Forkhead-associerad domän
| FHA-domänlösningsstruktur | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 för fha-domänen av humant ubiquitinligasprotein rnf8-
| |||||||||
| identifierare | |||||||||
| Symbol | FHA | ||||||||
| Pfam | PF00498 | ||||||||
| Pfam klan | CL0357 | ||||||||
| InterPro | IPR000253 | ||||||||
| PROSITE | PDOC50006 | ||||||||
| SCOP2 | 1qu5 / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är den forkhead-associerade domänen (FHA-domänen) en fosfopeptidigenkänningsdomän som finns i många regulatoriska proteiner . Den uppvisar specificitet för fosfotreonin -innehållande epitoper men kommer också att känna igen fosfotyrosin med relativt hög affinitet. Den spänner över cirka 80-100 aminosyrarester vikta till en 11-strängad beta-sandwich, som ibland innehåller små spiralformade insättningar mellan slingorna som förbinder strängarna.
Hittills har gener som kodar för FHA-innehållande proteiner identifierats i eubakteriella , eukaryota och arkeala genom . Domänen finns i en mängd olika proteiner, såsom kinaser , fosfataser , kinesiner , transkriptionsfaktorer , RNA - bindande proteiner och metaboliska enzymer som deltar i många olika cellulära processer - DNA-reparation , signaltransduktion , vesikulär transport och proteinnedbrytning är bara några exempel.
DNA-reparation
Den gaffelassocierade (FHA) domänen av polynukleotidkinasfosfatas ( PNKP ) är nödvändig för rekryteringen av PNKP till skadeställen i DNA . PNKP är aktivt i reparationen av DNA-skada genom processerna av basexcisionsreparation , enkelsträngsbrottsreparation och icke-homolog ändsammanfogning i fallet med dubbelsträngsbrott. I dessa aktiviteter verkar PNKP både som ett kinas och ett fosfatas vid ligeringen av DNA-ändar. Kinasdomänen fosforylerar 5'-hydroxyländarna och fosfatasdomänen tar bort fosfater från 3'-ändarna. Dessa aktiviteter, som verkar tillsammans, förbereder enkelsträngsbrott med skadade ändar för ligering.
externa länkar
- Eukaryot linjärt motiv resursmotiv klass LIG_FHA_1
- Eukaryot linjärt motiv resursmotiv klass LIG_FHA_2