ARHGEF7

ARHGEF7
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, BETA-PIX, COOL-1, COOL1, Nbla10314, P50, P50BP, P85, P85COOL1, P85SPR, PAK3, PIXB, Rho guanin nukleotid utbytesfaktor 7 Externa
ID :n
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Rho guanin nukleotidutbytesfaktor 7 är ett protein som hos människor kodas av ARHGEF7 -genen .

ARHGEF7 är allmänt känd som p 21- ett aktiverat proteinkinas e x förändringsfaktor beta (beta-PIX eller βPIX), eftersom det identifierades genom att binda till p21 -aktiverat kinas (PAK) och även innehåller en guanin-nukleotidutbytesfaktordomän .

Domäner och funktioner

βPIX är ett multidomänprotein som fungerar både som ett signalerande ställningsprotein och som ett enzym . βPIX delar denna domänstruktur och signalfunktion med det mycket liknande ARHGEF6/αPIX -proteinet.

βPIX genomgår omfattande alternativ splitsning för att generera multipla variantproteiner som innehåller eller saknar särskilda proteindomäner. Vuxna former saknar alla den aminoterminala CH-domänen, och de två stora vuxna varianterna har alternativa karboxylterminala regioner (benämnda β1 och β2): β1-former innehåller trimeriseringsdomänen med lindad spiral och PDZ-målmotivet för bindning till PDZ-proteiner (se nedan), medan β2-former saknar både domäner och deras motsvarande funktioner.

βPIX innehåller en central DH/PH RhoGEF-domän som fungerar som en guanin-nukleotidutbytesfaktor (GEF) för små GTPaser från Rho-familjen , och specifikt Rac och Cdc42 . Liksom andra GEF kan βPIX främja både frisättning av GDP från ett inaktivt litet GTP-bindande protein och bindning av GTP för att främja dess aktivering. Signaleringsställningar binder till specifika partner för att främja effektiv signalöverföring genom att arrangera sekventiella element av en väg nära varandra för att underlätta interaktion/informationsöverföring, och även genom att hålla dessa partnerproteinkomplex på specifika platser i cellen för att främja lokal eller regional signalering. I fallet med βPIX binder dess SH3-domän till partnerproteiner med lämpliga polyprolinmotiv, och särskilt till grupp I p21-aktiverade kinaser (PAK) ( PAK1 , PAK2 och PAK3 ). PAK är bundet till βPIX SH3-domänen i det inaktiva tillståndet, och aktiverad Rac1- eller Cdc42 - bindning till denna PAK stimulerar dess proteinkinasaktivitet , vilket leder till nedströms målproteinfosforylering ; eftersom βPIX kan aktivera de "p21'' små GTPaserna Rac1 eller Cdc42 genom sin GEF-aktivitet, exemplifierar detta βPIX/PAK/Rac-komplex en ställningsfunktion.

Strukturellt sätter βPIX samman som en trimer genom en karboxylterminal lindad spoldomän som finns i den huvudsakliga karboxylterminala splitsningsvarianten β1 och interagerar vidare med dimerer av GIT1 eller GIT2 genom en närliggande GIT-bindande domän för att bilda oligomer GIT-PIX komplex. Genom detta GIT-PIX-komplex förstärks ställningsfunktionen hos βPIX genom att även kunna hålla GIT-partners i närheten av βPIX-partners. Däremot saknar β2-karboxylterminala varianter denna coiled-coil-region och förutsägs vara oförmögna att trimerisera. Den huvudsakliga karboxylterminala varianten β1 har också ett PDZ-domänbindande målmotiv som binder till PDZ-domänerna i SHANK1- , scribble- och SNX27 -proteiner. Vissa splitsningsvarianter av βPIX innehåller en aminoterminal Calponin Homology (CH) domän vars funktioner förblir relativt dåligt definierade, men kan interagera med parvin/affixinfamiljens proteiner. βPIX-varianter med denna utökade aminoterminala CH-domän är mest uttryckta tidigt i utvecklingen, men verkar sällsynta efter födseln.

Interaktioner

βPIX har rapporterats interagera med över 120 proteiner.

Viktiga interagerande proteiner inkluderar:

I sig själv, eller den mycket relaterade ARHGEF6/αPIX via en trimerisk spiral-spiral-interaktion.
GIT1- eller GIT2- dimerer via GIT-bindande domän.
p21-aktiverade kinaser (PAK) 1, 2 och 3 via SH3-domän.
c-Cbl via SH3-domän.
Rho-familjen GTP-bindande proteinfamiljemedlemmar Rac1 och Cdc42 , aktiverad via DHPH RhoGEF-domän .
De neuronala synapsadaptrarna SHANK1 , SHANK2 och SHANK3 via PDZ
Klottra via PDZ
SNX27 via PDZ