Imidazolglycerol-fosfatdehydratas
| Identifierare för | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| imidazolglycerol-fosfatdehydratas | |||||||||
 | |||||||||
| EG nr. | 4.2.1.19 | ||||||||
| CAS-nr. | 9024-35-5 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| Imidazolglycerol-fosfat dehydratas | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 kristallstruktur av imidazol glycerol fosfat dehydratas
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | IGPD | ||||||||
| Pfam | PF00475 | ||||||||
| Pfam klan | CL0329 | ||||||||
| InterPro | IPR000807 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00738 | ||||||||
| SCOP2 | 1rhy / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Enzymet imidazolglycerol-fosfatdehydratas ( EC 4.2.1.19 ) katalyserar den kemiska reaktionen
- D -erytro-1-(imidazol-4-yl)glycerol-3-fosfat 3-(imidazol-4-yl)-2-oxopropylfosfat + H 2 O
Detta enzym tillhör familjen lyaser , speciellt hydrolyaserna, som klyver kol-syrebindningar. Det systematiska namnet på denna enzymklass är D - erytro -1-(imidazol-4-yl)glycerol-3-fosfathydrolyas [3-(imidazol-4-yl)-2-oxopropyl-fosfatbildande] . Andra namn i vanlig användning inkluderar IGP-dehydratas och D - erytro -1-(imidazol-4-yl)glycerol-3-fosfathydrolyas . Detta enzym deltar i histidinmetabolismen eftersom det är involverat i det sjätte steget av histidinbiosyntesen som en del av en niostegs cyklisk väg.
Det finns två isoformer av IGPD; IGPD1 och IGPD2. De olika isoformerna är mycket konserverade med endast 8 aminosyror som skiljer sig åt mellan dem. Dessa subtila skillnader påverkar dock deras aktivitet, men det är ännu okänt hur.
I de flesta organismer är IGPD ett monofunktionellt protein på cirka 22 till 29 kD . I vissa bakterier, såsom Escherichia coli , är det den C-terminala domänen av ett bifunktionellt protein som inkluderar en histidinol-fosfatasdomän . I E. coli är detta proteinet som kodas av hisB -genen.
Hämning
Vissa föreningar som hämmar IGPD har använts som herbicider eftersom djur inte har detta protein. En av dessa hämmare är 3-Amino-1,2,4-triazol (3-AT), som också har använts som en kompetitiv hämmare av produkten av jäst HIS3- genen (en annan IGPD), t.ex. i jäst två- hybridsystem .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 3 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1RHY , 2AE8 , och 2F1D .
Vidare läsning
- AMES BN (1957). "Biosyntesen av histidin; D-erytro-imidazolglycerolfosfatdehydras". J. Biol. Chem . 228 (1): 131–43. PMID 13475302 .
