WAPAL

WAPL
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, FOE, KIAA0261, WAPAL, WAPL cohesin release factor
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Wings apart-like protein homolog ( WAPL ) är ett protein som hos människor kodas av WAPAL -genen . WAPL är en nyckelregulator av Cohesin -komplexet som förmedlar systerkromatidkohesion , homolog rekombination och DNA-looping . Kohesin bildas av SMC3 , SMC1 , RAD21 och antingen SA1 eller SA2 . Cohesin har ett ringliknande arrangemang och man tror att det associerar med kromosomen genom att fånga in den antingen som en slinga av DNA, en enkelsträng eller ett par systerkromosomer. WAPL bildar ett komplex med PDS5A eller PDS5B och frigör kohesin från DNA genom att öppna gränssnittet mellan SMC3 och RAD21.

Interfas

Struktur för PDS5B (blå), WAPL (grön) och IP6 (PDB 5HDT) (Ouyang et al., 2016)

Kohesinladdning börjar i telofas och förmedlas av NIPBL och dess bindande partner MAU2. I G1 bildar WAPL ett komplex med PDS5 och tar bort kohesin från DNA:t men det laddas om av NIPBL-MAU2. Jämvikten mellan laddning och frisättning ger cohesin en DNA-uppehållstid på 20 minuter. Under DNA-replikering acetyleras en del av kohesinet och binder till Sororin vilket gör det resistent mot WAPL och kan hålla ihop systerkromatider. Detta är avgörande för upprätthållandet av systerkromatidkohesionen eftersom när systerkromatiderna separeras kan kohesion inte återupprättas.

Prophase väg

När en cell går in i mitos, fosforyleras Sororin vilket gör att den dissocierar från kohesin vilket betyder att WAPL kan ta bort kohesin från DNA:t. Ett komplex av SGOL1 och PP2A defosforylerar kohesin vid centromeren som skyddar det från WAPL-medierad frisättning. Systerkromatidkohesion upprätthålls därför vid centromererna där den krävs för mitos men förloras på armarna. Detta avlägsnande av kohesin är känt som Prophase Pathway och resulterar i de X-formade systerkromatiderna som observeras i kromosomspridningar.

Mekanism

WAPL frisätter kohesin från DNA genom att öppna SMC3-RAD21-gränssnittet och låter DNA passera ut ur ringen. Öppnandet av detta gränssnitt regleras av ATP-bindning av SMC-subenheterna. Detta gör att ATPase-huvuddomänerna dimeriseras och deformerar den lindade spolen hos SMC3 och stör därför bindningen av RAD21 till den lindade spolen. Det är inte känt hur WAPL reglerar processen för ATP-bindning.