FABP1

FABP1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, FABPL, L-FABP, fettsyrabindande protein 1
Externa ID
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

FABP1 är en human gen som kodar för proteinprodukten FABP1 (Fatty Acid-Binding Protein 1). Det är också ofta känt som fettsyrabindande protein av levertyp (LFABP).

FABP1 uttrycks primärt i levern där det är involverat i bindning, transport och metabolism av långkedjiga fettsyror (LCFAs), endocannabinoider , fytocannabinoider (och mindre så för syntetiska cannabinoidreceptorer (CBR) agonister och antagonister ) och andra hydrofoba molekyler . Förändrat uttryck av proteinet har kopplats till metabola tillstånd inklusive fetma.

Upptäckt

De fettsyrabindande proteinerna (FABP) upptäcktes initialt 1972 med experiment med användning av ^{14C -} märkt oleat för att identifiera närvaron av en löslig fettsyrabärare i enterocyten som är ansvarig för intestinal absorption av (LCFA). Sedan dess har tio medlemmar av FABP-familjen identifierats på det mänskliga genomet. Nio är väletablerade (FABP1-9) med en nyligen upptäckt tiondel (FABP12). Varje FABP motsvarar särskilda organ/vävnad runt om i kroppen där de spelar en roll i fettsyraupptag, transport och metabolism.

Genplacering

Den humana FABP1-genen är lokaliserad på den korta (p) armen av kromosom 2 från baspar 88,122,982 till baspar 88,128,131.

Proteinstruktur

FABP1 har visat sig ha en unik struktur jämfört med andra medlemmar av FABP- familjen, vilket gör att den kan binda flera ligander samtidigt. Den har också en större kärna som är tillgänglig för lösningsmedel jämfört med andra FABP:er som tillåter mer varierande substratbindning. "Portalhypotesen" har föreslagits för att förklara bindningsprocessen för FABP. Det har föreslagits att fettsyror kommer in i det lösningsmedelstillgängliga området av proteinet genom en dynamisk region bestående av α-helix II och vänder sig mellan βC-βD och βE-βF loopar. Fettsyran binds sedan i proteinhålan för transport.

Fungera

FABP är en familj av små, mycket konserverade cytoplasmatiska proteiner involverade i bindningen av LCFA. FABP1 uttrycks rikligt i den mänskliga levern där det står för 7-11% av det totala cytosoliska proteinet, och kan även hittas i tarm, njure, bukspottkörtel, mage och lunga. FABP1 är unik i det bredare utbudet av andra hydrofoba ligander som det kan binda inklusive bilirubin , monoglycerider , gallsyror och fettacyl CoA . Det har föreslagits att FABP1 spelar en betydande roll för att förhindra cytotoxicitet genom att binda hem , fettsyror och andra molekyler som är potentiellt toxiska när de inte är bundna.

Mutationer

På exon 3 av den humana FABP1-genen har en Thr till Ala-substitution identifierats som leder till en T94A missense-mutation. Bärare av denna speciella enkelnukleotidpolymorfism (SNP) uppvisar högre baslinjenivåer av plasmafria fettsyror, lägre BMI och en mindre midjeomkrets. T94A-mutanten har också associerats med tillstånd av metabola syndrom, hjärt-kärlsjukdom och T2DM.

Proteinuttryck

Undertryckande

Studier med möss för att bestämma effekten av att undertrycka FABP1-genen har utförts. När de försågs med dieter med hög fetthalt eller hög kolesterolhalt visade de med undertryckt FABP1-uttryck en betydande inverkan på metabolisk reglering och viktökning.

Ökade nivåer av fetma

En studie på kinesiska unga vuxna indikerar ett starkt samband mellan FABP1-nivåer i serum och lipidprofil, kroppsmått och homeostatiska parametrar. Ökat BMI och insulinresistens hos försökspersoner visade högre serum FABP1 med en särskild korrelation hos patienter med central fett. Denna höjning föreslås inträffa som en kompensatorisk uppreglering av proteinet i ett försök att motverka den höga metaboliska stressen i samband med fetma. Alternativt kan fetma i själva verket leda till att människokroppen utvecklar motstånd mot FABP1:s handlingar, vilket leder till den kompenserande uppregleringen.

Sjukdomsmarkör

Utvärdering av ökade nivåer av urin- och serum-FABP1 har också visat sig vara effektiva markörer vid upptäckt av intestinal ischemi, progressiv njursvikt i slutstadiet och ischemisk skada orsakad av njurtransplantation eller bypass-operation.

