DecisionDx-UM

DecisionDx-UM är ett prognostiskt test som exakt bestämmer den metastaserande risken förknippad med okulära melanomtumörer i ögat. Okulärt melanom är en term som vanligtvis används för att beskriva tumörer i det uveala området såsom uvealt melanom , koroidalt melanom , ciliarkroppsmelanom och irismelanom. DecisionDx-UM-testet validerades kliniskt på dessa tumörer i uvealkanalen. DecisionDx-UM bedömer genuttrycksprofilen (GEP) för en undergrupp av gener som är differentiellt uttryckta i primära tumörceller jämfört med celler som har genomgått transformation till en metastatisk fenotyp.

Testet klassificerar tumörer som:

Klass 1A (låg metastaserande risk),
Klass 1B (långsiktig metastaserande risk),
Klass 2 (omedelbar, hög metastaserisk).

Även kallat genuttrycksprofilen, testet har direkt jämförts med alla andra kliniska och patologiska faktorer, såsom kromosom 3-status ( monosomi 3), cytopatologi och tumörstorlek och DecisionDx-UM-testet visade sig vara mer exakt än dessa andra faktorer. DecisionDx-UM-testet har blivit standardvård i de flesta okulära onkologiska centra i USA och rekommenderas av American Joint Committee on Cancer (AJCC). AJCC rekommenderar detta test för alla patienter med diagnosen uvealt melanom eftersom resultaten är "kliniskt signifikanta". Exakta resultat uppnås med både finnålsaspiratbiopsier (FNAB) eller formalinfixerad , paraffininbäddad (FFPE) tumörvävnad. Den prognostiska informationen från DecisionDx-UM hjälper läkare och deras patienter att fatta individuella beslut om de övervaknings- och terapeutiska alternativ som är mest lämpliga. DecisionDx-UM-testet var exklusivt licensierat från Washington University i St. Louis och är endast tillgängligt via Castle Biosciences , Incorporated.

Uveal melanom

Även om det är sällsynt är uvealt melanom (okulärt melanom) den vanligaste formen av ögoncancer och den näst vanligaste formen av melanom . Uveala melanomtumörer uppstår i ögats uveala kanal som inkluderar regnbågshinnan , ciliarkroppen och åderhinnan . Behandling av den primära ögontumören består av ögonsparande behandling ( plackstrålbehandling eller protonstrålning ) eller avlägsnande av ögonen ( enukleation ). Båda är mycket effektiva med "botningsfrekvenser" över 90%. Men som har dokumenterats väl i flera publikationer, inklusive Collaborative Ocular Melanoma Study (COMS), har melanomet troligen redan hos nästan 50 % av patienterna metastaserats när den primära ögontumören har diagnostiserats och behandlats. Majoriteten av dessa metastaser är mikroskopiska och kliniskt odetekterbara vid tidpunkten för primär tumördiagnos. Tyvärr kan många av de nuvarande diagnostiska teknikerna (inklusive bildbehandling och leverfunktionstester) inte exakt detektera mikrometastaser förrän tumörknölarna har vuxit avsevärt och sannolikt blivit resistenta mot terapi.

Bristen på korrekta prognostiska tester för att identifiera vilka patienter som löper risk att utveckla kliniskt uppenbar metastaserande sjukdom har varit ett betydande problem vid hanteringen av enskilda patienter med uvealt melanom. Utan exakta mått på individuell metastaserisk är det omöjligt att identifiera vilka patienter som löper hög risk för klinisk metastasering, vilket sedan kan leda till antingen över- eller underbehandling av en given patient. DecisionDx-UM-testet utvecklades för att ge en förbättrad individuell metastaserande riskbedömning som möjliggör mer lämplig övervakning och behandlingsplanering.

DecisionDx-UM GEP-analys

Upptäckt

Genuttrycksprofilen mätt med DecisionDx-UM upptäcktes i laboratoriet av J. William Harbor vid Washington University i St. Louis . Tillämpningen av mikroarrayanalys på primära obehandlade uveala melanom avslöjade att tumörerna grupperade sig i två diskreta grupper baserat på deras uttrycksprofiler. Filtrering av den differentiellt uttryckta genuppsättningen ledde till identifieringen av en uppsättning gener som kunde skilja mellan klass 1 och klass 2 tumörer.

I efterföljande experiment samlade Dr. Harbours grupp mikroarrayinformation från en större delmängd av uveala melanomtumörprover och kunde identifiera diskriminerande kandidatgener för vidare analys. De genetiska uttrycksprofilerna för dessa diskriminerande gener verifierades i uveala melanomtumörer med användning av kvantitativa polymeraskedjereaktionsmetoder (qPCR), och prediktiv modellering utfördes för att identifiera en optimal uppsättning gener som kan exakt förutsäga metastaserande risk och rapportera klasstilldelningar. Den sista analysen utvärderade 12 diskriminerande gener och 3 kontrollgener för att bestämma klass 1 (låg risk) och klass 2 (hög risk) tumörer och validerades i en multicenterstudie med 609 patienter som inkluderade FNAB- och FFPE-prover.

Prognostisk noggrannhet

Den nuvarande DecisionDx-UM-plattformen validerades kliniskt i COOG-studien, som inkluderade 514 patienter med UM som behandlades vid 12 okulära onkologiska centra i USA mellan 1998 och 2010. Rapporten tillhandahåller data som visar att DecisionDx-UM har en hög teknisk framgångsfrekvens (>95%).

