Exiguobacterium

Exiguobacterium
Vetenskaplig klassificering
Domän: Bakterie
Provins: Bacillota
Klass: Baciller
Beställa: Bacillales
Familj: Bacillaceae
Släkte:
Exiguobacterium Collins et al. 1983
Typ art
Exiguobacterium aurantiacum
Collins et al. 1984
Arter

Exiguobacterium är ett släkte av baciller och en medlem av låg GC phyla av Bacillota . Collins et al . beskrev först släktet Exiguobacterium med karakteriseringen av E. aurantiacum -stam DSM6208T från en alkalisk potatisförädlingsanläggning. Den har hittats i områden som täcker ett brett spektrum av temperaturer (-12 °C—55 °C) inklusive glaciärer på Grönland och varma källor i Yellowstone , och har isolerats från forntida permafrost i Sibirien. Denna förmåga att överleva i varierande temperaturextremer gör dem till ett viktigt studieområde. Vissa stammar är förutom dynamisk termisk anpassning också halotoleranta (upp till 13 % tillsatt NaCl tillsatt till mediet), kan växa inom ett brett spektrum av pH-värden (5-11), tolerera höga nivåer av UV-strålning och tungmetallstress (inklusive arsenik).

Exiguobacterium är globalt olika organismer som finns i en mängd olika miljöer, inklusive mikrobialiter ( Trombolit från Pavilion Lake , BC och Stromatolites från Laguna Socompa , Argentina), hav, sötvattensjöar, Himalaya - is, Himalayas jord, hydrotermiska öppningar , artemia , mag-tarmkanalen av marina fiskar och i mikrobiella biofilmer

Sju genom från släktet har fullbordats som antingen kompletta (en cirkulär kromosom , med plasmider ) eller i ett utkastformat (innehållande flera omonterade kontiger ). En ny art av Exiguobacterium chiriqhucha har visat sig ha global spridning i kalla sjöar från Grönland, Pavilion Lake BC och Laguna Negra, Argentina. "Chiri qhucha" på Quechua betyder "kall sjö". Studien av Gutiérrez-Preciado et al. bekräftades genom fullbordandet av genom två stammar av Exiguobacterium chiriqhucha RW2 och GIC31. Fosfolipidfettsyraanalys (PLFA) av varierande temperaturer i Exiguobacterium chiriqhucha -stam RW2 resulterar i stora omarrangemang av cellmembranets funktion, vilket kan möjliggöra dess temperatur-, pH- och salthaltsanpassning.

Biologisk nedbrytning av plast

Enligt en artikel i Stanford News Service rapporterade senior forskningsingenjör Wei-Min Wu i sin artikel "Biodegradation and Mineralization of Polystyrene by Plastic-Eating Mealworms. 2. Roll of Gut Microorganisms." att mjölmaskar kan överleva på en diet av polystyren när de får hjälp av stam YT2 av Exiguobacterium som lever i deras tarm.

Fylogeni

Den för närvarande accepterade taxonomin är baserad på listan över prokaryota namn med Standing in Nomenclature (LPSN) och National Center for Biotechnology Information (NCBI)

16S rRNA-baserad LTP _01_2022 120 markörproteiner baserade GTDB 07-RS207

E. enclense Dastager et al. 2015

E. acetylicum (Levine & Soppeland 1926) Farrow, Wallbanks & Collins 1994

E. indicum Chaturvedi & Shivaji 2006

E. antarcticum Frühling et al. 2002

E. soli Chaturvedi et al. 2008

E. oxidotolerans Yumoto et al. 2004

E. undae Frühling et al. 2002

E. artemiae López-Cortés et al. 2006

E. sibiricum Rodrigues et al. 2006

E. flavidum Meng et al. 2020

E. aestuarii Kim et al. 2005

E. qingdaonense Liu et al. 2022

E. marinum Kim et al. 2005

E. profundum Crapart et al. 2007

E. algae Liu et al. 2022

E. alkaliphilum Kulshreshtha et al. 2013

E. aurantiacum Collins et al. 1984

" E. aquaticum " Raichand et al. 2012

E. mexicanum López-Cortés et al. 2006

E. marinum

E. profundum

" E. chiriqhucha " Gutierrez-Preciado et al. 2017

E. mexicanum

E. alkaliphilum

E. aurantiacum

E. flavidum

E. acetylicum

E. indicum (inkl. Exiguobacterium enclense )

E. oxidotolerans

E. undae

E. antarcticum

E. sibiricum

Se även