WH1-domän
WH1- | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
domänidentifierare | |||||||||
Symbol | WH1 | ||||||||
Pfam | PF00568 | ||||||||
InterPro | IPR000697 | ||||||||
SMART | WH1 | ||||||||
SCOP2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd01205 | ||||||||
|
WH1-domän är en evolutionärt konserverad proteindomän . Därför har den en viktig funktion.
Fungera
WH1-domäner finns på WASP-proteiner, som ofta är involverade i aktinpolymerisation. Därför är WH1 viktig för alla cellulära processer som involverar aktin, detta inkluderar cellmotilitet, celltrafik, celldelning och cytokines, cellsignalering och etablering och underhåll av cellövergångar och cellform.
Strukturera
Tertiär struktur av WH1-domänen av Mena -proteinet avslöjade strukturlikheter med pleckstrin (PH)-domänen. Det övergripande vecket består av en kompakt parallell beta-smörgås, stängd längs ena kanten av en lång alfahelix . Ett mycket konserverat kluster av tre ytexponerade aromatiska sidokedjor bildar igenkänningsstället för molekylens målligander .
Interaktioner
WASP-proteinfamiljen kontrollerar aktinpolymerisation genom att aktivera Arp2/3-komplexet. WASP är defekt i Wiskott–Aldrichs syndrom (WAS), varvid i de flesta patientfall de flesta punktmutationer inträffar inom den N-terminala WH1-domänen. De metabotropa glutamatreceptorerna mGluR1alpha och mGluR5 binder ett protein som kallas homer, vilket är en WH1-domänhomolog.
WASP-familjens proteiner innehåller en EVH1 (WH1) i sina N-terminaler som binder prolinrika sekvenser i det WASP-interagerande proteinet. Proteiner från RanBP1-familjen innehåller en WH1-domän i sin N-terminala region, som verkar binda ett annat sekvensmotiv som finns i den C-terminala delen av RanGTP-proteinet.
Tertiär struktur av WH1-domänen av Mena-proteinet avslöjade strukturlikheter med pleckstrinhomologi (PH)-domänen. Det övergripande vecket består av en kompakt parallell beta-smörgås, stängd längs ena kanten av en lång alfa-helix. Ett mycket konserverat kluster av tre ytexponerade aromatiska sidokedjor bildar igenkänningsstället för molekylernas målligander.
EVH1
EVH1 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
komplexidentifierare | |||||||||
Symbol | EVH1 | ||||||||
Pfam | PF00568 | ||||||||
Pfam klan | CL0266 | ||||||||
InterPro | IPR000697 | ||||||||
SMART | WH1 | ||||||||
SCOP2 | 1evh / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
CDD | cd00837 | ||||||||
|
En undergrupp av WH1-domäner har kallats EVH1-domänen som binder ett polyprolinmotiv. EVH1-domänen (även känd som WH1- , RanBP1-WASP- eller aktiverad/VASP-homologi 1-domän ) är också en evolutionärt konserverad proteindomän . EVH1-domäner känner igen och binder det prolinrika motivet FPPPP med låg affinitet, ytterligare interaktioner bildas sedan mellan flankerande rester.
EVH1-domänen finns i Ena/Vasp-homologiproteiner med flera domäner som är inblandade i en mängd olika signalering, nukleär transport och cytoskeletthändelser . Denna domän med cirka 115 aminosyror finns i arter som sträcker sig från jäst till däggdjur . Många EVH1-innehållande proteiner associerar med aktinbaserade strukturer och spelar en roll i cytoskelettorganisationen . EVH1- domäner känner igen och binder det prolinrika motivet FPPPP med låg affinitet, ytterligare interaktioner bildas sedan mellan flankerande rester.
Exempel
Humana gener som kodar för proteiner som innehåller WH1 (EVH1)-domänen inkluderar:
externa länkar
- Eukaryot linjärt motiv resursmotiv klass LIG_EVH1_1
- Eukaryot linjärt motiv resursmotiv klass LIG_EVH1_2
- Eukaryot linjärt motiv resursmotiv klass LIG_WH1