D-aspartatligas
| D | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| -aspartatligasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 6.3.1.12 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är ett D-aspartatligas ( EC 6.3.1.12 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- ATP + D-aspartat + [beta-GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D-Ala)]n [beta-GlcNAc-(1->4)-Mur 2 Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-6-N-(beta-D-Asp)-L- Lys-D -Ala-D-Ala)]n + ADP + fosfat
De fyra substraten för detta enzym är ATP , D-aspartat , [[beta-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D-Ala-D- ]], och [[Ala)]n]], medan dess 4 produkter är [[beta-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-6-N-( beta-D-Asp)-L-]], [[Lys-D-Ala-D-Ala)]n]], ADP och fosfat .
Detta enzym tillhör familjen ligaser , särskilt de som bildar kol-kvävebindningar som syra-D-ammoniak (eller amin) ligaser (amidsyntaser). Det systematiska namnet på denna enzymklass är D-aspartat:[beta-GlcNAc-(1->4)-Mur2Ac(oyl-L-Ala-gamma-D-Glu-L-Lys-D -Ala-D-Ala) ]n-ligas (ADP-bildande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar Aslfm , UDP-MurNAc-pentapeptid:D-aspartatligas och D-asparaginsyraaktiverande enzym .
- Staudenbauer W, Strominger JL (1972). "Aktivering av D-asparaginsyra för inkorporering i peptidoglykan". J. Biol. Chem . 247 (16): 5095–102. PMID 4262567 .
- Staudenbauer W, Willoughby E, Strominger JL (1972). "Ytterligare studier av det D-asparaginsyraaktiverande enzymet av Streptococcus faecalis och dess fäste vid membranet". J. Biol. Chem . 247 (17): 5289–96. PMID 4626717 .
- Galperin MY, Koonin EV (1997). "En mångfaldig superfamilj av enzymer med ATP-beroende karboxylatamin/tiolligasaktivitet" . Protein Sci . 6 (12): 2639–43. doi : 10.1002/pro.5560061218 . PMC 2143612 . PMID 9416615 .
- Heijenoort J, Legrand R, Brouard JP, Rice L, Mainardi JL (2006). "Aslfm, D-aspartatligaset som ansvarar för tillsatsen av D-asparaginsyra till peptidoglykanprekursorn till Enterococcus faecium" . J. Biol. Chem . 281 (17): 11586–94. doi : 10.1074/jbc.M600114200 . PMID 16510449 .
