Calpain-2
| Calpain-2- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| EG nr. | 3.4.22.53 | ||||||||
| CAS-nr. | 702693-80-9 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
Calpain-2 ( EC 3.4.22.53 , kalciumaktiverat neutralt proteas II , m-calpain , milli-calpain ) är ett intracellulärt heterodimert kalciumaktiverat cysteinproteas. Detta enzym katalyserar följande kemiska reaktion
- Bred endopeptidasspecificitet _
Detta enzym tillhör peptidasfamiljen C2. Det är ett av 15 proteiner i calpainfamiljen.
Strukturera
Calpain-2 är en heterodimer av en katalytisk subenhet som kodas av CAPN2-genen och en regulatorisk subenhet CAPNS1. Den katalytiska subenheten består av fyra domäner: proteaskärna 1-domän (PC1), proteaskärna 2-domän (PC2), calpain-typ beta-sandwich-liknande domän (CBSW) och penta EF-handdomän (PEF(L)). Den katalytiska klyftan bildas av PC1 och PC2 vid kalciumbindning. Den katalytiska triaden består av resterna C105, H262 och N286. Anmärkningsvärt, CAPN2 innehåller också en N-terminal ankarspiral, som dock klyvs av vid proteasaktivering. Det tros spela en roll i en reglering av katalytisk aktivitet.
Den regulatoriska subenheten består av två domäner: en glycinrik domän (GR) och penta EF-handdomän (PEF(S)). Interaktionen mellan PEF(S) och PEF(L) genom ett oparat EF-handmotiv orsakar dimerisering av de två underenheterna. Calpain-2-heterodimer är mycket homolog med calpain-1, som bildas av en katalytisk CAPN1- och en regulatorisk CAPNS1-subenhet.
Egenskaper
Det finns ingen känd konsensussekvens för calpain-2-proteolys, men det finns bevis för över 130 potentiella substrat. Proteolytisk klyvning av calpain-2 regleras av närvaron av Ca 2+ -joner. Det kräver suprafysiologisk (låg millimolar) koncentration av Ca 2+ för aktivering. Intracellulär koncentration av Ca 2+ (ca 100 nM) är otillräcklig för att aktivera calpain-2, så aktivering sker vid inflöde av joner från extracellulärt utrymme eller från endoplasmatiskt retikulum. Dessutom kan calpain-1/2 hämmas av calpastatin (kodas av CAST-genen) som binder till PEF-domänerna i de katalytiska och regulatoriska subenheterna av calpains-1/2. Det förbjuder substratbindning till det aktiva stället genom steriskt hinder.
Calpain-2 i cancer
Uppreglering av calpain-2 är kopplad till ökad aggressivitet av cancer. Det finns bevis som tyder på att verkningsmekanismen är genom klyvning av substrat involverade i cellmigration, invasion och känslighet för kemoterapeutiska medel.
Domännomenklatur
Tidigare använd nomenklatur använde romerska siffror för att beteckna calpain-2-domäner som börjar från N-terminalen av CAPN2 och slutar vid C-terminalen av CAPNS1. Till exempel hänvisades PEF(L) och PEF(S) till som domän IV respektive domän VI.
Se även
externa länkar
- Calpain-2 vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
