . 271 (31): 19001–7. doi : 10.1074/jbc.271.31.19001 PMID 8702566 .
Chiara MD, Palandjian L, Feld Kramer R, Reed R (aug 1997). "Bevis på att U5 snRNP känner igen 3'-splitsningsstället för katalytiskt steg II hos däggdjur" . EMBO Journal . 16 (15): 4746–59. doi : 10.1093/emboj/16.15.4746 . PMC 1170101 PMID 9303319 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (okt 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (november 1998). "Det humana U5-220kD-proteinet (hPrp8) bildar ett stabilt RNA-fritt komplex med flera U5-specifika proteiner, inklusive ett RNA unwindas, en homolog av ribosomal förlängningsfaktor EF-2 och ett nytt WD-40-protein. " Molekylär och cellulär biologi . 18 (11): 6756–66. doi : 10.1128/mcb.18.11.6756 . PMC 109259 PMID 9774689 .
Reyes JL, Gustafson EH, Luo HR, Moore MJ, Konarska MM (feb 1999). "Den C-terminala regionen av hPrp8 interagerar med den konserverade GU-dinukleotiden vid 5'-splitsningsstället" . RNA . 5 (2): 167–79. doi : 10.1017/S1355838299981785 . PMC 1369749 PMID 10024169 .
Makarov EM, Makarova OV, Achsel T, Lührmann R (maj 2000). "Den mänskliga homologen av jästsplitsningsfaktorn prp6p innehåller flera TPR-element och är stabilt associerad med U5 snRNP via protein-proteininteraktioner". Journal of Molecular Biology . 298 (4): 567–75. doi : 10.1006/jmbi.2000.3685 . PMID 10788320 .
Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (maj 2000). "Pre-mRNA-skarvning förändrar mRNP-sammansättning: bevis för stabil association av proteiner vid exon-exon-korsningar" . Gener & Utveckling . 14 (9): 1098–108. doi : 10.1101/gad.14.9.1098 . PMC 316578 PMID 10809668 .
McHale JC, McKie AB, Tarttelin EE, Inglehearn CF (2000). "Expressionskarta över human kromosomregion 17p13.3, som spänner över RP13 dominant retinitis pigmentosa locus, Miller-Dieker lissencephaly syndrome (MDLS) region och ett förmodat tumörsuppressor locus". Cytogenetik och cellgenetik . 88 (3–4): 225–9. doi : 10.1159/000015556 . PMID 10828595 . S2CID 46632974 .
externa länkar
