Formins

formin 1
Identifierare
Symbol FMN1
Alt. symboler LD, FMN
NCBI-genen 342184
HGNC 3768
OMIM 136535
RefSeq NM_001103184
UniProt Q68DA7
Övriga uppgifter
Ställe Chr. 15 q13-q14
Söka efter
Strukturer Schweizisk modell
Domäner InterPro
Identifierare för
Formin Homology Region 1
Symbol Drf_FH1
Pfam PF06346
InterPro IPR009408
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Domänstruktur av forminproteiner över phyla.
Formin Homology 2 Domänkristallstrukturer
PDB 1ux4 EBI.jpg
för en forminhomologi-2-domän avslöjar en tjudrad-dimer-arkitektur
Identifierare
Symbol FH2
Pfam PF02181
InterPro IPR015425
SMART FH2
SCOP2 1ux5 / SCOPe / SUPFAM
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Diaphanous FH3 Domain
PDB 1z2c EBI.jpg
kristallstruktur av mdia1 gbd-fh3 i komplex med rhoc-gmppnp-
identifierare
Symbol Drf_FH3
Pfam PF06367
Pfam klan CL0020
InterPro IPR010472
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
DRF Autoregulatory Domain
PDB 2bap EBI.jpg
kristallstruktur för den n-terminala mdia1 bältdjursrepetitionsregionen och dimeriseringsdomänen i komplex med mdia1 autoregulatory domänen (dad)
Identifierare
Symbol Drf_DAD
Pfam PF06345
InterPro IPR010465
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning
Diaphanous GTPase-bindande Domänkristallstruktur
PDB 1z2c EBI.jpg
av mdia1 gbd-fh3 i komplex med rhoc-gmppnp-
identifierare
Symbol Drf_GBD
Pfam PF06371
Pfam klan CL0020
InterPro IPR010473
Tillgängliga proteinstrukturer:
Pfam   strukturer / ECOD  
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumma struktur sammanfattning

Forminer (forminhomologiproteiner) är en grupp proteiner som är involverade i polymerisationen av aktin och associerar med den snabbväxande änden (hullingförsedda änden) av aktinfilamenten. De flesta forminer är Rho-GTPas- effektorproteiner. Forminer reglerar aktin- och mikrotubuluscytoskelettet och är involverade i olika cellulära funktioner såsom cellpolaritet , cytokines , cellmigration och SRF - transkriptionell aktivitet . Forminer är multidomänproteiner som interagerar med olika signalmolekyler och cytoskelettproteiner , även om vissa forminer har tilldelats funktioner inom kärnan .

Mångfald

Forminer har hittats i alla studerade eukaryoter . Hos människor finns 15 olika forminproteiner som har klassificerats i 7 undergrupper. Däremot jäst endast 2-3 forminer.

Struktur och interaktioner

Forminer kännetecknas av närvaron av tre forminhomologi (FH) -domäner (FH1, FH2 och FH3), även om medlemmar av forminfamiljen inte nödvändigtvis innehåller alla tre domänerna. Dessutom finns vanligtvis andra domäner, såsom PDZ- , DAD-, WH2- eller FHA-domäner.

Den prolinrika FH1-domänen förmedlar interaktioner med en mängd olika proteiner, inklusive det aktinbindande proteinet profilin , SH3 (Src homology 3) domänproteiner och WW-domänproteiner . Den aktinkärnbildningsfrämjande aktiviteten hos S. cerevisiae- forminer har lokaliserats till FH2-domänen. FH2-domänen krävs för självassociering av forminproteiner genom förmågan hos FH2-domäner att direkt binda varandra, och kan också verka för att hämma aktinpolymerisation. FH3-domänen är mindre välbevarad och krävs för att styra forminer till rätt intracellulär plats, såsom den mitotiska spindeln eller projektionsspetsen under konjugering . Dessutom kan vissa forminer innehålla en GTPas -bindande domän (GBD) som krävs för att binda till Rho små GTPaser och en C-terminal konserverad Dia-autoregulatorisk domän (DAD). GBD är en bifunktionell autoinhibitorisk domän som interagerar med och regleras av aktiverade Rho-familjemedlemmar. Mammalian Drf3 innehåller ett CRIB-liknande motiv inom sin GBD för bindning till Cdc42 , vilket krävs för att Cdc42 ska aktivera och styra Drf3 mot cellbarken där det omformar aktinskelettet. DAD binder den N-terminala GBD; denna länk bryts när GTP-bundet Rho binder till GBD och aktiverar proteinet. Tillägget av DAD till däggdjursceller inducerar aktinfilamentbildning , stabiliserar mikrotubuli och aktiverar SRF- medierad transkription . En annan vanligt förekommande domän är en bältdjursrepetitionsregion (ARR) belägen i FH3-domänen.

FH2-domänen har genom röntgenkristallografi visat sig ha en långsträckt, halvmåneform som innehåller tre spiralformade subdomäner.

Forminer binder också direkt till mikrotubuli via deras FH2-domän. Denna interaktion är viktig för att främja infångningen och stabiliseringen av en undergrupp av mikrotubuli orienterad mot framkanten av migrerande celler. Forminer främjar också infångningen av mikrotubuli av kinetochore under mitos och för att anpassa mikrotubuli längs aktinfilament.

Se även

externa länkar

Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR010472
Den här artikeln innehåller text från den offentliga egendomen Pfam och InterPro : IPR015425
Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR010465
Den här artikeln innehåller text från det offentliga området Pfam och InterPro : IPR010473