HOMER1

HOMER1
Identifiers
	, HOMER, HOMER1A, HOMER1B, HOMER1C, SYN47, Ves-1, homer scaffolding protein 1, homer scaffold protein 1
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Homerproteinhomolog 1 eller Homer1 är ett neuronalt protein som hos människor kodas av HOMER1 -genen . Andra namn är Vesl och PSD-Zip45.

Strukturera

Homer1- protein har en N-terminal EVH1-domän , involverad i proteininteraktion, och en C-terminal coiled-coil- domän involverad i självassociation. Den består av två stora skarvvarianter , kortform (Homer1a) och långform (Homer1b och c). Homer1a har bara EVH1-domän och är monomer medan Homer1b och 1c har både EVH1 och coiled-coil-domäner och är tetramera. Den lindade spolen kan ytterligare separeras i N-terminalhalva och C-terminalhalva. Den N-terminala halvan av den lindade spoldomänen förutsägs vara en parallell dimer medan den C-terminala hälften är en hybrid av dimer och antiparallell tetramer lindad spol. Som helhet förutspås long Homer ha en hantelliknande struktur där två par EVH1-domäner är belägna på två sidor av en lång (~50 nm) coiled-coil-domän. Däggdjur har Homer2 och Homer3 , förutom Homer1, som har liknande domänstruktur. De har också liknande alternativt skarvade former.

Dimeric-tetrameric coiled-coil-domän av Homer1b. PDB-rendering baserad på 3CVE.

Vävnadsfördelning

Homer1 uttrycks brett i det centrala nervsystemet såväl som i perifer vävnad inklusive hjärta , njure , äggstockar , testiklar och skelettmuskler . Subcellulärt i neuroner är Homer1 koncentrerad i postsynaptiska strukturer och utgör en stor del av den postsynaptiska tätheten .

Fungera

EVH1-domänen interagerar med PPXXF-motiv. Detta sekvensmotiv finns i grupp 1 metabotrofisk glutamatreceptor (mGluR1 och mGluR5), IP3 _- receptorer (IP3R ₎ , Shank , transient receptor potential canonical (TRPC) familjekanaler , drebrin , oligofrenin, dynamin3 , CENTG1 och ryanodinreceptor . Genom sin tetramera struktur föreslås långa former av Homer (som Homer1b och Homer1c) för att korsbinda olika proteiner. Till exempel är grupp 1 mGluR korskopplad med dess signalering nedströms, IP3- _receptor . Genom tvärbindning av ett annat multimert protein Shank föreslås det också innefatta en kärna av den postsynaptiska densiteten .

Noterbart är att uttrycket av Homer1a induceras av neuronal aktivitet medan det för Homer1b och 1c är konstitutiva. Således klassificeras Homer1a som en omedelbar tidig gen . Homer1a, fungerar som en naturlig dominant negativ form som blockerar interaktion mellan långa former och deras ligandproteiner genom att konkurrera med EVH1-bindningsstället på ligandproteinerna. På detta sätt frikopplar den korta formen av Homer mGluR-signalering och krymper också dendritiska ryggradens struktur. Därför anses den korta formen av Homer vara en del av en mekanism för homeostatisk plasticitet som dämpar den neuronala känsligheten när ingångsaktiviteten är för hög. Den långa formen Homer1c spelar en roll i synaptisk plasticitet och stabilisering av synaptiska förändringar under långvarig potentiering .

Coiled-coil-domänen rapporteras interagera med syntaxin13 och aktiverad Cdc42 . Interaktionen med Cdc42 hämmar aktiviteten av Cdc42 för att omforma dendritisk ryggradsstruktur.

Snabba antidepressiva effekter

Homer1a byter mGluR5-signalering för att öka AMPA-receptoraktiviteten för de snabba antidepressiva effekterna av sömnbrist.

