Methylacidiphilum infernorum
| Methylacidiphilum infernorum | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: | |
| Klass: |
Oklassificerad
|
| Beställa: |
Methylacidiphilales
|
| Familj: |
Methylacidiphilaceae
|
| Släkte: |
Metylacidiphilum
|
| Arter: |
M. infernorum
|
| Binomialt namn | |
|
Methylacidiphilum infernorum Hou et al. 2008
|
|
| Typstam | |
| Isolat V4 | |
| Synonymer | |
|
|
|
Methylacidiphilum infernorum är en extremt acidofil metanotrofisk aerob bakterie som först isolerades och beskrevs 2007 och växte på jord och sediment på Hell's Gate, Nya Zeeland . Liknande organismer har också isolerats från geotermiska platser i Italien och Ryssland .
en polyextremofil och växer optimalt vid pH mellan 2,0 och 2,5 och en temperatur på 60 °C. Det är en metanotrofisk obligerad bakterie som växer med 25 % (v/v) av metan i luften. Det är också mycket beroende av koldioxidkoncentrationer för att växa, optimalt vid 8 % (v/v) CO 2 i luft.
På grund av sin klassificering i phylum Verrucomicrobiota och dess extrema acidofila fenotyp är M. infernorum unik mellan alla kända metanotrofer .
Biologi
Genom
Den har en enda cirkulär kromosom på 2 287 145 baspar . Under genomanalys fann man att M. infernorum kan använda en ny metylotrofisk väg eftersom den kodar för metanmonooxygenasenzymer men saknar kända genetiska moduler för metanol- och formaldehydoxidation.
Alla enzymer som krävdes för Calvin Benson Bassham-cykeln identifierades genom genetisk analys.
Ämnesomsättning
Det har förutspåtts att M. infernorum har de flesta av de viktigaste metaboliska vägarna för biosyntesen av alla aminosyror, nukleotider och kofaktorer, med det enda undantaget av kobalaminkofaktorn .
Genetiska studier har visat att enzymerna som den använder i flera metabola vägar skiljer sig från de som används av andra metylotrofer som till exempel i biosyntesen av aromatiska aminosyror, liponsyrabiosyntesen, ureacykeln och i antalet och mångfalden av kodade transportörer.
Bakterierna kan motverka extrema sura miljöer tack vare närvaron av olika enzymer som glutamatdekarboxylas , glutamat/γ-aminobutyrat antiporter, arginindekarboxylas och en arginin/agmatin antiporter.
externa länkar
- Methylacidiphilum infernorum på HAMAT (Högkvalitativ automatiserad och manuell anteckning av proteiner)