Xanthanlyas
| xantanlyas- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| EG nr. | 4.2.2.12 | ||||||||
| CAS-nr. | 113573-69-6 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Enzymet xantanlyas ( EC 4.2.2.12 ) katalyserar följande process :
- Eliminativ klyvning av den terminala β- D -mannosyl-(1→4)-β- D -glukuronosylbindningen av sidokedjan av polysackariden xantan, vilket lämnar en 4-deoxi-a- L - treo -hex -4-enuronosyl grupp vid änden av sidokedjan
Det tillhör familjen lyaser , speciellt de kol-syrelyaser som verkar på polysackarider. Xantanlyas identifierades först och renades delvis 1987.
Xantan är en polysackarid som utsöndras av flera olika bakteriella taxa, såsom växtpatogenen Xanthomonas campestris , och den består av en huvudsaklig linjär kedja baserad på cellulosa med sidokedjor bundna till alternativa glukosyl (glukos) rester. Dessa sidokedjor innehåller tre monosackaridrester. Xantanlyas produceras av bakterier som bryter ned denna polysackarid, såsom Bacillus , Corynebacterium , Bacteroides , Ruminococcaceae och Paenibacillus -arter.
Industriella tillämpningar
Xantan används inom industrin som förtjockningsmedel i livsmedel och drycker, som stabiliseringsmedel för skum, som ett medel för att förbättra oljeåtervinningen och vid tillverkning av varor som färger, kosmetika och sprängämnen. Användningen av xantanlyas som ett sätt att förändra de fysikaliska egenskaperna hos xantaner är ett område för aktuell forskning inom bioteknik .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 7 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB- accessionskoderna 1J0M , 1J0N , 1X1H , 1X1I , 1X1J , 2E22 och 2E24 . Enzymet från Bacillus är en monomer som består av två domäner : en alfaspiralformad N-terminal domän och en C-terminal domän som består av beta-ark . Den aktiva platsen är en djup klyfta mellan dessa två domäner.
- Sutherland IW (1987). "Xantanlyaser - nya enzymer som finns i olika bakteriearter" . J. Gen. Microbiol . 133 (11): 3129–34. doi : 10.1099/00221287-133-11-3129 . PMID 3446747 .
