HLA-DR7
mänskligt större histokompatibilitetskomplex, klass II, DR7
|
|
Haplotypgrupper | DQA*01:DRB1*0701 |
Struktur (se HLA-DR ) | |
Identifierare |
alfa *01:01
|
Symbol(er) | HLA-DRA [ permanent död länk ] |
EBI-HLA | DRA*01:01 |
Identifierare |
beta 1 *07:01
|
Symbol(er) | HLA-DRB1 [ permanent död länk ] |
EBI-HLA | DRB1*07:01 |
Delad data | |
Ställe | chr.6 6p21.31 |
HLA-DR7 ( DR7 ) är en HLA - DR- serotyp som känner igen genprodukterna DRB1*0701 till *0705.
Serologi
DRB1* | DR7 | Prov |
allel | % | storlek (N) |
0701 | 99 | 7390 |
0704 | >30 % | 1 |
Den serologiska reaktionen av DR7 är utmärkt för *0701. Serologin för *0703 till *0705 till *0709 och *0711 till *0714 serotyper är okänd. DRB1*0710N är en nollallel . DRB1*0702 nomenklatur har tagits bort.
Sjukdomsföreningar
Efter serotyp
DR7 är positivt associerat med psoriasis vulgaris .
Av Allelgruppen
DRB1*07 är kopplat till T. cruzi -infektion med kardiomyopati (även kallad Chagas kardiomyopati) .
Genom utökad haplotyp
DR7:DQA1*0201:DQB1*0202 är associerad med Graves sjukdom .
DR7- DQ2 / DR5 - DQ7 fenotyp (transhaplotypkodad isoform DQα 5 β 2 ) är den primära risken för DQ-isoformen vid celiaki . DR7-DQ2/DR5-DQ7 (/ DR11 -DQ7 eller / DR12 -DQ7) är en förtydligande identifierare för risktranshaplotypen.
DR53-DR7 kan vara associerad med skleros/lupus-associerade anti-apolipoprotein-antikroppar .
Genetisk koppling
DR7 Haplotyper
|
||||
Serotyper | DRA | DRB1 | DRB4 | |
---|---|---|---|---|
DR7- DR53 | *0101 | *0701 | *01 | |
Serotyper | DQA1 | DQB1 | DRB1 | |
DR7- DQ2 (2.2) | *0201 | *0202 | *0701 | |
DR7- DQ9 (9.2, 3) | *0201 | *0303 | *0701 | |
Serotyper | HLA-A | HLA-C | HLA-B | DRB1 |
A29(19)-Cw16-B44(16)-DR7 | *2902 | *1601 | *4403 | *0701 |
A30(19)-Cw6-B13-DR7 | *3001 | *0602 | *1302 | *0701 |
A33(19)-Cw7-B44(16)-DR7 | *3301 | *0701 | *4403 | *0701 |
HLA-DR7 är genetiskt kopplad HLA-DR53 och är kopplad till DQ2 -serotyper . Det finns några intressanta genetik med DR7. Haplotypen A29-Cw16-B44-DR7-DQ2 är i stark kopplingsojämvikt, särskilt i nordvästra Europa. De högsta frekvenserna tenderar att vara kustländer längs Atlanten. Cw16-allelen kommer utan tvekan från Västafrika, varvid mångfalden och frekvensen av Cw16 avtar bort från längs Greenwich längsgående linje. Nivån av kopplingsojämvikt om Cw16 postulerar en nyligen ankomst från Afrika, och indikerar ett betydande bidrag så långt norrut som Irland . A33-Cw7-B44-DR7 erbjuder samma scenario. Denna haplotyp finns i Korea men inte Japan, i själva verket är Japan en antinod till DR7. De vanligaste AB-DR-DQ-haplotyperna i Korea finns vid ~3/4 av de koreanska frekvenserna i Japan, förutom A33-Cw7-B44-DR7-DQ2, vilket indikerar att DR7 sannolikt spred sig till Korea efter Japans Yayoi - migrering när det mesta av det koreanska bidraget inträffade. Likheter med mongoliska gener tyder på att central- och öst-centralasiatiska är den troliga källan, vilket bekräftas av det faktum att haplotypen finns i Pakistan , Kina och Indien . Det finns möjlighet att denna haplotyp är en nyligen ( holocen ) ankomst från Afrika eller Mellanöstern till Centralasien eftersom detta bäst förklarar allelerna i haplotypen. A19 (A29, A30, A31, A32, A33, A74) serotyper är mycket berikade i sub-sahara och västra Afrika, inklusive Iberia, och obalanserade komponenter i DR7 visar en tendens att vara kopplade till A19 serotyper.