Caspase 6

CASP6
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, MCH2, Caspase 6, CSP-6
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Caspase-6 är ett enzym som hos människor kodas av CASP6 -genen . CASP6- ortologer har identifierats i många däggdjur för vilka fullständiga genomdata finns tillgängliga. Unika ortologer finns också hos fåglar , ödlor , lissamfiber och teleostar . Caspase-6 har kända funktioner vid apoptos , tidigt immunsvar och neurodegeneration vid Huntingtons och Alzheimers sjukdom .

Fungera

Denna gen kodar för ett protein som är en medlem av familjen cystein - asparaginsyraproteas ( kaspas ) . Sekventiell aktivering av kaspaser spelar en central roll i exekveringsfasen av cellapoptos . Kaspaser existerar som inaktiva proenzymer som genomgår proteolytisk bearbetning vid konserverade asparaginsyrarester för att producera två subenheter, stora och små, som dimeriserar för att bilda det aktiva enzymet. Detta protein bearbetas av kaspas 7 , 8 och 10 och tros fungera som ett nedströms enzym i kaspasaktiveringskaskaden. Caspase 6 kan också genomgå självbearbetning utan andra medlemmar av kaspasfamiljen. Alternativ splitsning av denna gen resulterar i två transkriptvarianter som kodar för olika isoformer.

Caspase-6 spelar en roll i det tidiga immunsvaret via de-repression. Det minskar uttrycket av det immunsuppressiva cytokinet interleukin-10 och klyver makrofagen som undertrycker IRAK-M .

Med avseende på neurodegeneration , klyver kaspas-6 HTT vid Huntingtons och APP vid Alzheimers sjukdom . Resulterar i båda fallen i proteinaggregation av fragmenten.

Interaktioner

Caspase 6 har visat sig interagera med Caspase 8 .

