SKRIVARE

SKRIVARE
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CRIB1, SCRB1, SCRIB1, Vartul, klottrat plancellpolaritetsprotein, klottrat plancellpolaritetsprotein, oSCRIB
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

För den tidiga bärbara datorn, se Scrib .

SCRIB , även känd som Scribble , SCRIBL eller Scribbled homolog (Drosophila) , är ett ställningsprotein som hos människor kodas av SCRIB -genen . Det isolerades ursprungligen i Drosophila melanogaster i en väg (även känd som Scribble-komplexet) med DLGAP5 (Discs large) och LLGL1 (Dödliga jättelarver) som en tumörsuppressor. Hos människor finns SCRIB som ett membranprotein och är involverat i cellmigration , cellpolaritet och cellproliferation i epitelceller . Det finns också starka bevis för att SCRIB kan spela en roll i cancerprogression på grund av dess starka homologi med Drosophila-proteinet.

Fungera

I Drosophila melanogaster är SCRIB involverad i synaptisk funktion, neuroblastdifferentiering och epitelial polarisering. Mekanistiskt är den humana homologen ett ställningsprotein kopplat till cellulär differentiering centrerad på regleringen av epitelial såväl som neuronal morfogenes. Brist på SCRIB försämrar många aspekter av cellpolaritet och cellrörelser . SCRIB är sannolikt också involverad i att etablera apikal-basal polaritet såväl som progression från G1-fasen till S-fasen i cellcykeln som ett resultat av dess samband med cellproliferation och exocytos .

De transkriberade proteinprodukterna från SCRIB-genen tillsammans med DLGAP5 (Discs large) och LLGL1 (Dödliga jättelarver) är komponenter i Scribble-komplexet som är lokaliserat i det basolaterala membranet. Scribble-komplexet spelar en roll vid bestämning av cellpolaritet och cellproliferation i epitelceller . Den exakta mekanismen genom vilken dessa proteiner fungerar tillsammans är för närvarande okänd, men de har varit inblandade i flera signalvägar, vesikelhandel och i myosin II -aktincytoskelettet. Scribble-komplexet har visat sig främja basolateral membranidentitet genom att antagonisera både Par-komplexet och Crumbs-komplexet, vilket främjar apikal membranidentitet. Dessa gener har också identifierats som tumörsuppressorer i Drosophila melanogaster . Eftersom dessa gener är mycket konserverade hos människor finns det bevis för att de spelar en roll i cancerutvecklingen.

Strukturera

Den humana homologen är ett LAP-protein, det innehåller 16 leucinrika upprepningar och fyra PDZ-domäner . SCRIB tillhör ett proteinkomplex som innehåller betaPIX, en utbytesfaktor för Rac/Cdc42, och GIT1 , ett GTPase-aktiverande protein för ARF6 som är inblandat i receptoråtervinning och exocytos.

Subcellulär och vävnadsfördelning

SCRIB finns oftast i cellmembranet som ett perifert membranprotein . Scribble-komplexet är lokaliserat vid det basolaterala membranet. SCRIB finns också i cellulära junctions såsom adherens junctions och tight junctions . Specifikt är det lokaliserat i njure , skelettmuskler , lever , lunga , bröst , tarm , placenta och epitelceller .

Klinisk signifikans

PDZ -domänen av SCRIB binder direkt till det humana papillomvirus E6-proteinet. SCRIB är inriktat på ubiquitination av ett komplex av E6 och UBE3A och E6 inducerar nedbrytning av SCRIB.

Roll som tumördämpare

Som nämnts ovan har SCRIB identifierats som en tumörsuppressor tillsammans med DLGAP5 (Discs large) och LLGL1 (Dödliga jättelarver). Specifikt har SCRIB-defekta mutanter visat sig främja aktiviteten hos många onkogener . Till exempel är SCRIB känt för att hämma bröstcancerbildning och utarmningen av SCRIB främjar neoplastisk tillväxt genom att störa morfogenesen och hämma celldöd genom en association med Myc . I humana celler som uttrycker onkogen Ras eller Raf, visade det sig att förlusten av SCRIB resulterade i invasionen av den extracellulära matrisen av olika celltyper. Detta tros vara ett direkt resultat av reglering av MAP-kinasvägen av SCRIB.

Roll i epitelial mesenkymal övergång (EMT)

På grund av sin roll i cellpolaritet och cellmotilitet har SCRIB också varit inblandad i epitelial mesenkymal övergång (EMT), som är kopplad till tumörmetastaser och proliferation i många cancerformer . EMT är inblandat i cancerprogression genom att tillåta statiska epitelceller att bli migrerande och tillåta dessa celler att anpassa sig till och kolonisera nya miljöer. I cancerösa epitelvävnader återfinns SCRIB främst i cytosolen i motsats till dess vanliga placering i membranet, vilket ytterligare implicerar en roll i tumörprogression och EMT för SCRIB.