Se även

• HOMER2
• HOMER3

Vidare läsning

•    Xiao B, Tu JC, Worley PF (juni 2000). "Homer: en länk mellan neural aktivitet och glutamatreceptorfunktion". Aktuell åsikt i neurobiologi . 10 (3): 370–374. doi : 10.1016/S0959-4388(00)00087-8 . PMID 10851183 . S2CID 8699597 .
•   Maruyama K, Sugano S (januari 1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–174. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, et al. (september 1996). "Generering och analys av 280 000 mänskliga uttryckta sekvenstaggar" . Genomforskning . 6 (9): 807–828. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549 .
•    Brakeman PR, Lanahan AA, O'Brien R, Roche K, Barnes CA, Huganir RL, Worley PF (mars 1997). "Homer: ett protein som selektivt binder metabotropa glutamatreceptorer". Naturen . 386 (6622): 284–288. Bibcode : 1997Natur.386..284B . doi : 10.1038/386284a0 . PMID 9069287 . S2CID 4346579 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (oktober 1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–156. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•    Tu JC, Xiao B, Naisbitt S, Yuan JP, Petralia RS, Brakeman P, et al. (juli 1999). "Koppling av mGluR/Homer- och PSD-95-komplex av Shank-familjen av postsynaptiska densitetsproteiner" . Neuron . 23 (3): 583–592. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80810-7 . PMID 10433269 . S2CID 16429070 .
•   Roche KW, Tu JC, Petralia RS, Xiao B, Wenthold RJ, Worley PF (september 1999). "Homer 1b reglerar handeln med grupp I-metabotropa glutamatreceptorer" . Journal of Biological Chemistry . 274 (36): 25953–25957. doi : 10.1074/jbc.274.36.25953 . PMID 10464340 .
•   Minakami R, Kato A, Sugiyama H (juni 2000). "Interaktion av Vesl-1L/Homer 1c med syntaxin 13". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 272 (2): 466–471. doi : 10.1006/bbrc.2000.2777 . PMID 10833436 .
•    Ango F, Prézeau L, Muller T, Tu JC, Xiao B, Worley PF, et al. (juni 2001). "Agonistoberoende aktivering av metabotropa glutamatreceptorer av det intracellulära proteinet Homer". Naturen . 411 (6840): 962–965. doi : 10.1038/35082096 . PMID 11418862 . S2CID 4417727 .
•   Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, et al. (juni 2002). "Uttryckt sekvenstagganalys av mänsklig RPE/choroidea för NEIBank-projektet: över 6000 icke-redundanta transkript, nya gener och splitsningsvarianter". Molekylär syn . 8 : 205–220. PMID 12107410 .
•   Feng W, Tu J, Yang T, Vernon PS, Allen PD, Worley PF, Pessah IN (november 2002). "Homer reglerar ökningen av ryanodinreceptor typ 1-kanalkomplex" . Journal of Biological Chemistry . 277 (47): 44722–44730. doi : 10.1074/jbc.M207675200 . PMID 12223488 .
•   Hwang SY, Wei J, Westhoff JH, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, et al. (augusti 2003). "Differentiell funktionell interaktion av två Vesl / Homer-proteinisoformer med ryanodinreceptor typ 1: en ny mekanism för kontroll av intracellulär kalciumsignalering". Cellkalcium . 34 (2): 177–184. doi : 10.1016/S0143-4160(03)00082-4 . PMID 12810060 .
•    Norton N, Williams HJ, Williams NM, Spurlock G, Zammit S, Jones G, et al. (juli 2003). "Mutationsscreening av Homer-genfamiljen och associationsanalys vid schizofreni". American Journal of Medical Genetics. Del B, Neuropsykiatrisk genetik . 120B (1): 18–21. doi : 10.1002/ajmg.b.20032 . PMID 12815733 . S2CID 25053099 .
•   Westhoff JH, Hwang SY, Duncan RS, Ozawa F, Volpe P, Inokuchi K, Koulen P (september 2003). "Vesl/Homer-proteiner reglerar ryanodinreceptor typ 2-funktion och intracellulär kalciumsignalering". Cellkalcium . 34 (3): 261–269. doi : 10.1016/S0143-4160(03)00112-X . PMID 12887973 .
•    Yuan JP, Kiselyov K, Shin DM, Chen J, Shcheynikov N, Kang SH, et al. (september 2003). "Homer binder TRPC-familjens kanaler och krävs för grindning av TRPC1 av IP3-receptorer" . Cell . 114 (6): 777–789. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00716-5 . PMID 14505576 . S2CID 10552676 .
•    Rong R, Ahn JY, Huang H, Nagata E, Kalman D, Kapp JA, et al. (november 2003). "PI3-kinasförstärkare-Homerkomplex kopplar mGluRI till PI3-kinas, vilket förhindrar neuronal apoptos". Naturens neurovetenskap . 6 (11): 1153–1161. doi : 10.1038/nn1134 . PMID 14528310 . S2CID 807407 .