Wahlund effekt

Ett De Finetti-diagram som illustrerar Wahlundeffekten. Den krökta linjen är Hardy–Weinbergs jämviktsgenotypfrekvenser ; punkterna 1 och 2 betecknar två populationer i jämvikt. Genotypfrekvenserna för den kombinerade populationen är ett viktat medelvärde av subpopulationsfrekvenserna, motsvarande en punkt någonstans på den heldragna linjen som förbinder 1 och 2. Denna punkt har alltid en lägre heterozygositet (y-värde) än motsvarande (i allelfrekvens p ) Hardy-Weinbergs jämvikt.

Inom populationsgenetik är Wahlund -effekten en minskning av heterozygositet (det vill säga när en organism har två olika alleler på ett lokus) i en population orsakad av subpopulationsstruktur. Nämligen, om två eller flera subpopulationer är i en Hardy–Weinberg-jämvikt men har olika allelfrekvenser , reduceras den totala heterozygositeten jämfört med om hela populationen var i jämvikt. De bakomliggande orsakerna till denna populationsindelning kan vara geografiska hinder för genflöde följt av genetisk drift i underpopulationerna.

Wahlundeffekten beskrevs första gången av den svenske genetikern Sten Wahlund 1928.

Enklaste exemplet

Antag att det finns en population $P$$p+q=1$ med allelfrekvenserna A och en given av $p$ respektive $q$ ( = ). Antag att denna population är uppdelad i två lika stora delpopulationer, $P_{1}$ och $P_{2}$ , och att alla A -alleler finns i subpopulation $P_{ 1}$ och alla a -alleler finns i subpopulation $P_{2}$ (detta kan inträffa på grund av drift). Sedan finns det inga heterozygoter, även om subpopulationerna är i en Hardy-Weinberg-jämvikt.

Fall av två alleler och två subpopulationer

För att göra en liten generalisering av exemplet ovan, låt $p_{1}$ och $p_{2}$ representera allelfrekvenserna för A i $P_{1}$ och $P_{2}$ respektive (och $q_{1}$ och $q_{2}$ representerar likaså a ).

Låt allelfrekvensen i varje population vara olika, dvs $p_{1}\neq p_{2}$ .

Antag att varje population befinner sig i en intern Hardy–Weinberg-jämvikt , så att genotypfrekvenserna AA , Aa och aa är p ² , 2 pq , respektive q ² för varje population.

Sedan ges heterozygositeten ( $H$ ) i den totala populationen som medelvärdet av de två:

${\begin{aligned }H&={2p_{1}q_{1}+2p_{2}q_{2} \over 2}\\[5pt]&={p_{1}q_{1}+p_{2}q_{2} }\\[5pt]&={p_{1}(1-p_{1})+p_{2}(1-p_{2})}\end{aligned}}$

som alltid är mindre än $2p(1-p)$ ( ${}=2pq$ ) om inte $p_{1}= p_{2}$

Generalisering

Wahlundeffekten kan generaliseras till olika subpopulationer av olika storlek. Heterozygositeten för den totala populationen ges sedan genom medelvärdet av subpopulationernas heterozygositet, viktat med subpopulationsstorleken.

F -statistik

Minskningen av heterozygositet kan mätas med F -statistik .

Se även

• Kryptisk släktskap