Knockdown-mutanter har resulterat i förlust av vidhäftning mellan Madin-Darby hundnjurepitelceller. Denna förlust av vidhäftning var korrelerad med ett förvärvat mesenkymalt utseende, en ökning av rörlighet och förlust av riktningsförmåga. Dessa effekter var ett direkt resultat av avbrottet av E-cadherin- medierad cellulär adhesion. En minskning av cellmigration och en total minskning av cellmotilitetsmarkörer såväl som epiteliala mesenkymala övergångsmediatorer observerades också i små lungadenokarcinomceller som var utarmade på SCRIB.

Vidare läsning

•   Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, et al. (2003). "Konstruktion av expressionsfärdiga cDNA-kloner för KIAA-gener: manuell kuration av 330 KIAA-cDNA-kloner" . DNA Res . 9 (3): 99–106. doi : 10.1093/dnares/9.3.99 . PMID 12168954 .
•   Nagase T, Seki N, Tanaka A, et al. (1996). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. IV. De kodande sekvenserna för 40 nya gener (KIAA0121-KIAA0160) härledd genom analys av cDNA-kloner från human cellinje KG-1" . DNA Res . 2 (4): 167–74, 199–210. doi : 10.1093/dnares/2.4.167 . PMID 8590280 .
•    Nakagawa S, Huibregtse JM (2000). "Human klotter (Vartul) är inriktad på ubiquitin-medierad nedbrytning av högriskpapillomvirus E6-proteiner och E6AP ubiquitin-proteinligas" . Mol. Cell. Biol . 20 (21): 8244–53. doi : 10.1128/MCB.20.21.8244-8253.2000 . PMC 86433 . PMID 11027293 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Dow LE, Brumby AM, Muratore R, et al. (2004). "hScrib är en funktionell homolog av Drosophila-tumörsuppressorn Scribble" . Onkogen . 22 (58): 9225–30. doi : 10.1038/sj.onc.1207154 . PMID 14681682 .
•    Nakagawa S, Yano T, Nakagawa K, et al. (2004). "Analys av uttrycket och lokaliseringen av ett LAP-protein, mänsklig klotter, i det normala och neoplastiska epitelet i livmoderhalsen. " Br. J. Cancer . 90 (1): 194–9. doi : 10.1038/sj.bjc.6601465 . PMC 2395302 . PMID 14710229 .
•    Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
•   Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, et al. (2004). "Robust fosfoproteomisk profilering av tyrosinfosforyleringsställen från mänskliga T-celler med hjälp av immobiliserad metallaffinitetskromatografi och tandemmasspektrometri". Anal. Chem . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
•    Lehner B, Sanderson CM (2004). "En proteininteraktionsram för nedbrytning av humant mRNA" . Genome Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
•   Borg JP (2004). "[hScrib: en potentiell ny tumörsuppressor]". Patol. Biol . 52 (6): 328–31. doi : 10.1016/j.patbio.2003.09.015 . PMID 15261375 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•   Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2005). "Fosfoproteomisk analys av den utvecklande mushjärnan" . Mol. Cell. Proteomik . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Status, kvalitet och expansion av NIHs fullängds cDNA-projekt: Mammalian Gene Collection (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Petit MM, Meulemans SM, Alen P, et al. (2006). "Tumörsuppressorn Scrib interagerar med det zyxinrelaterade proteinet LPP, som pendlar mellan cellvidhäftningsställen och kärnan. " BMC Cell Biol . 6 (1): 1. doi : 10.1186/1471-2121-6-1 . PMC 546208 . PMID 15649318 .
•    Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, et al. (2005). "High-throughput kartläggning av ett dynamiskt signalnätverk i däggdjursceller". Vetenskap . 307 (5715): 1621–5. Bibcode : 2005Sci...307.1621B . doi : 10.1126/science.1105776 . PMID 15761153 . S2CID 39457788 .
•    Lahuna O, Quellari M, Achard C, et al. (2005). "Tyrotropinreceptorhandeln är beroende av hScrib-betaPIX-GIT1-ARF6-vägen" . EMBO J . 24 (7): 1364–74. doi : 10.1038/sj.emboj.7600616 . PMC 1142541 . PMID 15775968 .
•   Navarro C, Nola S, Audebert S, et al. (2005). "Junctional rekrytering av däggdjurs Scribble bygger på E-cadherin engagemang" . Onkogen . 24 (27): 4330–9. doi : 10.1038/sj.onc.1208632 . PMID 15806148 .
•    Métais JY, Navarro C, Santoni MJ, et al. (2005). "hScrib interagerar med ZO-2 vid cell-cell-övergången mellan epitelceller" . FEBS Lett . 579 (17): 3725–30. doi : 10.1016/j.febslet.2005.05.062 . PMID 15975580 . S2CID 4893407 .
•   Thomas M, Massimi P, Navarro C, et al. (2005). "HScrib/Dlg apico-basala kontrollkomplexet är differentiellt målinriktat av HPV-16 och HPV-18 E6-proteiner" . Onkogen . 24 (41): 6222–30. doi : 10.1038/sj.onc.1208757 . PMID 16103886 .