Fosfopeptid

Fosfopeptider är modifierade självantigener som kan inducera ett immunsvar.

Proteinfosforylering är en mycket viktig och frekvent posttranslationell modifiering som kan påverka ett proteins lokalisering, stabilitet och huruvida det kan dimerisera eller bilda stabila bindningar med andra ämnen. Det är viktigt att fastställa vilken aminosyra i proteinets primära struktur som fosforyleras för att förstå funktionerna hos en fosfopeptid. Detta åstadkoms genom fosfopeptidkartläggning, som involverar nedbrytning av ett radioaktivt märkt protein, separation av fosfopeptidprodukter och slutligen analys via högpresterande vätskekromatografi (HPLC) eller masspektrometri. Analys av fosfopeptider kan ge information om vilka aminosyror som är fosforylerade och hur många platser på den primära sekvensen som är fosforylerade.

Fosforylering av serin- och treoninrester bevaras under MHC klass I och MHC klass II antigenbearbetning . Fosfopeptider visas således på ytan av celler. Som modifierade självantigener är de potentiellt immunogena jämfört med omodifierade självproteiner eftersom immuncellerna ( T-celler ) som känner igen dem möjligen inte är föremål för centrala toleransmekanismer . Detta kan bidra till fosofopeptidernas potentiella förmåga att fungera som tumörantigener vid behandling av kolorektal cancer .