Se även

• Proteolyskartan
• Caspase

Vidare läsning

•   Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (1995). "CPP32, ett nytt humant apoptotiskt protein med homologi med Caenorhabditis elegans celldödsprotein Ced-3 och däggdjursinterleukin-1 beta-omvandlande enzym" . J. Biol. Chem . 269 ​​(49): 30761–4. doi : 10.1016/S0021-9258(18)47344-9 . PMID 7983002 .
•    Takahashi A, Alnemri ES, Lazebnik YA, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Moir RD, Goldman RD, Poirier GG, Kaufmann SH, Earnshaw WC (1996). "Klyvning av lamin A med Mch2 alfa men inte CPP32: multipla interleukin 1 beta-omvandlande enzymrelaterade proteaser med distinkta substratigenkänningsegenskaper är aktiva i apoptos" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (16): 8395–400. Bibcode : 1996PNAS...93.8395T . doi : 10.1073/pnas.93.16.8395 . PMC 38682 . PMID 8710882 .
•   Bullrich F, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES, Croce CM (1997). "Kromosomal kartläggning av celldödsproteaser CPP32, MCH2 och MCH3". Genomik . 36 (2): 362–5. doi : 10.1006/geno.1996.0476 . PMID 8812467 .
•   Srinivasula SM, Fernandes-Alnemri T, Zangrilli J, Robertson N, Armstrong RC, Wang L, Trapani JA, Tomaselli KJ, Litwack G, Alnemri ES (1996). "Den Ced-3/interleukin 1beta-omvandlande enzymliknande homologen Mch6 och det laminklyvande enzymet Mch2alpha är substrat för den apoptotiska mediatorn CPP32" . J. Biol. Chem . 271 (43): 27099–106. doi : 10.1074/jbc.271.43.27099 . PMID 8900201 .
•    Srinivasula SM, Ahmad M, Fernandes-Alnemri T, Litwack G, Alnemri ES (1997). "Molekylär ordning av den Fas-apoptotiska vägen: Fas/APO-1-proteaset Mch5 är ett CrmA-inhiberbart proteas som aktiverar flera Ced-3/ICE-liknande cysteinproteaser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (25): 14486–91. Bibcode : 1996PNAS...9314486S . doi : 10.1073/pnas.93.25.14486 . PMC 26159 . PMID 8962078 .
•    Rao L, Perez D, White E (1997). "Laminproteolys underlättar nukleära händelser under apoptos" . J. Cell Biol . 135 (6 Pt 1): 1441–55. doi : 10.1083/jcb.135.6.1441 . PMC 2133948 . PMID 8978814 .
•    Kim TW, Pettingell WH, Jung YK, Kovacs DM, Tanzi RE (1998). "Alternativ klyvning av Alzheimer-associerade preseniliner under apoptos av ett proteas från kaspas-3-familjen". Vetenskap . 277 (5324): 373–6. CiteSeerX 10.1.1.1025.8052 . doi : 10.1126/science.277.5324.373 . PMID 9219695 .
•   Srinivasula SM, Ahmad M, Ottilie S, Bullrich F, Banks S, Wang Y, Fernandes-Alnemri T, Croce CM, Litwack G, Tomaselli KJ, Armstrong RC, Alnemri ES (1997). "FLAME-1, en ny FADD-liknande anti-apoptotisk molekyl som reglerar Fas/TNFR1-inducerad apoptos" . J. Biol. Chem . 272 (30): 18542–5. doi : 10.1074/jbc.272.30.18542 . PMID 9228018 .
•    Caulín C, Salvesen GS, Oshima RG (1997). "Kaspasklyvning av Keratin 18 och omorganisation av mellanliggande filament under epitelcellapoptos" . J. Cell Biol . 138 (6): 1379–94. doi : 10.1083/jcb.138.6.1379 . PMC 2132555 . PMID 9298992 .
•    Hirata H, Takahashi A, Kobayashi S, Yonehara S, Sawai H, Okazaki T, Yamamoto K, Sasada M (1998). "Kaspaser aktiveras i en grenad proteaskaskad och kontrollerar distinkta nedströmsprocesser i Fas-inducerad apoptos" . J. Exp. Med . 187 (4): 587–600. doi : 10.1084/jem.187.4.587 . PMC 2212161 . PMID 9463409 .
•   Harvey KF, Harvey NL, Michael JM, Parasivam G, Waterhouse N, Alnemri ES, Watters D, Kumar S (1998). "Kaspasmedierad klyvning av ubiquitin-proteinligas Nedd4 under apoptos" . J. Biol. Chem . 273 (22): 13524–30. doi : 10.1074/jbc.273.22.13524 . PMID 9593687 .
•   Utz PJ, Hottelet M, Le TM, Kim SJ, Geiger ME, van Venrooij WJ, Anderson P (1999). "72-kDa-komponenten av signaligenkänningspartikeln klyvs under apoptos" . J. Biol. Chem . 273 (52): 35362–70. doi : 10.1074/jbc.273.52.35362 . PMID 9857079 .
•   Samejima K, Svingen PA, Basi GS, Kottke T, Mesner PW, Stewart L, Durrieu F, Poirier GG, Alnemri ES, Champoux JJ, Kaufmann SH, Earnshaw WC (1999). "Kaspasmedierad klyvning av DNA-topoisomeras I vid okonventionella ställen under apoptos" . J. Biol. Chem . 274 (7): 4335–40. doi : 10.1074/jbc.274.7.4335 . PMID 9933635 .
•    Walter J, Schindzielorz A, Grünberg J, Haass C (1999). "Fosforylering av presenilin-2 reglerar dess klyvning av kaspaser och fördröjer utvecklingen av apoptos" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (4): 1391–6. Bibcode : 1999PNAS...96.1391W . doi : 10.1073/pnas.96.4.1391 . PMC 15473 . PMID 9990034 .
•    van de Craen M, de Jonghe C, van den Brande I, Declercq W, van Gassen G, van Criekinge W, Vanderhoeven I, Fiers W, van Broeckhoven C, Hendriks L, Vandenabeele P (1999). "Identifiering av kaspaser som klyver presenilin-1 och presenilin-2. Fem presenilin-1 (PS1) mutationer förändrar inte känsligheten hos PS1 för kaspaser" (PDF ) . FEBS Lett . 445 (1): 149–54. doi : 10.1016/S0014-5793(99)00108-8 . hdl : 10067/238040151162165141 . PMID 10069390 . S2CID 31218178 .
•    Xanthoudakis S, Roy S, Rasper D, Hennessey T, Aubin Y, Cassady R, Tawa P, Ruel R, Rosen A, Nicholson DW (1999). "Hsp60 accelererar mognaden av pro-kaspas-3 av aktivatorproteaser uppströms under apoptos" . EMBO J . 18 (8): 2049–56. doi : 10.1093/emboj/18.8.2049 . PMC 1171289 . PMID 10205159 .

externa länkar

• MEROPS onlinedatabas för peptidaser och deras inhibitorer : C14.005
• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P55212 (Human Caspase-6) i PDBe-KB .