D-alanin—D-alaninligas
| D-alanin—D- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| alaninligasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 6.3.2.4 | ||||||||
| CAS-nr. | 9023-63-6 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| D-ala D-ala ligas N-terminal | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 komplex av y216f d-ala:d-ala ligas med adp och ett fosforylfosfinat
| |||||||||
| Identifierare | |||||||||
| Symbol | Dala_Dala_lig_N | ||||||||
| Pfam | PF01820 | ||||||||
| InterPro | IPR011127 | ||||||||
| SCOP2 | 2dln / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| D-ala D-ala-ligas C-terminalkomplex | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
av y216f d-ala:d-ala-ligas med adp och ett
| |||||||||
| fosforylfosfinatidentifierare | |||||||||
| Symbol | Dala_Dala_lig_C | ||||||||
| Pfam | PF07478 | ||||||||
| Pfam klan | CL0179 | ||||||||
| InterPro | IPR011095 | ||||||||
| SCOP2 | 2dln / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Inom enzymologi är ett D-alanin-D-alaninligas ( EC 6.3.2.4 ) ett enzym som katalyserar den kemiska reaktionen
- ATP + 2 D-alanin ADP + fosfat + D-alanyl-D-alanin
Således är de två substraten för detta enzym ATP och D-alanin , medan dess 3 produkter är ADP , fosfat och D-alanyl-D-alanin.
Detta enzym tillhör familjen ligaser , speciellt de som bildar kol-kvävebindningar som syra-D-aminosyraligaser (peptidsyntaser). Det systematiska namnet på denna enzymklass är D-alanin:D-alaninligas (ADP-bildande) . Andra namn i vanlig användning inkluderar alanin:alaninligas (ADP-bildande) och alanylalaninsyntetas . Detta enzym deltar i d-alaninmetabolism och peptidoglykanbiosyntes. Fosfinat och D-cykloserin är kända för att hämma detta enzym .
Den N-terminala regionen av D-alanin-D-alaninligaset tros vara involverad i substratbindning , medan C-terminalen tros vara en katalytisk domän .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 8 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1EHI , 1IOV , 1IOW , 2DLN , 2FB9 , 2I80 , 2I87 och 2I8C .
Vidare läsning
- Ito, E; Strominger JL (1962). "Enzymatisk syntes av peptiden i bakteriella uridinnukleotider II. Enzymatisk syntes och tillägg av D-alanyl-D-alanin" . J. Biol. Chem . 237 : 2696-2703. doi : 10.1016/S0021-9258(19)73809-5 .
- Neuhaus FC (1962). "Kinetiska studier på D-Ala-D-Ala-syntetas". Fed. Proc . 21 :229.
- van Heijenoort J (2001). "De senaste framstegen i bildandet av den bakteriella peptidoglykanmonomerenheten". Nat. Driva. Rep . 18 (5): 503–19. doi : 10.1039/a804532a . PMID 11699883 .
