Luteovirus cap-oberoende översättningselement
| Luteovirus cap-oberoende translationselement (BTE) | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av BTE-
| |
| identifierare | |
| Symbol | BÖ |
| Rfam | RF00434 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Cis-reg |
| Domän(er) | Virus |
| SÅ | SO:0000233 |
| PDB- strukturer | PDBe |
Korngul dvärgvirus -liknande cap-oberoende translationselement (BTE) är ett RNA-element som finns i 3' UTR hos vissa luteovirus . Detta element förmedlar translation av genomiskt RNA och subgenomiskt RNA1 (sgRNA1).
BÖ:er har en konsensussekvens, GGAUCCUGGGAAACAGG, inbäddad i serier om tre till sex stamslingor som strålar ut från ett centralt nav.
BTE har visat sig binda till eIF4G och svagt till eIF4E (proteiner involverade i translationsinitiering). BTE tillåter translationsinitiering av ett mRNA utan ett 7mG lock (krävs för translation i de flesta eukaryota mRNA). Andra former av cap-oberoende translationselement (CITE) finns (främst i växtvirus från växtvirussläktena Luteovirus, Necrovirus, Dianthovirus och Umbravirus, men även i vissa värd-mRNA; särskilt många värmechock -mRNA saknar ett 7mG lock men är fortfarande översatt). Det allmänna syftet med BTE och dessa andra CITE:s är att få ribosomen att börja translation utan 7mG-locket. I fallet med BTE "lurar" det eIF4F (eIF4E, eIF4G är delar av eIF4F) att "berätta" för ribosomen att ett 7mG lock är närvarande.