Acetoanaerobium sticklandii

Acetoanaerobium sticklandii
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Bakterie
Provins:	Bacillota
Klass:	Clostridia
Beställa:	Eubacteriales
Familj:	Peptostreptococcaceae
Släkte:	Acetoanaerobium
Arter:	A. sticklandii
Binomialt namn
	Acetoanaerobium sticklandii; (Stadtman och McClung 1957) Galperin et al. 2016
Synonymer
	Clostridium sticklandii Stadtman och McClung 1957

Acetoanaerobium sticklandii är en anaerob , rörlig , gram-positiv bakterie . Den isolerades först 1954 från den svarta leran i San Francisco Bay Area av TC Stadtman, som också namngav arten. A. sticklandii är inte patogen hos människor.

Biologi och biokemi

Acetoanaerobium sticklandii fermenterar aminosyror genom att använda Stickland-reaktionen , som kopplar oxidation av en aminosyra och reduktion av en annan. LH Stickland beskrev denna process 1934. Enzymerna i Stickland-reaktionen är D-prolinreduktas (en elektronacceptor) och Glycinreduktas . A. sticklandii använder företrädesvis treonin, arginin, serin, cystein, prolin och glycin under tillväxtfasen och lysin under den stationära fasen, medan de utsöndrar glutamat, aspartat och alanin. ^{[ citat behövs ]}

Selenoproteiner kan hittas i genomet av A. sticklandii . Ett sådant selenoprotein, glycinreduktas A, identifierades först i A. sticklandii . A. sticklandii använder totalt åtta av dessa selenoproteiner. Ett av dessa, PrdC, ansågs tidigare inte vara ett selenoprotein. PrdC, som liknar RnfC i andra arter, finns inom D-prolinreduktasoperonet. D-prolinreduktasoperonet är ansvarigt för den reduktiva ringklyvningen av D-prolin till 5-aminovalerat. 5-aminovalerat utsöndras med Cl. sticklandii . ^{[ citat behövs ]}

Även om energibesparing i A. sticklandii uppnås genom fosforylering på substratnivå, kan den också uppnås via elektrontransportfosforylering. Rnf-komplexet, ett Na+-beroende F-ATPas , V-ATPas och ett membranbundet pyrofosfatas tjänar som metoder för att spara energi genom elektrontransportfosforylering. ^{[ citat behövs ]}

På en annan intressant notering har A. sticklandii två koldioxidfixeringsvägar, Wood-Ljundgahl och Glycinsyntas /glycinreduktasvägar. Det är en märklighet att hitta båda dessa metoder för koldioxidfixering samtidigt. Endast fyra andra bakteriearter har observerats innehålla båda dessa vägar. Även om A. sticklandii har förmågan att använda båda vägarna, har det inte fastställts om de använder båda vägarna samtidigt. ^{[ citat behövs ]}

Även om den anses vara en obligatorisk anaerob, har A. sticklandii gener som gör att bakterien kan odlas under aeroba förhållanden. Några av proteinerna tillverkade av A. sticklandii som möjliggör reparation av skador från syreexponering inkluderar Mn-superoxiddismutas och superoxidreduktas , alkylhydroperoxidreduktas, rubrerytrin , glutationperoxidaser , selenperoxiredoxin, tioredoxinberoende peroxidas och sulfoxidreduktaser. och B.

Genom

Acetoanaerobium sticklandii har ett genom som består av en cirkulär kromosom. På denna kromosom finns 2 715 461 baspar. Av dessa baspar finns det 2573 kodande sekvenser med endast 2,1 % av genomet upprepat. A. sticklandii delar det högsta antalet gener som är homologa med Clostridioides difficile (en patogen art i Peptostreptococcaceae ) och med två medlemmar av släktet Alkaliphilus . ^{[ citat behövs ]}

Anteckningar

Fonknechten, N; Chaussonnerie, S; et al. (2010), "Clostridium sticklandii, en specialist på aminosyranedbrytning: återbesöker dess metabolism genom dess genomsekvens", BMC Genomics , 11 : 555–567, doi : 10.1186/1471-2164-11-555 , PMC 4091 0PM 309 070 20910
Stadtman, Thressa; McClung, LS (februari 1957). "Clostridium Sticklandii nov. spec" . J Bacteriol . 73 (2): 218–219. doi : 10.1128/JB.73.2.218-219.1957 . PMC 289777 . PMID 13416172 .
Hao-Ping Chen; Shih-Hsiung Wu; et al. (2001), "Klonning, sekvensering, heterologt uttryck, rening och karakterisering av adenosylkobalamin-beroende d-ornitinaminomutas från Clostridium sticklandii", Journal of Biological Chemistry , 276 (48): 44744–50, doi : 10.105204 / 10.105200 / 10.105204 / 10.105200 , PMID 11577113

externa länkar