DDX3X

DDX3X
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, DBX, DDX14, DDX3, HLP2, CAP-Rf, MRX102, DEAD-box helicase 3, X-linked, DEAD-box helicase 3 X-linked, MRXSSB Externa
IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

ATP-beroende RNA-helikas DDX3X är ett enzym som hos människor kodas av DDX3X -genen .

Fungera

DEAD boxproteiner , kännetecknade av det konserverade motivet Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), är förmodade RNA- helikaser . De är inblandade i ett antal cellulära processer som involverar förändring av RNAs sekundära struktur, såsom translationsinitiering , nukleär och mitokondriell splitsning och ribosom- och spliceosomsammansättning . Baserat på deras distributionsmönster, tros vissa medlemmar av denna familj vara involverade i embryogenes, spermatogenes och cellulär tillväxt och delning. Denna gen kodar för ett DEAD box-protein, som interagerar specifikt med hepatit C-virusets kärnprotein, vilket resulterar i en förändring av den intracellulära placeringen. Denna gen har en homolog belägen i den icke-rekombinerande regionen av Y-kromosomen. Proteinsekvensen är 91 % identisk mellan denna gen och den Y-kopplade homologen.

Undercellulär trafficking

DDX3X utför sina funktioner i cellkärnan och cytoplasman och lämnar kärnan via exportin-1/CRM1 kärnexportvägen . Det rapporterades initialt att DDX3X-helikasdomänen var nödvändig för denna interaktion, medan de kanoniska egenskaperna hos trafikvägen, nämligen närvaron av en nukleär exportsignal (NES) på DDX3X och Ran-GTP som binder till exportin-1, var omöjliga. DDX3X-bindning till och trafik av exportin-1 har sedan dess visat sig inte kräva DDX3X-helikasdomänen och vara explicit NES- och Ran-GTP-beroende.

Roll i cancer

DDX3X är involverat i många olika typer av cancer. Till exempel uttrycks det onormalt i bröstepitelcancerceller där dess uttryck aktiveras av HIF1A under hypoxi . Ökat uttryck av DDX3X av HIF1A i hypoxi initieras av den direkta bindningen av HIF1A till HIF1A- svarselementet , vilket verifierats med kromatinimmunoutfällning och luciferasreporteranalys . Eftersom uttrycket av DDX3X påverkas av aktiviteten av HIF1A, har samlokaliseringen av dessa proteiner också visats i MDA-MB-231 xenografttumörprover .

I HeLa-celler rapporteras DDX3X kontrollera cellcykelprogression genom Cyclin El . Mer specifikt visades DDX3X direkt binda till 5´ UTR av Cyclin E1 och därigenom underlätta translationen av proteinet. Ökade proteinnivåer av Cyclin El visades förmedla övergången av S- fasinträde.

Melanomöverlevnad, migration och proliferation påverkas av DDX3X-aktivitet. Melanomceller med lågt DDX3X-uttryck uppvisar en hög migrationskapacitet, låg proliferationshastighet och minskad vemurafenib- känslighet. Medan celler som uttrycker hög DDX3X är läkemedelskänsliga, mer proliferativa och mindre migrerande. Dessa fenotyper kan förklaras av de translationella effekterna på melanomtranskriptionsfaktorn MITF . 5' UTR för MITF -mRNA:t innehåller ett komplext RNA-regulon ( IRES ) som binds och aktiveras av DDX3X. Aktivering av IRES leder till translation av MITF-mRNA. Möss injicerade med melanomceller med en raderad IRES visar mer aggressiv tumörprogression inklusive ökad lungmetastasering . Intressant nog påverkas DDX3X vid melanom av vemurafenib via en oupptäckt mekanism . Det är okänt hur DDX3X nedregleras av förekomsten av vemurafenib. Men minskade nivåer av DDX3X under läkemedelsbehandling förklarar utvecklingen av läkemedelsresistenta celler som ofta detekteras med lågt MITF- uttryck.

Klinisk signifikans

Mutationer av DDX3X -genen är associerade med medulloblastom . Vid melanom är det låga uttrycket av genen kopplat till en dålig överlevnad utan metastaser på avstånd . Dessutom är mRNA-nivån av DDX3X lägre i matchade melanombiopsier efter återfall för patienter som får vemurafenib och i fortskridande tumörer.

Mutationer av DDX3X-genen orsakar också DDX3X-syndrom , som främst drabbar kvinnor och uppträder med utvecklingsförsening eller funktionshinder, autism , ADHD och låg muskeltonus .