Klinisk teknisk framgång

Sedan det första erbjudandet av DecisionDx-UM i december 2009 har mer än 800 kliniska beställningar tagits emot för analys av Castle Biosciences från över 55 okulära onkologiska centra över hela USA. Teknisk framgång och klassbestämning uppnåddes för 96,2 % av proverna. De flesta av misslyckandena berodde på felaktig biopsiinsamling och/eller hantering. Tumörbiopsiinsamling är avgörande för framgångsrik rapportering av metastaserande risk Klasstilldelning efter DecisionDx-UM-testning.

DecisionDx-UM Beställning och rapportering

Castle Biosciences, Incorporated accepterar endast serviceorder för DecisionDx-UM från legitimerade läkare (oftast ögononkologer, ögonläkare eller retinaspecialister ) som tar hand om patienter med diagnosen uvealt melanom. Läkare som är förstagångskunder måste kontakta Castle's för information och för att upprätta ett konto. Provinlämning kräver inlämning av ett DecisionDx-UM-rekvisitionsformulär som ska fyllas i och faxas till Castle. FNAB-prover kräver användning av en provtagningskit, från Castle, för att stabilisera provet och minska risken för tekniska fel. Detta kit måste tas emot av den beställande läkaren före provtagning. Slottspersonal finns tillgänglig för att hjälpa till med logistik gällande provinsamling och frakt.

Castle tillhandahåller en rapport till den beställande läkaren som kommer att klassificera tumören som klass 1A, klass 1B eller klass 2. Rapporten kommer också att beskriva statistiken som är associerad med klassificeringen, och ge ett diskriminerande värde som återspeglar förtroendet för klassificeringen. Informationen i rapporten från Castle identifierar hur sannolikt en tumör är att metastasera (spridas) med denna risk som kategoriseras som låg (klass 1A), mellanliggande (klass 1B) eller hög (klass 2).

Andra prognostiska faktorer för UM Metastas

Histopatologiska faktorer och avbildningstekniker

Historiskt finns det flera kliniska och patologiska egenskaper som statiskt har associerats med metastaser. Tumörstorlek, tumörplacering, patientålder och kärlstruktur har alla rapporterats korrelera med metastaserande debut och patientöverlevnad. Medan generella beskrivningar av UM-patientpopulationen i stort kan göras baserat på dessa faktorer, har ingen, ensam eller tillsammans, visat prediktiv noggrannhet med avseende på metastatisk aktivitet.

Avbildningstekniker som används för att detektera metastaserande aktivitet har också begränsningar. Systemiska metastaser detekteras med Positron Emission Tomography (PET) vid tidpunkten för den ursprungliga diagnosen hos mindre än 4 % av UM-patienterna Magnetic Resonance Imaging (MRI) har nyligen rapporterats känsligare än PET för att identifiera metastaser från koroidalt melanom , men MRT kräver tumörmassa större än 5 mm i storlek. Den nuvarande avbildningstekniken saknar således känsligheten för att upptäcka mikrometastaser som kan finnas vid tidpunkten för primär diagnos av uvealt melanom.

Genetiska faktorer

Genetiska analystekniker har lett till identifiering av kromosomavvikelser associerade med metastatisk tumörprogression i uvealt melanom. Förlust av heterozygositet , förlust av hela alleler från kromosomer, partiell kromosomal addition och kromosomal deletion och enkelnukleotidpolymorfismer ( SNP) har associerats med metastaserande lesioner av uveala melanom. I synnerhet har kromosomerna 1, 3, 6 och 8 studerats omfattande för deras samband med kortare överlevnadstid och utveckling av metastaserande sjukdom.

Medan genetiska avvikelser i kromosomerna 1, 6 och 8 inte självständigt har kunnat förutsäga sjukdomsprogression, har cytogenetisk profilering av kromosom 3 avslöjat en viktig genetisk region som är starkt associerad med metastatisk debut hos patienter med uvealt melanom. Kromosom 3-avvikelser har analyserats med hjälp av flera tekniker, inklusive fluorescens in situ hybridisering (FISH), kromosomal in situ hybridisering (CISH), array comparative genomic hybridization (aCGH), SNP, multiplex ligationsberoende probe amplifiering (MLPA) och mikrosatellitanalys .

Trots en mängd data som har identifierat sambandet mellan kromosom 3- mutation och UM-metastas, har den kliniska tillämpningen av dessa data ännu inte realiserats. Orsaker till osäkerheten kring kromosom 3 klinisk användning inkluderar:

höga falska positiva siffror (från 5-22 %)
höga falsk-negativa frekvenser (från 4-50 %)
höga tekniska felfrekvenser (upp till 50 %) på grund av det stora vävnadsbehovet för nuvarande analystekniker
de negativa effekterna av cellulär heterogenitet på kromosom 3 cytogenetisk analys.

Dessutom, till skillnad från DecisionDx-UM-testet, finns det inga publicerade, peer-reviewade studier som visar klinisk validering i en oberoende uppsättning patienter.

Castle Biosciences, Incorporated

Castle Biosciences, Incorporated är ett molekylärdiagnostikföretag som utvecklar diagnostiska och prognostiska analyser för sällsynta cancerformer. Castles uppdrag är att betjäna individer som lider av sällsynta cancerformer genom att erbjuda korrekta prognostiska tester som ger information för att fatta kritiska beslut angående en individs övervaknings- och behandlingsregimer. Förutom DecisionDx-UM erbjuder Castle prognostiska tester för melanom (DecisionDx-Melanom) och skivepitelcancer (DecisionDx-SCC). Castle är baserat i Friendswood, TX , och har verksamhet i Phoenix, AZ .

externa länkar