Methanosarcinaceae

Methanosarcinaceae
Methanosarcina barkeri fusaro
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Archaea
Rike:	Euryarchaeota
Provins:	Euryarchaeota
Klass:	Metanomikrobi
Beställa:	Methanosarcinales
Familj:	Methanosarcinaceae Balch och Wolfe 1981
Genera
Halomethanococcus Yu & Kawamura 1988 Methanimicrococcus Metanokoccoider Metanohalobium Metanohalophilus Metanolobus Metanometylovoraner Metanosalsum Methanosarcina " Ca. Methanovorans" Chadwick et al. 2022

Inom taxonomi är Methanosarcinaceae en familj av Methanosarcinales .

Fylogeni

Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med Standing in Nomenclature (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI)

16S rRNA-baserad LTP _01_2022	53 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207
Methanohalobium Zhilina & Zavarzin 1988 Methanosalsum Boone and Baker 2002 Methanococcoides Sowers and Ferry 1985 Methanohalophilus Paterek och Smith 1988 Methanomethylovorans Lomans et al. 2004 Methanolobus König och Stetter 1983 Methanimicrococcus Sprenger et al. 2000 Methanosarcina Kluyver och van Niel 1936	Methanimicrococcus Methanosarcina Methanohalobium Methanosalsum Methanococcoides Methanohalophilus Methanomethylovorans Methanolobus

Biokemi

En anmärkningsvärd egenskap hos Methanosarcinaceae är att de är metanogener som införlivar den ovanliga aminosyran pyrrolysin i sina enzymer. Enzymet monometylaminmetyltransferas katalyserar reaktionen mellan monometylamin och metan . Detta enzym inkluderar pyrrolysin. Den ovanliga aminosyran infogas med hjälp av ett unikt tRNA , vars antikodon är UAG. I de flesta organismer, och i de flesta Methanosarcinaceae-proteiner, är UAG ett stoppkodon . Men i detta enzym, och var som helst annanstans som pyrrolysin är inkorporerat, troligen genom kontextuella markörer på mRNA:t, infogas det pyrrolysinladdade tRNA:t istället för frisättningsfaktorn . De har också ett unikt aminoacyl-tRNA-syntetas för att specifikt ladda detta tRNA med pyrrolysin. Denna unika anpassning är fortfarande föremål för betydande studier.

Se även

• Lista över släkten Archaea

Vidare läsning

Vetenskapliga tidskrifter

•   Cavalier-Smith, T (2002). "Arkaebakteriernas neomuranursprung, den negibakteriella roten av det universella trädet och bakteriell megaklassificering" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 52 (Pt 1): 7–76. doi : 10.1099/00207713-52-1-7 . PMID 11837318 .
•   Springer E; Sachs MS; Woese CR; Boone DR (1995). "Partiella gensekvenser för A-subenheten av metyl-koenzym M-reduktas (mcrI) som ett fylogenetiskt verktyg för familjen Methanosarcinaceae" . Int. J. Syst. Bakteriol . 45 (3): 554–559. doi : 10.1099/00207713-45-3-554 . PMID 8590683 .
•    Cavalier-Smith, T (1986). "Organismernas rike". Naturen . 324 (6096): 416–417. Bibcode : 1986Natur.324..416C . doi : 10.1038/324416a0 . PMID 2431320 . S2CID 5242667 .
• Såmän KR; Johnson JL; Ferry JG (1984). "Fylogena förhållanden mellan de metylotrofa metanproducerande bakterierna och utvecklingen av familjen Methanosarcinaceae" . Int. J. Syst. Bakteriol . 34 (4): 444–450. doi : 10.1099/00207713-34-4-444 .
•    Balch WE; Fox GE; Magrum LJ; Woses CR; et al. (1979). "Metanogener: omvärdering av en unik biologisk grupp" . Microbiol. Rev. _ 43 (2): 260–296. doi : 10.1128/MMBR.43.2.260-296.1979 . PMC 281474 . PMID 390357 .

Vetenskapliga böcker

•   Boone DR; Whitman WB; Koga Y (2001). "Order III. Methanosarcinales ord. nov." . I DR Boone; RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria ( 2nd ed.). New York: Springer Verlag . s. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .
•   Grant WD; Kamekura M; McGenity TJ; Ventosa A (2001). "Klass III. Halobacteria klass. nov." . I DR Boone; RW Castenholz (red.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria ( 2nd ed.). New York: Springer Verlag. s. 169 . ISBN 978-0-387-98771-2 .