Se även

• Eukaryotisk översättning
• DExD/H boxproteiner
• DHX29

Vidare läsning

•   Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Roller av HIV-1 hjälpproteiner i viral patogenes och värd-patogen interaktioner" . Cellforskning . 15 (11–12): 923–34. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 .
•   Owsianka AM, Patel AH (maj 1999). "Hepatit C-virusets kärnprotein interagerar med ett mänskligt DEAD box-protein DDX3" . Virologi . 257 (2): 330–40. doi : 10.1006/viro.1999.9659 . PMID 10329544 .
•   Mamiya N, Worman HJ (maj 1999). "Hepatit C-virusets kärnprotein binder till en DEAD box RNA-helikas" . Journal of Biological Chemistry . 274 (22): 15751–6. doi : 10.1074/jbc.274.22.15751 . PMID 10336476 .
•    Yagüe J, Alvarez I, Rognan D, Ramos M, Vázquez J, de Castro JA (juni 2000). "En N-acetylerad naturlig ligand av humant histokompatibilitets leukocytantigen (HLA)-B39. Klassiskt stora histokompatibilitetskomplex klass I-proteiner binder peptider med en blockerad NH(2)-terminal in vivo" . Journal of Experimental Medicine . 191 (12): 2083–92. doi : 10.1084/jem.191.12.2083 . PMC 2193201 . PMID 10859333 .
•   Kim YS, Lee SG, Park SH, Song K (oktober 2001). "Genstruktur för den mänskliga DDX3 och kromosomkartläggning av dess relaterade sekvenser". Molekyler och celler . 12 (2): 209–14. PMID 11710523 .
•    Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (november 2003). "Reglering av alternativ splitsning av SRrp86 och dess interagerande proteiner" . Molekylär och cellulär biologi . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
•   Shu H, Chen S, Bi Q, Mumby M, Brekken DL (mars 2004). "Identifiering av fosfoproteiner och deras fosforyleringsställen i WEHI-231 B-lymfomcellinjen" . Molekylär och cellulär proteomik . 3 (3): 279–86. doi : 10.1074/mcp.D300003-MCP200 . PMID 14729942 .
•    Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (februari 2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Naturens cellbiologi . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
•   Yedavalli VS, Neuveut C, Chi YH, Kleiman L, Jeang KT (oktober 2004). "Krav på DDX3 DEAD box RNA helicase för HIV-1 Rev-RRE export funktion" . Cell . 119 (3): 381–92. doi : 10.1016/j.cell.2004.09.029 . PMID 15507209 .
•    Dayton AI (oktober 2004). "Inom dig, utan dig: HIV-1 Rev och RNA export" . Retrovirologi . 1 : 35. doi : 10.1186/1742-4690-1-35 . PMC 526764 . PMID 15516266 .
•    Krishnan V, Zeichner SL (december 2004). "Förändringar i uttrycket av DEAD-box och andra RNA-bindande proteiner under HIV-1-replikation" . Retrovirologi . 1 : 42. doi : 10.1186/1742-4690-1-42 . PMC 543576 . PMID 15588285 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (januari 2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Natur Bioteknik . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•    Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R, Eng JK, Li XJ, Bodenmiller B, Watts JD, Hood L, Aebersold R (augusti 2005). "Kvantitativ fosfoproteomanalys med användning av en dendrimerkonjugationskemi och tandemmasspektrometri". Naturmetoder . 2 (8): 591–8. doi : 10.1038/nmeth776 . PMID 16094384 . S2CID 20475874 .
•    Gevaert K, Staes A, Van Damme J, De Groot S, Hugelier K, Demol H, Martens L, Goethals M, Vandekerckhove J (september 2005). "Global fosfoproteomanalys på humana HepG2-hepatocyter med hjälp av omvänd fas diagonal LC". Proteomik . 5 (14): 3589–99. doi : 10.1002/pmic.200401217 . PMID 16097034 . S2CID 895879 .
•   Chang PC, Chi CW, Chau GY, Li FY, Tsai YH, Wu JC, Wu Lee YH (mars 2006). "DDX3, ett DEAD box RNA-helikas, är avreglerat i hepatitvirusassocierat hepatocellulärt karcinom och är involverat i celltillväxtkontroll" . Onkogen . 25 (14): 1991–2003. doi : 10.1038/sj.onc.1209239 . PMID 16301996 .