Vidare läsning

•   Glatz JF, Börchers T, Spener F, van der Vusse GJ (1995). "Fettsyror i cellsignalering: modulering genom lipidbindande proteiner". Prostaglandiner, Leukotriener och essentiella fettsyror . 52 (2–3): 121–7. doi : 10.1016/0952-3278(95)90010-1 . PMID 7784447 .
•    Kaikaus RM, Chan WK, Ortiz de Montellano PR, Bass NM (1993). "Mekanismer för reglering av leverfettsyrabindande protein". Molekylär och cellulär biokemi . 123 (1–2): 93–100. doi : 10.1007/BF01076479 . PMID 8232272 . S2CID 11639043 .
•   Londraville RL (juni 1996). "Intracellulära fettsyrabindande proteiner: sätter lägre ryggradsdjur i perspektiv". Brazilian Journal of Medical and Biological Research . 29 (6): 707–20. PMID 9070383 .
•   Börchers T, Hohoff C, Buhlmann C, Spener F (juli 1997). "Hjärttyp fettsyrabindande protein - involvering i tillväxthämning och differentiering". Prostaglandiner, Leukotriener och essentiella fettsyror . 57 (1): 77–84. doi : 10.1016/S0952-3278(97)90496-8 . PMID 9250612 .
•   Carroll SL, Roth KA, Gordon JI (december 1990). "Leverfettsyrabindande protein: en markör för att studera cellulär differentiering i tarmepitel neoplasmer". Gastroenterologi . 99 (6): 1727–35. doi : 10.1016/0016-5085(90)90480-o . PMID 1699834 .
•   Sweetser DA, Birkenmeier EH, Klisak IJ, Zollman S, Sparkes RS, Mohandas T, Lusis AJ, Gordon JI (november 1987). "De mänskliga och gnagarens intestinala fettsyrabindande proteingener. En jämförande analys av deras struktur, uttryck och kopplingsförhållanden" . Journal of Biological Chemistry . 262 (33): 16060–71. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47696-X . PMID 2824476 .
•   Chan L, Wei CF, Li WH, Yang CY, Ratner P, Pownall H, Gotto AM, Smith LC (mars 1985). "Humant leverfettsyrabindande protein cDNA och aminosyrasekvens. Funktionella och evolutionära implikationer" . Journal of Biological Chemistry . 260 (5): 2629–32. doi : 10.1016/S0021-9258(18)89406-6 . PMID 3838309 .
•   Lowe JB, Boguski MS, Sweetser DA, Elshourbagy NA, Taylor JM, Gordon JI (mars 1985). "Humant leverfettsyrabindande protein. Isolering av ett cDNA i full längd och jämförande sekvensanalyser av ortologa och paraloga proteiner" . Journal of Biological Chemistry . 260 (6): 3413–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)83637-2 . PMID 3838313 .
•   Murphy EJ (augusti 1998). "L-FABP och I-FABP uttryck ökar NBD-stearatupptag och cytoplasmatisk diffusion i L-celler". American Journal of Physiology . 275 (2 Pt 1): G244-9. doi : 10.1152/ajpgi.1998.275.2.G244 . PMID 9688651 .
•   Wolfrum C, Börchers T, Sacchettini JC, Spener F (februari 2000). "Bindning av fettsyror och peroxisomproliferatorer till ortologa fettsyrabindande proteiner från human, murin och bovin lever". Biokemi . 39 (6): 1469–74. doi : 10.1021/bi991638u . PMID 10684629 .
•    Wolfrum C, Borrmann CM, Borchers T, Spener F (februari 2001). "Fettsyror och hypolipidemiska läkemedel reglerar peroxisomproliferatoraktiverade receptorer alfa- och gamma-medierat genuttryck via leverfettsyrabindande protein: en signalväg till kärnan. " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (5): 2323–8. Bibcode : 2001PNAS...98.2323W . doi : 10.1073/pnas.051619898 . PMC 30137 . PMID 11226238 .
•    Schroeder F, Atshaves BP, Starodub O, Boedeker AL, Smith RR, Roths JB, Foxworth WB, Kier AB (mars 2001). "Uttryck av leverfettsyrabindande protein förändrar tillväxt och differentiering av embryonala stamceller". Molekylär och cellulär biokemi . 219 (1–2): 127–38. doi : 10.1023/A:1010851130136 . PMID 11354243 . S2CID 37941511 .
•   Zimmerman AW, van Moerkerk HT, Veerkamp JH (september 2001). "Ligandspecificitet och konformationsstabilitet hos mänskliga fettsyrabindande proteiner". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology . 33 (9): 865–76. doi : 10.1016/S1357-2725(01)00070-X . PMID 11461829 .
•   Mésange F, Sebbar M, Capdevielle J, Guillemot JC, Ferrara P, Bayard F, Poirot M, Faye JC (2003). "Identifiering av två tamoxifenmålproteiner genom fotomärkning med 4-(2-morfolinoetoxi)bensofenon". Biokonjugatkemi . 13 (4): 766–72. doi : 10.1021/bc015588t . PMID 12121132 .