Cap-oberoende översättningselement
Inom molekylärbiologi är ett cap -oberoende translationselement ( CITE eller 3'CITE ) en RNA- sekvens som finns i 3'UTR hos många RNA - växtvirus .
Eukaryota mRNA innehåller en 5' cap-struktur som krävs för effektiv bindning av translationsinitieringsfaktorer . Många virala mRNA saknar 5'-locket, djurvirus-mRNA innehåller ofta ett internt ribosominträdesställe som fungerar vid translationsinitiering. Många växtvirala mRNA innehåller ett cap-oberoende translationselement. Dessa element medierar initiering av translation av proteinerna som kodas i mRNA:t genom att antingen rekrytera translationsinitieringsfaktorer eller den ribosomala 60S-subenheten till det virala RNA:t. I RNA2 av Rödklöver nekrotisk mosaikvirus (RCNMV) krävs det cap-oberoende translationselementet för negativ sträng RNA-syntes.
Det finns många olika strukturella klasser av cap-oberoende translationselement, utan någon uppenbar strukturell eller sekvenslikhet:
| Strukturera | Exempel art |
|---|---|
| TED (domän för översättningsförstärkare) | Satellittobaksnekrosvirus (STNV) |
| BTE (BYDV-liknande översättningselement) | Korngul dvärgvirus (BYDV) |
| PTE (PMV-liknande översättningselement) | Panicum mosaic virus (PMV) |
| TSS (T-formad struktur) | Rova skrynkelvirus (TCV) |
| Y-formad | Tomat bushy stuntvirus (TBSV) |
| jag-formad | Majsnecrotic streak virus (MNeSV) |
Se även
Vidare läsning
- Nicholson, BL; Zaslaver, O; Mayberry, LK; Browning, KS; White, KA (feb 2013). "Tombusvirus Y-Shaped Translational Enhancer bildar ett komplex med eIF4F och kan funktionellt ersättas av heterologa Translational Enhancers" . Journal of Virology . 87 (3): 1872–1883. doi : 10.1128/JVI.02711-12 . PMC 3554133 . PMID 23192876 .