Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
MBD2
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning:
Identifierare
, DMTase, NY-CO-41, metyl-CpG-bindande domänprotein 2
Externa ID :n
Wikidata
Metyl-CpG-bindande domänprotein 2 är ett protein som hos människor kodas av MBD2 -genen .
Fungera
DNA-metylering är den största modifieringen av eukaryota genom och spelar en viktig roll i utvecklingen av däggdjur. Humana proteiner MECP2 , MBD1 , MBD2 , MBD3 och MBD4 innefattar en familj av nukleära proteiner relaterade till närvaron i var och en av en metyl-CpG-bindande domän (MBD). Vart och ett av dessa proteiner, med undantag för MBD3, kan binda specifikt till metylerat DNA. MECP2, MBD1 och MBD2 kan också undertrycka transkription från metylerade genpromotorer. Proteinet som kodas av dessa gener kan fungera som en förmedlare av de biologiska konsekvenserna av metyleringssignalen. Det rapporteras också att MBD2 och MBD3 rekryterar NuRD- komplexet till DNA-regioner beroende på deras selektiva bindning av metylerade CpG-ställen. Därför definierar MBD2/NuRD och MBD3/NuRD två distinkta proteinkomplex med olika biokemiska och funktionella egenskaper.
Interaktioner
Metyl-CpG-bindande domänprotein 2 har visats interagera med:
Vidare läsning
Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B, Gure AO, Stockert E, Gordan JD, Türeci O, Sahin U, Pfreundschuh M, Old LJ (1998). "Karakterisering av humana tjocktarmscancerantigener som känns igen av autologa antikroppar" . Int. J. Cancer . 76 (5): 652–8. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P PMID 9610721 .
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (1998). "Det dermatomyosit-specifika autoantigenet Mi2 är en komponent i ett komplex som innehåller histon-deacetylas och nukleosomombyggnadsaktiviteter. " Cell . 95 (2): 279–89. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 PMID 9790534 . S2CID 18786866 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (1998). "Kromatindeacetylering av ett ATP-beroende nukleosomombyggnadskomplex". Naturen . 395 (6705): 917–21. Bibcode : 1998Natur.395..917T . doi : 10.1038/27699 . PMID 9804427 . S2CID 4355885 .
Bhattacharya SK, Ramchandani S, Cervoni N, Szyf M (1999). "Ett däggdjursprotein med specifik demetylasaktivitet för mCpG-DNA". Naturen . 397 (6720): 579–83. Bibcode : 1999Natur.397..579B . doi : 10.1038/17533 . PMID 10050851 . S2CID 4408031 .
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (1999). "Analys av NuRD-subenheterna avslöjar ett histon-deacetylas-kärnkomplex och ett samband med DNA-metylering" . Genes Dev . 13 (15): 1924–35. doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . PMC 316920 PMID 10444591 .
Ng HH, Zhang Y, Hendrich B, Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D, Bird A (1999). "MBD2 är en transkriptionsrepressor som tillhör MeCP1-histondeacetylaskomplexet". Nat. Genet . 23 (1): 58–61. doi : 10.1038/12659 . hdl : 1842/684 PMID 10471499 . S2CID 6147725 .
Tatematsu KI, Yamazaki T, Ishikawa F (2000). "MBD2-MBD3-komplex binder till hemi-metylerat DNA och bildar ett komplex som innehåller DNMT1 vid replikationsfoci i sen S-fas" . Gener Celler . 5 (8): 677–88. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00359.x PMID 10947852 . S2CID 25185979 .
Boeke J, Ammerpohl O, Kegel S, Moehren U, Renkawitz R (2001). "Den minimala repressionsdomänen av MBD2b överlappar den metyl-CpG-bindande domänen och binder direkt till Sin3A" . J. Biol. Chem . 275 (45): 34963–7. doi : 10.1074/jbc.M005929200 PMID 10950960 .
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (2001). "Stabila histon-deacetylaskomplex kännetecknas av närvaron av SANT-domänproteiner CoREST/kiaa0071 och Mta-L1" . J. Biol. Chem . 276 (9): 6817–24. doi : 10.1074/jbc.M007372200 PMID 11102443 .
Feng Q, Zhang Y (2001). "MeCP1-komplexet undertrycker transkription genom preferentiell bindning, ommodellering och deacetylering av metylerade nukleosomer" . Genes Dev . 15 (7): 827–32. doi : 10.1101/gad.876201 . PMC 312663 PMID 11297506 .
Sekimata M, Takahashi A, Murakami-Sekimata A, Homma Y (2001). "Involvering av ett nytt zinkfingerprotein, MIZF, i transkriptionell repression genom att interagera med ett metyl-CpG-bindande protein, MBD2" . J. Biol. Chem . 276 (46): 42632–8. doi : 10.1074/jbc.M107048200 PMID 11553631 .
Müller-Tidow C, Kügler K, Diederichs S, Klümpen S, Möller M, Vogt U, Metzger R, Schneider PM, Berdel WE, Serve H (2001). "Förlust av uttryck av HDAC-rekryterande metyl-CpG-bindande domänproteiner i human cancer" . Br. J. Cancer . 85 (8): 1168–74. doi : 10.1054/bjoc.2001.2041 . PMC 2375156 PMID 11710831 .
Feng Q, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Zhang Y (2002). "Identifiering och funktionell karakterisering av p66/p68-komponenterna i MeCP1-komplexet" . Mol. Cell. Biol . 22 (2): 536–46. doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . PMC 139742 PMID 11756549 .
Bakker J, Lin X, Nelson WG (2002). "Methyl-CpG-bindande domänprotein 2 undertrycker transkription från hypermetylerad pi-klass glutation S-transferasgenpromotorer i hepatocellulära karcinomceller" . J. Biol. Chem . 277 (25): 22573–80. doi : 10.1074/jbc.M203009200 PMID 11960994 .
Saito M, Ishikawa F (2002). "Den mCpG-bindande domänen av human MBD3 binder inte till mCpG utan interagerar med NuRD/Mi2-komponenterna HDAC1 och MTA2" . J. Biol. Chem . 277 (38): 35434–9. doi : 10.1074/jbc.M203455200 PMID 12124384 .
Detich N, Theberge J, Szyf M (2002). "Promotorspecifik aktivering och demetylering med MBD2/demetylas" . J. Biol. Chem . 277 (39): 35791–4. doi : 10.1074/jbc.C200408200 PMID 12177048 .
Brackertz M, Boeke J, Zhang R, Renkawitz R (2002). "Två mycket besläktade p66-proteiner utgör en ny familj av potenta transkriptionsrepressorer som interagerar med MBD2 och MBD3. " J. Biol. Chem . 277 (43): 40958–66. doi : 10.1074/jbc.M207467200 PMID 12183469 .
Krithivas A, Fujimuro M, Weidner M, Young DB, Hayward SD (2002). "Proteininteraktioner som riktar in sig på det latensassocierade nukleära antigenet av Kaposis sarkomassocierade herpesvirus till cellkromosomer" . J. Virol . 76 (22): 11596–604. doi : 10.1128/JVI.76.22.11596-11604.2002 . PMC 136775 PMID 12388720 .
